Name: analysis of combinatorial mirna treatments to regulate cell cycle and angiogenesis
Uploaded: 2019-03-30T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis at JoVE.com

אין ניגודי עניינים מוצהרים.

1. תרביות תאים מיר-143 ו miR-506
התראה: השתמש כפפות גומי, מגן משקפיים, מעיל מעבדה בעת ביצוע הניסויים המתוארים. במידת הצורך, השתמש הקבינט אבטחה עם המאוורר הקבינט על, מבלי לחסום את דרכי הנשימה או להפריע את זרימת האוויר למינריות. תמיד להגדיר חלון זכוכית שיגן על הגובה המתאים, כפי שתואר ע?...

<ol>
	<li>Schafer, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cell+cycle:+a+review.">The cell cycle: a review.</a> Veternary Pathology. 35 (6), 461-478 (1998).</li><li>Barnum, K. J., O'Connell, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+cycle+regulation+by+checkpoints.">Cell cycle regulation by checkpoints.</a> Methods in Molecular Biology. 1170, 29-40 (2014).</li><li>Malumbres, M., Barbacid, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+cycle,+CDKs+and+cancer:+a+changing+paradigm.">Cell cycle, CDKs and cancer: a changing paradigm.</a> Nature Reviews Cancer. 9 (3), 153-166 (2009).</li><li>Chen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiple+CDK+inhibitor+dinaciclib+suppresses+neuroblastoma+growth+via+inhibiting+CDK2+and+CDK9+activity.">Multiple CDK inhibitor dinaciclib suppresses neuroblastoma growth via inhibiting CDK2 and CDK9 activity.</a> Science Repository. 6, 29090 (2016).</li><li>Brown, N. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CDK1+structures+reveal+conserved+and+unique+features+of+the+essential+cell+cycle+CDK.">CDK1 structures reveal conserved and unique features of the essential cell cycle CDK.</a> Nature Communications. 6, 6769 (2015).</li><li>Sanchez-Martinez, C., Gelbert, L. M., Lallena, M. J., de Dios, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclin+dependent+kinase+(CDK)+inhibitors+as+anticancer+drugs.">Cyclin dependent kinase (CDK) inhibitors as anticancer drugs.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 25 (17), 3420-3435 (2015).</li><li>Shah, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FDA+Approval:+Ribociclib+for+the+Treatment+of+Postmenopausal+Women+with+Hormone+Receptor-Positive,+HER2-Negative+Advanced+or+Metastatic+Breast+Cancer.">FDA Approval: Ribociclib for the Treatment of Postmenopausal Women with Hormone Receptor-Positive, HER2-Negative Advanced or Metastatic Breast Cancer.</a> Clinical Cancer Research. , (2018).</li><li>Asghar, U., Witkiewicz, A. K., Turner, N. C., Knudsen, E. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+history+and+future+of+targeting+cyclin-dependent+kinases+in+cancer+therapy.">The history and future of targeting cyclin-dependent kinases in cancer therapy.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 14 (2), 130-146 (2015).</li><li>Mullard, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FDA+approves+Novartis's+CDK4/6+inhibitor.">FDA approves Novartis's CDK4/6 inhibitor.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 16 (4), 229 (2017).</li><li>Walker, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FDA+Approval+of+Palbociclib+in+Combination+with+Fulvestrant+for+the+Treatment+of+Hormone+Receptor-Positive,+HER2-Negative+Metastatic+Breast+Cancer.">FDA Approval of Palbociclib in Combination with Fulvestrant for the Treatment of Hormone Receptor-Positive, HER2-Negative Metastatic Breast Cancer.</a> Clinical Cancer Research. 22 (20), 4968-4972 (2016).</li><li>Hossian, A., Sajib, M. S., Tullar, P. E., Mikelis, C. M., Mattheolabakis, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multipronged+activity+of+combinatorial+miR-143+and+miR-506+inhibits+Lung+Cancer+cell+cycle+progression+and+angiogenesis+in+vitro.">Multipronged activity of combinatorial miR-143 and miR-506 inhibits Lung Cancer cell cycle progression and angiogenesis in vitro.</a> Science Repository. 8 (1), 10495 (2018).</li><li>Inamura, K., Ishikawa, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MicroRNA+In+Lung+Cancer:+Novel+Biomarkers+and+Potential+Tools+for+Treatment.">MicroRNA In Lung Cancer: Novel Biomarkers and Potential Tools for Treatment.</a> Journal of Clinical Medicine. 5 (3), (2016).</li><li>Mizuno, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+microRNA+expression+signature+of+small+cell+lung+cancer:+tumor+suppressors+of+miR-27a-5p+and+miR-34b-3p+and+their+targeted+oncogenes.">The microRNA expression signature of small cell lung cancer: tumor suppressors of miR-27a-5p and miR-34b-3p and their targeted oncogenes.</a> Journal of Human Genetics. 62 (7), 671-678 (2017).</li><li>Zhang, B., Pan, X., Cobb, G. P., Anderson, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=microRNAs+as+oncogenes+and+tumor+suppressors.">microRNAs as oncogenes and tumor suppressors.</a> Developmental Biology. 302 (1), 1-12 (2007).</li><li>Peng, Y., Croce, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+MicroRNAs+in+human+cancer.">The role of MicroRNAs in human cancer.</a> Signal Transduction and Targeted Therapy. 1, 15004 (2016).</li><li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prediction+of+recurrence+in+early+stage+non-small+cell+lung+cancer+using+computer+extracted+nuclear+features+from+digital+H&amp;E+images.">Prediction of recurrence in early stage non-small cell lung cancer using computer extracted nuclear features from digital H&amp;E images.</a> Science Repository. 7 (1), 13543 (2017).</li><li>Siegel, R. L., Miller, K. D., Jemal, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Cancer Statistics, 2017. CA: A Cancer Journal for Clinicians. 67 (1), 7-30 (2017).</li><li>Saxon, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=p52+expression+enhances+lung+cancer+progression.">p52 expression enhances lung cancer progression.</a> Science Repository. 8 (1), 6078 (2018).</li><li>Carpentier, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Angiogenesis+Analyzer+for+ImageJ.">Angiogenesis Analyzer for ImageJ.</a> ImageJ User and Developer Conference. , (2012).</li><li>Robinson, M. D., McCarthy, D. J., Smyth, G. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=edgeR:+a+Bioconductor+package+for+differential+expression+analysis+of+digital+gene+expression+data.">edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data.</a> Bioinformatics. 26 (1), 139-140 (2010).</li><li>Robinson, M. D., Oshlack, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+scaling+normalization+method+for+differential+expression+analysis+of+RNA-seq+data.">A scaling normalization method for differential expression analysis of RNA-seq data.</a> Genome Biology. 11 (3), R25 (2010).</li><li>DeCicco-Skinner, K. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endothelial+cell+tube+formation+assay+for+the+in+vitro+study+of+angiogenesis.">Endothelial cell tube formation assay for the in vitro study of angiogenesis.</a> Journal of Visualized Experiments. (91), e51312 (2014).</li><li>Kong, D. H., Kim, M. R., Jang, J. H., Na, H. J., Lee, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Review+of+Anti-Angiogenic+Targets+for+Monoclonal+Antibody+Cancer+Therapy.">A Review of Anti-Angiogenic Targets for Monoclonal Antibody Cancer Therapy.</a> International Journal of Molecular Science. 18 (8), (2017).</li><li>Wong, P. P., Bodrug, N., Hodivala-Dilke, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exploring+Novel+Methods+for+Modulating+Tumor+Blood+Vessels+in+Cancer+Treatment.">Exploring Novel Methods for Modulating Tumor Blood Vessels in Cancer Treatment.</a> Current Biology. 26 (21), R1161-R1166 (2016).</li><li>Evan, G. I., Brown, L., Whyte, M., Harrington, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apoptosis+and+the+cell+cycle.">Apoptosis and the cell cycle.</a> Current Opinion in Cell Biology. 7 (6), 825-834 (1995).</li><li>Haab, B. B., Dunham, M. J., Brown, P. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+microarrays+for+highly+parallel+detection+and+quantitation+of+specific+proteins+and+antibodies+in+complex+solutions.">Protein microarrays for highly parallel detection and quantitation of specific proteins and antibodies in complex solutions.</a> Genome Biology. 2 (2), RESEARCH0004 (2001).</li><li>Sutandy, F. X., Qian, J., Chen, C. S., Zhu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Overview+of+protein+microarrays.">Overview of protein microarrays.</a> Currrent Protocols in Protein Science. 27, 21 (2013).</li><li>St-Pierre, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transcriptome+sequencing+of+neonatal+thymic+epithelial+cells.">Transcriptome sequencing of neonatal thymic epithelial cells.</a> Science Repository. 3, 1860 (2013).</li></ol>

