Name: nitropeptide profiling and identification illustrated by angiotensin ii
Uploaded: 2019-06-16T13:00:00
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이 작품은 미국 암 학회 기관 연구 보조금 IRG-14-195-01에 의해 지원되었다 (M. 샤론 스택은 주요 조사자입니다; X.L.은 하위 수급자입니다). 이 간행물은 그랜트 번호 KL2 TR002530 및 UL1 TR002529 (A. Shekhar, PI)의 국립 보건원, 국립 번역 과학 발전 센터, 임상 및 번역 과학 상에서 부분적인 지원으로 가능하게 되었습니다. X. L. 인디애나 CTSI KL2 젊은 구도자 상 수상자입니다. S. F.는 월터 암 재단이 기본 암 보조금을 진행하는 것을 지원하고 있습니다. X. W. 중국 일반 프로그램의 국립 자연 과학 재단에 의해 지원 됩니다 (그랜트 번호 817773047).

1. 안지오텐신 II의 순화
<ol><li>질산 펩티드를 생성하기 위해, 390 μL PBS 용액(10 mM NaH2PO 4, 150 mM NaCl,pH 7.4)에서 안지오텐신 II(DRVYIHPF) 모액(물 속에서 2 mM)의 10 μL을 50 μM의 최종 농도에서 희석시켰다.</li>
	<li>안지오텐신 II 용액에 10 μL의 페록시니트라이트(200 mM in 4.7% NaOH)를 첨가하여 5 mM의 최종 농도를 만듭니다. 참고 : 페록시니트라이트는 불안정하고 산성 형태일 때 쉽게 해결할 ...

<ol>
	<li>Radi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitric+oxide,+oxidants,+and+protein+tyrosine+nitration.">Nitric oxide, oxidants, and protein tyrosine nitration.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101, 4003-4008 (2004).</li><li>Radi, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+tyrosine+nitration:+biochemical+mechanisms+and+structural+basis+of+functional+effects.">Protein tyrosine nitration: biochemical mechanisms and structural basis of functional effects.</a> Accounts of Chemical Research. 46, 550-559 (2013).</li><li>Zhan, X., Desiderio, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MALDI-induced+fragmentation+of+leucine+enkephalin,+nitro-Tyr-leucine+enkaphalin,+and+d5-Phe-nitro-Tyr-leucine+enkephalin.">MALDI-induced fragmentation of leucine enkephalin, nitro-Tyr-leucine enkaphalin, and d5-Phe-nitro-Tyr-leucine enkephalin.</a> Int. J Mass Spectrometry. 287, 77-86 (2009).</li><li>Batthy&#225;ny, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tyrosine-Nitrated+Proteins:+Proteomic+and+Bioanalytical+Aspects.">Tyrosine-Nitrated Proteins: Proteomic and Bioanalytical Aspects.</a> Antioxidants &amp; Redox Signaling. 26, 313-328 (2017).</li><li>Feeney, M. B., Sch&#246;neich, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+approaches+to+analyze+protein+tyrosine+nitration.">Proteomic approaches to analyze protein tyrosine nitration.</a> Antioxidants &amp; Redox Signaling. 19, 1247-1256 (2013).</li><li>Zhan, X., Desiderio, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitroproteins+from+a+human+pituitary+adenoma+tissue+discovered+with+a+nitrotyrosine+affinity+column+and+tandem+mass+spectrometry.">Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry.</a> Analytical Biochemistry. 354, 279-289 (2006).</li><li>Zhan, X., Wang, X., Desiderio, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mass+spectrometry+analysis+of+nitrotyrosine-containing+proteins.">Mass spectrometry analysis of nitrotyrosine-containing proteins.</a> Mass Spectrometry Reviews. 34, 423-448 (2015).</li><li>Abello, N., Barroso, B., Kerstjens, H. A. M., Postma, D. S., Bischoff, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+labeling+and+enrichment+of+nitrotyrosine-containing+peptides.">Chemical labeling and enrichment of nitrotyrosine-containing peptides.</a> Talanta. 80, 1503-1512 (2010).</li><li>Chiappetta, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+identification+of+protein+nitration+sites.">Quantitative identification of protein nitration sites.</a> Proteomics. 9, 1524-1537 (2009).</li><li>Dekker, F., Abello, N., Wisastra, R., Bischoff, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Enrichment+and+detection+of+tyrosine-nitrated+proteins.">Enrichment and detection of tyrosine-nitrated proteins.</a> Current Protocols in Protein Science. , (2012).</li><li>Zhang, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+method+for+selective+enrichment+and+analysis+of+nitrotyrosine-containing+peptides+in+complex+proteome+samples.">A method for selective enrichment and analysis of nitrotyrosine-containing peptides in complex proteome samples.</a> Journal of Proteome Research. 6, 2257-2268 (2007).</li><li>Feng, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myeloid-derived+suppressor+cells+inhibit+T+cell+activation+through+nitrating+LCK+in+mouse+cancers.">Myeloid-derived suppressor cells inhibit T cell activation through nitrating LCK in mouse cancers.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 10094-10099 (2018).</li><li>Boersema, P. J., Raijmakers, R., Lemeer, S., Mohammed, S., Heck, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiplex+peptide+stable+isotope+dimethyl+labeling+for+quantitative+proteomics.">Multiplex peptide stable isotope dimethyl labeling for quantitative proteomics.</a> Nature Protocol. 4, 484-494 (2009).</li></ol>

