Name: a method for quantifying foliage-dwelling arthropods
Uploaded: 2019-10-20T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Method for Quantifying Foliage-Dwelling Arthropods at JoVE.com

Yazarlar USFS Anlaşması 13-CS-11090800-022 ile bu projeyi finanse için ABD Tarım Orman Hizmetleri Bakanlığı teşekkür etmek istiyorum. J. Suda, W. Holland ve diğerlerine laboratuvar yardımları için ve R. Richards'a saha yardımı için teşekkür ederiz.

1. Alana gitmeden önce numune alma cihazının oluşturulması
<ol><li>Cıvata kesiciler, büyük tel kesiciler veya elektrikli taşlama diski kullanarak, yaklaşık 55 cm uzunluğunda olacak şekilde 30 cm tel domates kafesinin alt 1/3'ü çıkarın.</li>
	<li>Kesme iki, 50 cm parantez alüminyum veya benzer yarı sert malzemeden yapılmış ek çubuklar ve domates kafesin en büyük ucunun her iki tarafında parantez olarak kullanmak için. Sondan 38 cm uzaklıkta, ayraç'ı yaklaşık 30° açıyla bükmek için bi...

Eklembacaklı toplulukların doğru bir şekilde ölçülmesinin iki gerekliliği nispeten yüksek algılama olasılıkları ve bilinen veya tutarlı örnekleme alanlarıdır. Eklembacaklılar için örnekleme yaparken, %100'den daha az algılama olasılığı ya tek tek eklembacaklıların tuzaklardan kaçınmasına ya da işleme sırasında fark edilmeden sıkışıp kalan bazı kişilere atfedilebilir. Uçan eklembacaklıların (Malaise/pencere tuzakları, yapışkan tuzaklar, vb.) kesen avcı tuzakları, orman kanopi...