miRNAs יכול לפעול טיפולים ממוקדים לטיפול בסרטן, לזהות את dysregulation של רמות ביטוי נגועים לעומת רקמות רגילה. מחקר זה שמטרתה לקבוע miRNAs זה פוטנציאל לעצור את מחזור התא התקדמות בשלבים מרובים. זה זוהה 143-מיר ומיר-506 לעצור את מחזור התא של תאים סרטניים, ואת הפרוטוקולים הציג שמטרתם להבין את הפעילות של טיפו?...

An erratum was issued for:&#160;<a href="https://www.jove.com/video/59460/analysis-combinatorial-mirna-treatments-to-regulate-cell-cycle">Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis</a>.&#160; An author name was updated.
One of the authors&#39; names was corrected from:
George Matthaiolampakis
to:
George Mattheolabakis

An erratum was issued for: <a href="https://www.jove.com/video/59460/analysis-combinatorial-mirna-treatments-to-regulate-cell-cycle">Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis</a>.&#160; An author name was updated.

Erratum: Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis

מחזור התא הוא שילוב של מספר אירועים רגולטוריות לאפשר כפילות של התפשטות ה-DNA של תאים דרך תהליך mitotic1. תלויי-cyclin kinases (CDKs) להסדיר ולקדם את מחזור התא2. ביניהם, mitotic CDK (CDK1) CDKs לאטמוספרה (CDK2, CDK4 ו CDK6) יש תפקיד מרכזי מחזור התא התקדמות3. חלבון רטינובלסטומה (Rb) הוא phosphorylated על ידי CDK4/CDK6 מורכבים כדי לאפשר התקדמות מחזור התא4, CDK1 הפעלה הוא חיוני עבור חלוקת התא מוצלחת5. יש רבים CDK מעכבי פותחה, הערכה בניסויים קליניים לאורך העשורים האחרונים, המציין את הפוטנציאל של פילוח CDKs בטיפול בסרטן. למעשה, שלושה מעכבי CDK אושרו לטיפול בסרטן השד לאחרונה6,7,8,9,10. לפיכך, CDKs, בפרט, CDK1 ו- CDK4/6, הם עניין רב בוויסות התקדמות תאי הסרטן.
miRNAs (מירס) הם קטנים, ללא קידוד RNAs הרגולטורים post-transcriptional של ביטוי גנים, ויסות כ-30% גנים אנושיים כל11. הפעילות שלהם מבוסס על הדחקה translational או השפלה של RNAs שליח (mRNAs)12. המחשה חשיבות הביולוגי שלהם, יותר מ-5,000 miRNAs זוהו, מולקולה בודדת miRNA ניתן לווסת גנים מרובים11,13. חשוב מכך, miRNA הביטוי נמצא קשור מחלות שונות ומצבים המחלה, כולל סרטן13. למעשה, miRNAs כבר שאפיינו גם oncogenic או מדכאי הגידול, להיות מסוגל לקדם או לדכא גידול פיתוח והתקדמות14,15. הביטוי יחסי תפקיד miRNAs בהתפתחות לרקמות החולות של יכול לווסת את התקדמות המחלה; לפיכך, משלוח אקסוגני של miRNAs יש הפוטנציאל הטיפולי.
סרטן הריאות הוא הגורם המוביל של מקרי מוות מסרטן, גדול יותר מאשר 60% של כל ממאירות ריאות שאינם קטנים התא ריאות סרטן16,17, עם שיעור הישרדות 5 שנים של פחות מ-20%18. השימוש של מיר-143-3 p ומיר-506-3 p הוערך לאחרונה הכוונת את מחזורי תאים תאים של סרטן ריאות11. 143-מיר ומיר-506 יש רצפי כי הם משלימים את החסר CDK1, CDK4/CDK6, ההשפעות של מירס שני אלה על תאים A549 נותחו. הפרטים ניסיוניים שהוצגו, המתוארים במסמך זה. ביטוי גנים, התקדמות מחזור התא, אפופטוזיס הוערכו באמצעות עיצובים מוטוריים שונים ו- timepoints בעקבות תרביות תאים. השתמשנו בשיטות PCR (RT-qPCR) כמותית בזמן אמת יחד עם ניתוח microarray למדוד ביטוי גנים ספציפיים, הדור הבא רצפי RNA שימשו לקביעת הכללית ג'ין dysregulation11. השיטה השנייה מזהה שפע יחסי התעתיק של ג'ין כל עם רגישות גבוהה, הפארמצבטית, בעוד אלפי גנים ניתן לנתח מתוך ניתוח ניסיוני יחיד. בנוסף, ניתוח אפופטוטיים להיפגע עקב טיפול miRNA בוצעה, מתואר כאן. ביואינפורמטיקה מצורפים ניתוח מסלול. המוצג כאן הפרוטוקולים משמשים לניתוח של טיפולית פוטנציאל של 143-מיר קומבינטורית, מיר-506.
המטרה העיקרית של פרוטוקול זה הוא לזהות את ההשפעות של miRNAs בתאים, עם דגש על מחזור התא. מגוון רחב של טכניקות המובאת כאן span החל מפענוח הביטוי מראש (באמצעות qPCR) לפרט ותרגום הרומן טכניקות מפענוח ברמת חלבון, כגון ניתוח microarray. יש לקוות כי דו ח זה שימושי עבור חוקרים מעונינת לעבוד עם miRNAs. בנוסף, מוצגת מתודולוגיה ניתוח תזרים cytometric של מחזור התא, אפופטוזיס של תאים.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:2067px;" width="2066">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">-80 &#176;C Freezer</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td style="width:1167px;">VWR40086A</td>
			<td style="width:172px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">96 well plate</td>
			<td style="width:210px;">CELLTREAT Scientific&#160;</td>
			<td style="width:1167px;">50-607-511</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">96-well Microwell Plates&#160;&#160;</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">12-556-008</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">A549 Non Small Cell Lung Cancer Cells</td>
			<td style="width:210px;">ATCC</td>
			<td style="width:1167px;">ATCC&#160;CCL-185</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Agarose</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td style="width:1167px;">0710-25G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Agilent 2100 Bioanalyzer</td>
			<td style="width:210px;">Agilent Technologies</td>
			<td style="width:1167px;">G2938c</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ambion Silencer Negative Control No. 1 siRNA</td>
			<td style="width:210px;">Ambion</td>
			<td>AM4611</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Antibiotic-Antimycotic Solution (100x)</td>
			<td style="width:210px;">Gibco</td>
			<td style="width:1167px;">15240-062&#160;&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Antibody Array Assay Kit, 2 Reactions</td>
			<td style="width:210px;">Full Moon Bio</td>