여기서 프로토콜은 니트로펩티드 농축 및 프로파일링을 설명합니다. 안지오텐신 II를 모델 펩타이드로 사용하여 그림 1에표시된 절차를 설명했습니다. 니트로-안지오텐신 II를 얻은 후, 펩티드의 1차 아민은 프로토콜 내에서 가장 중요한 단계 중 하나인 추가적인 아민 컨쥬게이션을 피하기 위해 차단되어야 한다. 현재 프로토콜에서, 디메틸 라벨링은 두 가지 이유로 1차 아민...

단백질에 티로신 잔기의 질화 형성 3-니트로티로신 많은 생물학적 과정을 조절. 티로신과 3-니트로티로신 사이의 다른 화학적 특성으로 인해, 질산 단백질은 신호작용 활성 1,2를교란시킬 수 있다. 따라서 단백질에서 적화 부위를 효율적으로 풍부하게 하고 식별할 수 있는 방법을 개발하는 것이 중요합니다. 3-니트로티로신은 인산화 및 아세틸화와 같은 다른 형태의 PTM에 비해 단백질에 대한 풍부도가 낮기 때문에 세포주 또는 조직 샘플에서 직접 내인성 질산 부위를 식별하는 것은 어렵습니다. 그럼에도 불구하고, 니트로펩타이드의 단편화 패턴을 특성화하기 위해 질량 분석법(MS)을 사용하는 방법론(예: Zhan& Desiderio 3)이 개발되어 새로운 질소 변종 방법의 토대를 마련합니다.
현재, MS에 이어 농축 단계는 니트로 펩티드 프로파일링4,5에대한 가장 강력한 전략이다. 보강 방법은 두 클래스로 분류할 수 있습니다. 한 클래스는 3-니트로티로신을 구체적으로 인식할 수 있는 항체를 기반으로 하는 반면, 다른 클래스는 아민 군4,5로니트로기를 감소시키는 화학적 유도체에 기초한다. 항체 계법의 경우, 니트로티로신 친화열은 농축에 사용되며, 이로부터 용출된 물질이 고분해능 MS6,7에의해 더욱 해결되고 분석된다. 화학 적 유도 기반 방법의 경우, 펩티드 또는 리신의 N 말단에서 아민 그룹은 아세틸화, 상대 및 절대 정량에 대한 등화 태그 (iTRAQ) 또는 탠덤 질량 태그 (TMT) 시약에 의해 첫 번째 단계에서 차단되어야한다. 다음으로, 감속기는 바이오틴 결찰, 설피드릴 펩타이드 변환 또는 다른 유형의 태깅 시스템을 포함하는 새로 형성된 아민 그룹을 수정한 후 아미노티로신으로 니트로티로신을 감소시키기 위해 사용된다8,9, 10,11. 지금까지 확립된 대부분의 프로토콜은 내인성 질화 단백질 대신 체외 에서 과질화 된 단백질을 기반으로합니다.
본 연구에서, 니트로티로신의 화학적 유도의 변형된 절차는 니트로펩타이드 농축 및 식별을 위해 개발되었으며, 이는 MS 검출 동안 향상된 감도를 나타내고 정량화 목적으로 적합하다. 생물학적 시스템에서 이 방법을 채택한 당사의 최근 연구는 골수성 유래 억제세포(MDSCs)에서 생성된 RNS에 의한 Tyr394에서 림프구 특이적 단백질 티로신 키나아제(LCK)의 질질이 종양 미세환경의 면역억제(12). 따라서, 니트로펩티드 식별의 우리의 방법은 복잡한 생물학적 샘플에도 적용될 수 있습니다. 여기서, 우리는 단편화 패턴이 알려져 있고 니트로프로테오믹 연구에서 널리 사용되는 모델 펩티드 안지오텐신II를 사용하여 우리의 프로토콜을 설명한다 8,9,10,11,일례로.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:756px;" width="756">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20">Acclaim pepmap 100 C18 column</td>
			<td style="width:197px;">Thermo-Fisher</td>
			<td style="width:119px;">164534</td>
			<td style="width:195px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">1 M TEAB solution</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T7408</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">50% hydroxylamine</td>
			<td>Thermo-Fisher</td>
			<td>90115</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">Acetonitrile</td>
			<td>Thermo-Fisher</td>
			<td>A955</td>
			<td>MS Grade</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">dithiothreitol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>43819</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">formaldehyde</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F8775</td>
			<td>Molecular Biology Grade</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22">formaldehyde-D2</td>
			<td>Toronto Research Chemicals</td>
			<td>F691353</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22">formic acid</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>695076</td>
			<td>ACS reagent</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22">Fusion Lumos mass spectrometer</td>
			<td>Thermo</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">isoacetamide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>I1149</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">Methanol</td>
			<td>Thermo-Fisher</td>
			<td>A456</td>
			<td>MS Grade</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">NHS-S-S-bition</td>
			<td>Thermo-Fisher</td>
			<td>21441</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">Oasis HLB column (10 mg)</td>
			<td>Waters</td>
			<td>186000383</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">peroxynitrite</td>
			<td>Merck-Millipore</td>
			<td>516620</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">sodium cyanoborohydrite</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>42077</td>
			<td>PhamaGrade</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">sodium dithionate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>157953</td>
			<td>Technical Grade</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">Streptavidin Sepharose</td>
			<td>GE Healcare</td>
			<td>GE17-5113-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20">Ultimate 3000 nanoLC</td>
			<td>Thermo</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