			<td style="width:1167px;">KAS02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Bright field microscope&#160;&#160;</td>
			<td style="width:210px;">Microscoptics&#160;</td>
			<td style="width:1167px;">IV-900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Bright field microscope&#160;&#160;</td>
			<td style="width:210px;">New Star Environment LLC</td>
			<td style="width:1167px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Cell Cycle Antibody Array, 2 Slides</td>
			<td style="width:210px;">Full Moon Bio</td>
			<td style="width:1167px;">ACC058</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Cell Logic+ Biosafety Cabinate</td>
			<td style="width:210px;">Labconco</td>
			<td style="width:1167px;">342391100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Cellquest Pro</td>
			<td style="width:210px;">BD bioscience</td>
			<td style="width:1167px;">Steps 5.14; 6.13: Used for calculating the population distrubution according to the cell cycle&#160; phase and for&#160; calculating the population distribution for the analysis of apoptosis&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">CFX96 Real Time System</td>
			<td style="width:210px;">BioRad</td>
			<td style="width:1167px;">CFX96 Optics Module</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Chemidoc Touch Imaging System</td>
			<td style="width:210px;">BioRad</td>
			<td style="width:1167px;">Chemidoc Touch Imaging System</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">CO2 Incubator</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">HERAcell 150i</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Cultrex Reduced Growth Factor Basement Membrane Matrix</td>
			<td style="width:210px;">Trevigen</td>
			<td style="width:1167px;">3433-010-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Digital Camera</td>
			<td style="width:210px;">AmScope&#160;</td>
			<td style="width:1167px;">FMA050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DMEM 4.5 g/L Glucose, w/out Sodium Pyruvate, w/ L-Glutamine</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td>VWRL0100-0500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">DNAse I</td>
			<td>Zymo Research</td>
			<td>E1010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Endothelial Cell Growth Supplement (ECGS)</td>
			<td style="width:210px;">BD Biosciences</td>
			<td style="width:1167px;">356006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Eppendorf Pipette Pick-A-Pack Sets</td>
			<td style="width:210px;">Eppendrof</td>
			<td style="width:1167px;">05-403-152</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ethanol, Absolute (200 Proof), Molecular Biology Grade,&#160;</td>
			<td style="width:210px;">Fisher BioReagents</td>
			<td>BP2818500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Ethidium bromide</td>
			<td style="width:210px;">Alfa acar</td>
			<td style="width:1167px;">L07462</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">F-12K Nutrient Mixture (Kaighn&#39;s Mod.) with L-glutamine, Corning</td>
			<td style="width:210px;">Corning</td>
			<td>45000-354</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">FACS Calibur Flowcytometer</td>
			<td style="width:210px;">Becton Dickinson</td>
			<td style="width:1167px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fetal Bovine Serum - Premium</td>
			<td>Antlanta Biologicals</td>
			<td>S11150</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Fetal Bovine Serum (FBS)</td>
			<td style="width:210px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">10438026</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fisherbrand Basix Microcentrifuge Tubes with Standard Snap Caps</td>
			<td style="width:210px;">Fisherbrand Basix</td>
			<td style="width:1167px;">02-682-002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Forma Series II water Jacket CO2 incubator</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Heparin Solution (5000 U/mL)</td>
			<td style="width:210px;">Hospira</td>
			<td style="width:1167px;">NDC#63739-920-11</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Horixontal Electrophoresis system</td>
			<td style="width:210px;">Benchtop lab system</td>
			<td style="width:1167px;">BT102</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">hsa-miR-143-3p miRNA Mimic</td>
			<td style="width:210px;">ABM</td>
			<td>MCH01315</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">hsa-miR-506-3p miRNA Mimic</td>
			<td style="width:210px;">ABM</td>
			<td>MCH02824</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Human Recombinant Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF)</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">PHC9394&#160;&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Human Umbilical Vein Endothelial Cells (HUVEC)</td>
			<td style="width:210px;">Individual donors</td>
			<td style="width:1167px;">IRB# A15-3891</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">HyClone Phosphate Buffered Saline (PBS)</td>
			<td style="width:210px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">SH30256FS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Ingenuity Pathway Analysis</td>
			<td style="width:210px;">Qiagen</td>
			<td style="width:1167px;">Results: Used for bioinformatics pathway analysis</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Invitrogen UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water</td>
			<td style="width:210px;">Invitrogen</td>
			<td>10-977-015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Lipofectamine 2000&#160;</td>
			<td style="width:210px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:1167px;">11-668-027</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Loading dye 10X</td>
			<td style="width:210px;">ward&#39;s science+</td>
			<td style="width:1167px;">470024-814</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Medium M199 (with Earle&#8242;s salts, L-glutamine and sodium bicarbonate)</td>
			<td style="width:210px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:1167px;">M4530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Microscope Digital Camera</td>
			<td style="width:210px;">AmScope&#160;</td>
			<td style="width:1167px;">MU130</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Modfit LT</td>
			<td style="width:210px;">Verity Software</td>
			<td style="width:1167px;">Step 5.15: Alternative software for analysis of cell cycle population distributions</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Nanodrop</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">NanoDrop one C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Opti-MEM</td>
			<td style="width:210px;">Gibco by life technologies</td>
			<td>31985-070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Penicillin-streptomycin 10/10</td>
			<td>Antlanta Biologicals</td>
			<td>B21210</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Power UP sybr green master mix</td>
			<td style="width:210px;">Applied Biosystems</td>
			<td>A25780</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Propidium Iodide</td>
			<td style="width:210px;">MP Biochemicals LLC</td>
			<td>IC19545825</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Proscanarray HT Microarray scanner</td>
			<td style="width:210px;">Perkin elmer</td>
			<td style="width:1167px;">ASCNPHRG. We used excitation laser wavelength at 543 nm.</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">q PCR optical adhesive cover</td>
			<td style="width:210px;">Applied Biosystems</td>
			<td style="width:1167px;">4360954</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Quick-RNA Kits</td>
			<td>Zymo Research</td>
			<td>R1055</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ribonuclease A from Bovine pancreas</td>
			<td style="width:210px;">Sigma</td>
			<td>R6513-50MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">ScanArray Express</td>
			<td>PerkinElmer</td>
			<td style="width:1167px;">Step 7.33: Microarray analysis software</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Shaker</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">2314</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">SimpliAmp Thermal Cycler</td>
			<td style="width:210px;">Applied Biosystems</td>
			<td style="width:1167px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">SpectraTube Centrifuge Tubes 15ml</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td style="width:1167px;">470224-998</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">SpectraTube Centrifuge Tubes 50ml</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td style="width:1167px;">470225-004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">TBS Buffer, 20x liquid</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td>10791-796</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Temperature controlled&#160; centrifuge matchine</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">ST16R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Temperature controlled micro centrifuge matchine</td>
			<td style="width:210px;">Eppendrof</td>
			<td style="width:1167px;">5415R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Thermo Scientific BioLite Cell Culture Treated Flasks</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>12-556-009</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Thermo Scientific Pierce BCA Protein Assay</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">PI23225</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Thermo Scientific Pierce RIPA Buffer</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td>PI89900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Thermo Scientific Thermo-Fast 96-Well Full-Skirted Plates</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:1167px;">AB0800WL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Thermo Scientific Verso cDNA synthesis Kit (100 runs)</td>
			<td style="width:210px;">Thermo Scientific</td>
			<td>AB1453B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">Ultra Low Range DNA Ladder</td>
			<td style="width:210px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:1167px;">10597012</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:519px;">VWR standard solid door laboratory refrigerator</td>
			<td style="width:210px;">VWR</td>
			<td style="width:1167px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