nitropeptide profiling and identification illustrated by angiotensin ii

단백질 질산은 티로신 잔기에서 가장 중요한 번역 후 수정 (PTM) 중 하나이며 진핵 세포에서 반응성 산소 종 (ROS) 및 반응성 질소 종 (RNS)의 화학적 행동에 의해 유도 될 수 있습니다. 단백질에 질산 부위의 정확한 식별은 염증, 노화 및 암과 같은 단백질 질산과 관련된 생리적 및 병리학적 과정을 이해하는 데 매우 중요합니다. 질화 된 단백질은 유도 된 조건하에서도 세포에서 풍부하지 않으므로 단백질 질산 부위의 프로파일링 및 식별을위한 보편적이고 효율적인 방법이 개발되지 않았습니다. 여기에서 우리는 화학 환원 반응 및 비오틴 라벨링을 사용하여 니트로펩티드 농축을 위한 프로토콜을 설명하고, 그 다음에 고분해능 질량 분광법을 기술합니다. 우리의 방법에서, 니트로 펩티드 유도체는 높은 정확도로 식별 될 수있다. 우리의 방법은 이전에 보고 된 방법에 비해 두 가지 장점을 나타낸다. 첫째, 디메틸 라벨링은 니트로펩타이드의 1차 아민을 차단하는 데 사용되며, 이는 정량적 결과를 생성하는 데 사용될 수 있다. 둘째, NHS-비오틴 시약을 함유하는 이황화 결합이 농축에 사용되며, 이는 질량 분석기상 검출 신호를 향상시키기 위해 더욱 감소되고 알킬화될 수 있다. 이 프로토콜은 현재 논문에서 펩티드 안지오텐신 II 모델에 성공적으로 적용되었다.

이 원고의 니트로펩타이드 프로파일링에 대한 순서도는 그림1에 나와 있습니다. 도2, 도3, 4 및 5는 안지오텐신 II, 니트로-안지오텐신 II, 디메틸 표지된 니트로-안지오텐신 II 및 디메틸 표지된 아미노 안지오텐신 II의 질량 스펙트럼을 각각 보여준다. 화합물의 분자량은 각 도면에서 모노 동위원소 피크의 m/z 값에 ?...