analysis of combinatorial mirna treatments to regulate cell cycle and angiogenesis

סרטן הריאות (LC) הוא הגורם המוביל למוות מסרטן ברחבי העולם. בדומה לתאים אחרים סרטן, מאפיין מהותי של תאים LC היא התפשטות ללא פיקוח חלוקת התא. עיכוב של התפשטות בעת עצירת התקדמות מחזור התא הוכח להיות גישה מבטיחה לטיפול בסרטן, כולל LC.
miRNA הרפוי הופיעו כמבקרי ג'ין post-transcriptional חשוב, הם יותר ויותר נחקר לשימוש בטיפול בסרטן. העבודה האחרונה, אנחנו מנוצל miRNAs שני, 143-מיר ומיר-506, כדי לווסת את התקדמות מחזור התא. תאים סרטניים (NSCLC) ריאות שאינם קטנים התא A549 היו transfected שינויים בביטוי הגנים נותחו, פעילות אפופטוטיים להיפגע עקב הטיפול ניתחנו את סוף סוף. Downregulation של kinases תלויי-cyclin (CDKs) אותרו (קרי, CDK1, CDK4 ו CDK6), והפסיקה מחזור התא על המעברים שלב G1/S ו G2/M. ניתוח מסלול הצביעו על פעילות אנטי-אנגיוגנטי פוטנציאלי של הטיפול, אשר מעניק את הגישה עם רבת פעילות. המתוארים להלן למתודולוגיות המשמש לזיהוי פעילות miRNA בדבר עיכוב מחזור התא, אינדוקציה של אפופטוזיס, ואת ההשפעות של טיפול בתאי אנדותל על ידי עיכוב של אנגיוגנזה. יש לקוות כי השיטות המובאות כאן יתמוך למחקר עתידי על miRNA הרפוי ובפעילות המתאים, כי נציג הנתונים ינחה חוקרים אחרים במהלך ניתוח ניסיוני.

ניתוח ביטוי גנטי באמצעות RT-qPCR וג'ל אלקטרופורזה
ניתוח ביטוי גנטי דיפרנציאלי באמצעות RT-qPCR הפגינו משמעותית downregulation של גנים יישוב CDK1, CDK4 ו- CDK6. CDK1 ו- CDK4/6 הראו להם להיות אינסטרומנטלי G2/M ומעברים G1/S, בהתאמה. בביצוע ניתוח מותר השוואה ישירה...

Watch this Scientific Journal Video about Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis at JoVE.com

Analysis of Combinatorial miRNA Treatments to Regulate Cell Cycle and Angiogenesis

miRNA הרפוי יש פוטנציאל משמעותי בוויסות התקדמות סרטן. המודגמות כאן גישות אנליטיות משמשים לצורך זיהוי הפעילות של טיפול miRNA קומבינטורית להפסקת מחזור התא, אנגיוגנזה.

ניתוח של miRNA קומבינטורית טיפולים כדי להסדיר מחזור התא, אנגיוגנזה

Lung cancer (LC) is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. Similar to other cancer cells, a fundamental characteristic of LC cells is ...

שיטה זו תסייע להבין ולבצע טכניקות מעבדה הדרושות כדי לזהות את הפעילות של שני microRNA בתאי סרטן ריאות במבחנה. סרטן ריאות הוא הגורם המוביל למוות מסרטן ברחבי העולם. כאן, אנו מציגים טכניקות המשתרעות ממתודולוגיות מעבדה בסיסיות לפרוטוקולים מורכבים יותר, כגון ניתוח ביטוי גנים ומיקרו-רנ"א של חלבון נוגדנים, המשמשות במיוחד לזיהוי ההשפעה של פעולות microRNA.השיטות הבאות יעזרו לנו לענות על שאלות מפתח לגבי ההשפעה של שני microRNAs, microRNA 143 ו microRNA 506, על ויסות מחזור התא בתאי סרטן ריאות. אנו מציגים טכניקות מעבדה שונות, כמו transfection תאים, מיצוי RNA, PCR בזמן אמת כמותי וניתוח microRNA. אנו מקווים שהמצגת שלנו תתרום להשלמת ניתוחים אלה בהצלחה.ראשית, מושב התאים המתורבתים בבקבוק המתאים מספיק עבור RNA והפקת חלבון, כדי לבצע ביטוי גנים באמצעות ניתוח qPCR או מיקרו מערך. ואז לדגר לילה עם מדיה בתוספת 10 אחוז FBS ו 1 אחוז פניצילין סטרפטומיצין. למחרת, להכין את מדגם microRNA עבור transfection על ידי דילול microRNA 143 ו microRNA 506 במדיה בריכוז של 100 nanomolar כל אחד.מוציאים את הבקבוק מהאספה ומסירים את התקשורת. לשטוף עם 1x PBS. כל הפקדים שאינם מטופלים יכילו רק מדיה לא שלמה עם תאים.להחגירה את התאים עם מדיה transfection במשך שש שעות באינקובטור. לאחר שש שעות, להסיר את התקשורת ולהחליף עם ארבעה מיליליטר של מדיה טרייה, מלאה. לקצור את התאים לאחר 24 שעות ו 48 שעות על ידי טריפסיניזציה.לאחר מכן, לשטוף פעמיים עם 1x PBS בכל צינור ולהסיר על טבעי. על מנת לבצע מיצוי RNA במועד מאוחר יותר, להקפיא את התאים במינוס 80 מעלות צלזיוס. מיצוי RNA בוצע באמצעות ערכת RNA, בהתאם להוראות היצרן.ראשית, להסיר את הצינורות ממינוס 80 מעלות צלזיוס ולאפשר להפשיר. הוסף 300 מיקרוליטרים של מאגר תיזה ופיגט למעלה ולמטה כדי לשבור את קרום התא. הוסף נפח שווה של 100 אחוז אתנול טהור במיוחד.לאחר מכן מערבבים היטב וממקום בעמודה מופרדת. צנטריפוגה ולהסיר את הזרימה דרך. הוסף 400 מיקרוליטרים של שטיפה וחוצץ וצנטריפוגה כדי להסיר את המאגר.הוסף 5 microliters של DNAse 1 עם 75 מיקרוליטר VNA חיץ עיכול בכל מדגם, דגירה במשך 15 דקות. לאחר מכן לשטוף את המדגם עם 400 מאגר הכנה RNA microliter. לאחר מכן, לשטוף פעמיים עם חיץ לשטוף RNA.עכשיו, להוסיף מים ללא גרעין לעמוד, צנטריפוגה ולאחר מכן לאסוף את RNA. למדוד את ריכוז RNA. בשלב זה, שני מיקרוגרם של דגימת RNA ניתן לשלוח עבור רצף RNA.הכן את ה- cDNA בהתאם לפרוטוקול המתואר במקטע הטקסט, באמצעות התרמוצ'ילר. הכן פתרונות פריימר קדימה ואחרץ עם מים נטולי DNAse RNAse לריכוז של 10 מיקרומולרים. הכינו תערובת ראשית לכל גן לגילוי בהתאם למספר הדגימות.