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Nitropeptide Profiling and Identification Illustrated by Angiotensin II

안지오텐신 II에 의해 설명 니트로 펩티드 프로파일링 및 식별

티로신 질산 단백질의 프로테오믹 프로파일링은 3-니트로티로신 변형의 낮은 풍부성으로 인해 도전적인 기술이었습니다. 여기에서 우리는 모델로 안지오텐신 II를 사용하여 니트로 펩티드 농축 및 프로파일링에 대한 새로운 접근 방식을 설명합니다. 이 방법은 다른 시험관 내 또는 생체 내 시스템에 대해 확장될 수 있다.

Protein nitration is one of the most important post-translational modifications (PTM) on tyrosine residues and it can be induced by chemical actions of ...

화학적 접근법과 질량 분석법에 의해 니트로펩티드를 풍부하게 하고 식별하는 방법에 대한 주요 질문에 답하는 데 도움이 되는 이 메시지. 이 기술은 질량 분광법에 의해 니트로 펩티드를 검출하기위한 향상된 감도를 가지고 있으며 체외 생화학 시스템 및 내인성 생물학적 조직 모두에 적용 될 수 있습니다. 니트로-안지오텐신 II 탈염의 경우, 1밀리리터 파이펫을 사용하여 역상 고체 상 추출 또는 SPE 컬럼을 조건으로 하고 500마이크로리터의 메탄올과 500마이크로리터의 물을 컬럼 의 상단에 넣습니다.모든 물이 컬럼을 통과하면 니트로-안지오텐신 II 용액 410마이크로리터를 기둥에 적재합니다. 5%메탄올과 물 500마이크로리터, 80%의 메탄올과 물의 300마이크로리터로 컬럼을 세척하여 니트로펩티드를 엘로펩티드로 처리합니다. 그런 다음 실온에서 기본 설정에서 속도 진공으로 용액을 건조시킵니다.1차 아민 알킬링을 위해 100밀리머 트리에틸라모늄 중탄산염 용액의 100마이크로리터에 분말 니트로-앙지오텐신 II를 재구성하고, 짧은 혼합이 있는 연기 후드의 용액에 400마이크로리터를 첨가한다. 다음으로, 실온에서 1시간 동안 분당 400회전에서 흔들림을 가하는 용액에 0.6 개의 어금니 나트륨 시아노보로하이드라이드의 4마이크로리터를 추가합니다. 인큐베이션이 끝나면 실온에서 5분 동안 16마이크로리터의 16마이크로리터를 담금질한 다음 포믹산 8마이크로리터로 산성화를 한다.그런 다음 방금 설명한 대로 새로운 역상 SPE 컬럼에서 솔루션을 탈염합니다. 아미노티로신 감소에 니트로티로신을 위해, PBS의 500 마이크로 리터에서 디메틸 라벨 니트로 앙지오텐신 II를 재구성하고 실온에서 1 시간 동안 1 0 개의 어금니 나트륨 디티오나테의 마이크로 리터를 추가하십시오. 감소 반응 후, 노란색 용액이 명확해질 것입니다.입증된 바와 같이 새로운 역상 SPE 컬럼에서 감소된 샘플을 탈염합니다. 바이오타이니션 및 농축을 위해 PBS 의 500 마이크로리터에서 디메틸 라벨이 부착된 아미노안지오텐신 II를 재구성한 다음, 실온에서 2시간 동안 디메틸 설프옥사이드에 용해된 40나노몰러 NHS-S-S 비오틴 5마이크로리터를 첨가한다. 인큐베이션의 끝에서, 5%의 하이드록실라민의 1개의 마이크로리터로 반응을 담금질하고 3개의 분리된 원심분리에 의하여 평형을 위한 스트렙타비딘 아가로즈 구슬의 100마이크로리터에 신선한 PBS의 500 마이크로리터를 추가합니다.마지막 원심분리 후, 실온에서 로타리 셰이커에 1시간 동안 반응 시스템에 100마이크로리터의 구슬을 넣습니다. 인큐베이션이 끝나면 세척당 500마이크로리터의 신선한 PBS로 시스템을 4회 세척한 다음 10밀리머 디티오트레이톨400마이크로리터를 섭씨 50도에서 45분간 배양합니다. 인큐베이션이 끝나면 기둥을 회전시키고 상체를 0.5 개의 어금니 오도아세타미드20 마이크로리터가 들어있는 새로운 튜브로 옮겨 어둠 속에서 20 분 동안 배양하십시오.그런 다음 새로운 역상 SPE 컬럼에서 용액을 탈염시키고 0.1%의 마이크로리터에서 건조 펩티드를 해결한다. 검출을 위해 탠덤 질량 분광계를 사용하여 액체 크로마토그래퍼에 제품을 적재합니다. 고해상도 질량 분광계와 직접 인터페이스되는 나노 고압 액체 크로마토그래피 시스템과 분당 0.3 마이크로리터의 유속도로 60분 그라데이션 용출으로 수정된 안지오텐신 II 펩티드를 분리한다.데이터 종속 획득 모드에서는 질량 분광계에 단일 전체 스캔 질량 스펙트럼을 설정하고 20개의 데이터 의존성 탠덤 질량 분광계 스캔을 28% 정규화된 충돌 에너지로 설정합니다. 그런 다음 질량 스펙트럼 데이터를 열고 화학 반응이 성공적으로 수행되었는지 확인하기 위해 각 단계에서 제품의 피크를 식별합니다. 여기서, 입증된 바와 같이 각 화학적 수정 전후안지오텐신 II의 대표적인 질량 스펙트럼이 관찰될 수 있다.화합물의 분자량은 단동원위원 봉우리의 질량 대 전하 비율 값에 의해 표시되며, 안지오텐신 II에 대한 화학적 변형이 성공적으로 달성되었음을 나타낸다. 여기서, 최종 생성물은 탠덤 질량 분석법을 가진 액체 크로마토그래피를 검출하고 특징으로 하는 것으로 나타났다. 디메틸 라벨링에 의한 니트로펩티드의 정량적 분석은 각 군에서 단동원 피크의 강도를 비교하여 상대적으로 가볍고 무거운 양의 빛을 계산할 수 있게 해주며, 다른 군으로부터 농축된 니트로펩티드의 정량화를 허용한다.절차에 따라 PFIND의 SEQUEST 최대 수와 같은 프로그램 검색 엔진을 사용하여 잠재적인 니트로펩티드를 식별할 수 있습니다. 개발 후, 이 기술은 특정 nitration 사이트의 생물학적 기능의 시작을위한 길을 열었다.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Identification of Small Molecule-binding Proteins in a Native Cellular Environment by Live-cell Photoaffinity Labeling