עבור כל דגימת cDNA, כמות התגובה היא בהתאם לטבלה המתוארת בטקסט. מניחים כל דגימה ל בארות שלהם. עבור qPCR, זה תמיד טוב להכין מסמך Excel עם פריסת לוח 96 היטב, על מנת לעקוב אחר הדוגמאות.עבור כל מדגם ותותח גן, בצע את תגובתם ב- triplicates, או לפחות כפילויות. לאטום את צלחת הפלסטיק עם איטום פלסטיק שקוף וברור אופטית. הימנע מנגיעה בשכבה הדקה והפלסטית באצבעות, מכיוון שזה יכול לייצר אות שווא.במהירות לסובב את הצלחת כדי לערבב את כל reagents לתחתית בארות שלהם. לאחר מכן, הפעל את לוחית הדגימה באמצעות מכונת PCR כמותית בזמן אמת. קבל את ערכי ה- CT שנוצרו על-ידי מכונת qPCR ונתח עבור ביטוי גנים יחסי.התבסוף בתאים כמתואר בסעיף הקודם של סרטון וידאו זה. קציר תאים מכל מדגם בצינורות סטריליים נפרדים, 15 מיליליטר עבור טריפסיניזציה. לאחר מכן, לשטוף את התאים פעמיים עם 1x PBS, על ידי צנטריפוגה ב 751G במשך חמש דקות, ולאחר מכן להסיר את supernatant.להשעות מחדש ולשבור את הצבעים על ידי הוספת 200 מיקרוליטר קר כקרח 1x PBS דרך פיפטה. הוסף שני מיליליטר של 70 אחוז אתנול קר כקרח, טיפה חכם לצינור, תוך מערבולת הצינור בעדינות כדי לתקן את התאים. צינורות דגירה במשך 30 דקות בטמפרטורת החדר ומ מניחים אותם בארבע מעלות צלזיוס במשך שעה אחת.מוציאים את הצינורות מארבע מעלות צלזיוס וצנטריפוגה. מוסיפים 2 מ"ל PBS קר כקרח ומערבולת, ולאחר מכן להסיר את העל טבעי על ידי צנטריפוגה. הוסף 500 microliters של 1x PBS המכיל פרופידיום יודיד ריבונוקלאז A עם ריכוז 50 ו 200 מיקרוגרם למיליליטר, בהתאמה, בכל מדגם, ודגירה במשך 30 דקות בטמפרטורת החדר.להעביר דגימות לתוך צינורות מתאימים, הגנה מפני אור, ולהפעיל על ציטומטר זרימה. ניסוי זה הוא לזהות את כל החלבונים של מסלול מחזור התא שהשתנה על ידי טיפול microRNA. לאסוף דגימות חלבון על פי ההליך המתואר בסעיף transfection, לכמת עם הבדיקה BCA.הסר את השקופיות ממינוס ארבע מעלות צלזיוס שעה אחת לפני הניסוי כדי להביא לטמפרטורת החדר ולהסיר לחות. קח 70 מיקרוגרם של דגימות חלבון והכן שקופיות מדגם בהתאם להוראות היצרן, אשר מתואר גם צעד אחר צעד בסעיף הטקסט. כאן כדי לציין, שטיפה נכונה של מגלשות עם מים deionized טהור במיוחד הוא צעד חשוב נוסף, כמו זה יעזור להפחית את הרקע של המגלשות.בנוסף, זה מאוד קריטי בניסוי זה לא לייבש את שקופיות המדגם עד השלב הסופי. לבסוף, סרוק את השקופית באמצעות מכונת מיקרו-מערך ונתח את הנתונים. ניתוח qPCR של הדגימות שטופלו במיקרו-רנ"א התקיים כדי לקבוע את ביטוי הגנים של CDK1, CDK4 ו- CDK6.גנים אלה לווסת את מחזור התאים של תאים נורמליים וסרטניים, כבר ממוקד כאמצעי לעיכוב התקדמות הגידול. הנתונים הראו את ההשפעה downregulatory של גנים אלה עקב הטיפול עם microRNA 143 ו 506. נתוני התפלגות מחזור התאים ממחזור הזרימה הדגימו גידול באוכלוסייה בשלב G0 ו- G1, וירידה באוכלוסייה בשלב S עקב השפעת הטיפול הקומבינטורי של microRNA 143 ו- 506.ניתוח המיקרו-מערך הספציפי של מחזור התא זיהה שינויים בביטוי החלבון של כ-60 גנים. מפת החום המיוצגת הצביעה על ירידה ברמת החלבון של מספר גנים הדרושים להתקדמות מחזור התא והתפשטותו, כגון CDK2, הלן 1 ו- 3, RE2F1. לעומת זאת, חלבונים המוכרים בדרך כלל על ידי ההשפעה המעכבת הבוגרת שלהם היו מוסדרים.למרות שהתוצאות הן כמותיות למחצה ונדרש ניתוח נוסף, ניתוח המיקרו-מערך מספק סקירה מהירה של פעילות המסלול. אנו מאמינים, לאחר צפייה בסרטון זה, תוכל לבצע ניסויי מעבדה בסיסיים ומורכבים שיסייעו לך בזיהוי פעילות microRNA בתאים.

Research

JoVE Journal

Cancer Research

MicroRNA Based Liquid Biopsy: The Experience of the Plasma miRNA Signature Classifier (MSC) for Lung Cancer Screening

MicroRNA Based Liquid Biopsy: The Experience of the Plasma miRNA Signature Classifier MSC for Lung Cancer Screening

MicroRNA מבוסס נוזלי ביופסיה: החוויה של miRNA פלזמה החתימה מסווג (MSC) לסינון סרטן ריאות

The development of a minimally invasive test, such as liquid biopsy, for early lung cancer detection in its preclinical phase is crucial to improve the ...

Preparation of Primary Acute Lymphoblastic Leukemia Cells in Different Cell Cycle Phases by Centrifugal Elutriation

הכנה של תאים לוקמיה לימפובלסטית חריפה העיקרית בשלבים שונים של מחזור התא על ידי צנטריפוגלי Elutriation

The ability to synchronize cells has been central to advancing our understanding of cell cycle regulation. Common techniques employed include serum ...

Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology

שיטה פשוטה ומהירה להשיג גידול איכותיים הדנ א של דגימות קליני-פתולוגיים באמצעות מגע ההטבעה ציטולוגיה

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. ...

Generation and Isolation of Cell Cycle-arrested Cells with Complex Karyotypes

דור ובידוד של מחזור התא נעצר תאים עם Karyotypes מורכבים

Chromosome mis-segregation leads to aneuploidy, a condition in which cells harbor an imbalanced chromosome number. Several lines of evidence strongly ...

Phospho Flow Cytometry with Fluorescent Cell Barcoding for Single Cell Signaling Analysis and Biomarker Discovery

Cytometry זרימה פוספו עם פלורסנט תא Barcoding עבור תא בודד איתות ניתוח וגילוי סמן

Aberrant cell signaling plays a central role in cancer development and progression. Most novel targeted therapies are indeed directed at proteins and ...

Flow Cytometric Analysis of Mitochondrial Reactive Oxygen Species in Murine Hematopoietic Stem and Progenitor Cells and MLL-AF9 Driven Leukemia

הזרמת כדוריות הדם של מיני חמצן מיטוכונדריאלי מורטין בגזע ובתאי מחולל ולוקמיה מונחה AF9

We present a flow cytometric approach for analyzing mitochondrial ROS in various live bone marrow (BM)-derived stem and progenitor cell populations from ...

Optimization, Design and Avoiding Pitfalls in Manual Multiplex Fluorescent Immunohistochemistry

אופטימיזציה, עיצוב והימנעות החסרונות בתוך מולטיפלקס במגה ומין אימונוהיסטוכימיה

Microenvironment evaluation of intact tissue for analysis of cell infiltration and spatial organization are essential in understanding the complexity of ...

Cell Cycle-specific Measurement of &#947;H2AX and Apoptosis After Genotoxic Stress by Flow Cytometry

מחזור התא-מדידה ייחודית של γH2AX ו אפופטוזיס לאחר הלחץ הגנוטוקסיידי זרימה Cyהמטריה

The presented method or slightly modified versions have been devised to study specific treatment responses and side effects of various anti-cancer ...

Analysis of Side Population in Solid Tumor Cell Lines

ניתוח אוכלוסיית הצד בקווי תאים סרטניים מלאים

Cancer stem cells (CSCs) are an important cause of tumor growth, metastasis, and recurrence. Isolation and identification of CSCs are of great ...

Evaluating Cell Death Using Cell-Free Supernatant of Probiotics in Three-Dimensional Spheroid Cultures of Colorectal Cancer Cells

הערכת מוות תאים באמצעות Supernatant ללא תאים של פרוביוטיקה בתרביות כדוריות תלת מימדיות של תאים סרטניים המעי הגס

This manuscript describes a protocol to evaluate cancer cell deaths in three dimensional (3D) spheroids of multicellular types of cancer cells using ...