라이브 셀 Photoaffinity 라벨에 의해 기본 셀룰러 환경에서 작은 분자 결합 단백질의 식별

Identifying the molecular target(s) of small molecules is a challenging but necessary step towards understanding their mechanism of action. While several ...

연구

생화학

Resolving Affinity Purified Protein Complexes by Blue Native PAGE and Protein Correlation Profiling

블루 기본 페이지와 단백질 상관 관계 프로파일 링에 의한 선호도 정제 단백질 복합체 해결

Most proteins act in association with others; hence, it is crucial to characterize these functional units in order to fully understand biological ...

Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

깊은 프로테옴 Isobaric 라벨, 광범위 한 액체 크로마토그래피, 질량 분석 및 소프트웨어 기반 정량화 하 여 프로 파일링

Many exceptional advances have been made in mass spectrometry (MS)-based proteomics, with particular technical progress in liquid chromatography (LC) ...

Genome-wide Quantification of Translation in Budding Yeast by Ribosome Profiling

리보솜을 프로 파일링 하 여 신진 효 모에 번역의 게놈 넓은 정량화

Translation of mRNA into proteins is a complex process involving several layers of regulation. It is often assumed that changes in mRNA transcription ...

Polysome Profiling in Leishmania, Human Cells and Mouse Testis

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Polysome Leishmania, 인간 세포 및 마우스 고환에서 프로 파일링

Proper protein expression at the right time and in the right amounts is the basis of normal cell function and survival in a fast-changing environment. For ...

Identification of Cyclin-dependent Kinase 1 Specific Phosphorylation Sites by an In Vitro Kinase Assay

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 종속 키 1의 시험관에서 키에 의해 인 산화 특정 사이트 분석 결과

Cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1) is a master controller for the cell cycle in all eukaryotes and phosphorylates an estimated 8 - 13% of the proteome; ...

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면역페록시다아제 및 면역형광방법을 이용한 성인용 제브라피시의 오렉스신 및 엔도칸나비노이드 수용체 식별

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고처리량 프리마제 프로파일링을 사용하여 DNA 프리마제에 의한 DNA 서열 인식

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High-Resolution Complexome Profiling by Cryoslicing BN-MS Analysis

BN-MS 분석에 의한 고분해능 컴플렉스 프로파일링

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