Karasal eklembacaklılar ekosistemimizde önemli bir rol oynarlar. Bilimsel ilgi eklembacaklılar olmanın yanı sıra hem zararlı ve bitkileri, bahçecilik bitkileri ve doğal bitki örtüsü için yararlı olabilir yanı sıra gıda ağlarında önemli bir trofik fonksiyon sağlar. Bu nedenle, eklembacaklı toplumun gelişimini ve bolluğunu etkileyen faktörlerin anlaşılması çiftçiler, haşere kontrol yöneticileri, bitki biyologları, böcekbilimciler, yaban hayatı ekolojistleri ve toplum dinamiklerini inceleyen koruma biyologları için çok önemlidir ve böcekçil organizmaları yönetmek. Eklembacaklı toplulukları ve bollukları etkileyen faktörleri anlamak genellikle bireylerin yakalanmasını gerektirir. Yakalama teknikleri genellikle sadece tür aralığı, zenginlik ve çeşitlilik tahminleri için bir türün varlığını tespit nitel teknikler veya bir indeks veya tahmin için izin yarı-nicel ve nicel teknikler kategorize edilebilir bir taksonomik grup içinde bireylerin bolluk ve yoğunluğu.
Sadece bir türün veya topluluk yapısının varlığına ilişkin çıkarımlara izin veren nitel teknikler bilinmeyen veya özünde düşük algılama olasılığına sahiptir veya örneklenmiş alanın algılama olasılığı ve büyüklüğü ne olursa olsun çıkarım sağlamada eksiktir. Bu tekniklerle algılama olasılığı düşük olduğundan, algılama ile ilişkili değişkenlik, açıklayıcı değişkenlerin eklembacaklı popülasyon ölçümlerini nasıl etkilediğini ortaya çıkarmak için yeterli hassasiyeti engellemektedir. Varlığı tahmin etmek için kullanılan nitel teknikler emme örneklemeiçerir 1, ışık tuzakları2, ortaya çıkma tuzakları3, kökleri 4 beslenme desenleri4, salamura borular5, yemler6, feromon3, tuzak tuzakları 7, Malaise tuzakları8, pencere tuzakları9, emme tuzakları10, dövme tepsiler11, örümcek ağları12, yaprak madenleri, frass13, eklembacaklı safra14, bitki örtüsü ve kök hasarı15 .
Alternatif olarak, yarı-nicel ve nicel teknikler araştırmacıların belirli bir örnek alanı tahmin etmelerine veya en azından tutarlı bir şekilde örneklemelerine ve algılama olasılığını tahmin etmelerine veya algılama olasılığının yönsüz ve yeterli olmadığını varsaymalarına olanak sağlar. araştırmacının bolluktaki mekansal veya zamansal değişimi tespit etme yeteneğini gizlemek. Yarı-nicel ve nicel teknikler süpürme ağlarıiçerir 16, emme veya vakum örnekleme17, görünür eklembacaklılar sistematik sayma18, yapışkan tuzaklar19, çeşitli pot tipi tuzaklar20, giriş veya acil delikler21, kimyasal knockdown22, yapışkan ve su dolu renk tuzakları23, ve şube torbalama ve kırpma24.
İklim ve rahatsızlık rejimlerinde son zamanlarda antropojenik kaynaklı değişiklikler bitki topluluklarında dramatik değişikliklere yol açarak bitki-topluluk türlerinin bileşimi ve eklembacaklı toplulukları arasındaki etkileşimleri aktif bir çalışma alanı haline getirilmiştir. Eklembacaklı topluluklarının bitki türlerinin bileşimine göre nasıl farklılık gösterdiğini anlamak, bitki topluluklarındaki değişikliklerin potansiyel ekonomik ve çevresel etkilerini anlamak için kritik bir bileşendir. Eklembacaklı bolluğunu bitki türleri arasındaki farklılıkları tespit etmek için yeterli hassasiyetle ölçmek için yarı nicel veya nicel yöntemlere ihtiyaç vardır. Bu makalede, yeşillik-konut eklembacaklıin indeksleme yöntemi, makul bir çaba ile, bireysel bolluk ve biyokütle, çeşitlilik ve yaygın olarak bulunan ağaçların 5 takson arasındaki farklılıkları belirlemek için yeterli hassasiyet sağlanan Kuzey Amerika25güneydoğu yaprak döken ormanlar . Bu yaklaşım, antropik modifiye edici bozulma rejimleri nedeniyle orman bitki topluluklarının tür bileşimindeki değişikliklerin eklembacaklıların bileşimini nasıl etkilediği konusunda çıkarıma izin vermek için yeterli hassasiyeti sağlamıştır. yüksek trofik böcekçil kuşlar ve memelilerin bolluğu ve dağılımını etkileyen. Daha spesifik olarak, crossley ve ark.24tarafından tanımlanan değiştirilmiş bir torbalama tekniği ni kullanarak, yüzey yoğunluğunu, yapraklarda yaşayan eklembacaklıların yoğunluğunu tahmin ettik ve çeşitlilik, zenginlik ve daha hızlı büyüyen daha xeric ağaç türlerinin yaprakları eklembacaklıların bolluğu daha mesic türler yavaş büyüyen göre. Bu makalenin amacı tekniğin ayrıntılı yönergelerini sağlamaktır.
Biz güney Illinois Shawnee Ulusal Ormanı (SNF) üzerinde çalışma yaptı. SNF Ozarks ve Shawnee Hills doğal bölünmeler26Orta Hardwoods bölgesinde bulunan bir 115.738-ha orman. Orman% 37 meşe / hickory,% 25 karışık upland hardwoods, 16% kayın / akçaağaç ve% 10 dipli sert ağaçlar bir mozaik oluşur. SNF yayla xeric alanlarda ikinci büyüme meşe / hickory hakim ve şeker akçaağaç, Amerikan kayın ve lale ağacı(Liriodendron tulipifera) korunaklı mesic vadilerde27,28.
Bu yöntem için site seçimi çalışmanın kapsamlı hedeflerine bağlı olacaktır. Örneğin, orijinal çalışmamızın temel amacı, ağaç topluluğundaki değişikliklerin, mesic ve xeric uyarlanmış ağaç toplulukları arasındaki yapraklar üzerinde yaşayan eklembacaklı topluluk ölçümlerini karşılaştırarak daha yüksek trofik organizmaları nasıl etkileyebileceğine dair içgörü sağlamaktı. Böylece, birincil hedefimiz xeric veya mesic ağaç topluluk içinde bulunan bireysel ağaçlar üzerinde eklembacaklı topluluk ölçmek oldu. ArcGIS 10.1.1'de USFS stand kapak haritaları (allveg2008.shp) kullanarak bir meşe/hickory (xeric) boyunca 22 çalışma alanı seçtik. Olası şaşırtıcı etkileri önlemek için, aşağıdaki kriterleri kullanarak siteleri seçtik: yırtılak alanlarda bulunmayan, ≥12 ha, ve bitişik yayla-yaprak döken orman habitat içinde bulunan (yani, 120 m üzerinde yükseklik). Tüm siteler de engebeli arazide olgun ağaçlar >50 yaşında, benzer yamaçlar ve yönlerden oluşacaktır. Kayın/akçaağaç alanı sınırları ağaç topluluklarının geçişine göre ayırt edilirken, meşe/hickory site sınırları Yapay olarak SNF kapak haritaları ve ArcGIS 10.1.1 kullanılarak tespit edilmiştir. Tüm siteler un-glaciated arazi içinde büyük orman blokları vardı; ağaç türlerinin bileşimindeki farklılıkları, peyzajdaki konum farklılıklarından değil, geçmiş arazi kullanımını (örn. açık kesimler veya seçici hasat) temsil ediyordu. Her çalışma alanının ayrık çokgen şekilli dosyalarını el deki Küresel Konumlandırma Sistemi'ne (GPS) yükleyerek ve ağaç türlerinin bileşimini doğrulayarak haritaları doğruladık. Her sitede rastgele örnekleme noktaları (n = 5) seçtik. Her noktada, 23 Mayıs -25 Haziran 2014 tarihleri arasında 0600−1400 saat arasında üç ağaç örneği aldık. Örnek ağaçları bulmak için bitki örtüsü noktalarından 30 m yarıçapa kadar dışa doğru arama yaptık ve örneklenebilecek kadar alçak dalları olan olgun ağaçlar (>20 cm d.b.h.) bulundu. Tipik olarak, ilgi çeken ve merkez noktasına en yakın olan beş cinsten üçünü(Acer, Carya, Fagus, Liriodendron ve Quercus)temsil eden üç olgun ağaç örneklenmiştir.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>13 gallon garbage bags</td>
			<td>Glad</td>
			<td>78374</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aluminum rod</td>
			<td>Grainger</td>
			<td>48ku20</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pruner</td>
			<td>Bartlet arborist supply</td>
			<td>pp-125b-2stick</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Telescoping pole</td>
			<td>BES</td>
			<td>TPF620</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tomato Cage</td>
			<td>Gilbert and Bennet</td>
			<td>42 inch galvanized</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a method for quantifying foliage-dwelling arthropods

Karasal eklembacaklılar çevremizde önemli bir rol oynarlar. Eklembacaklıların kesin bir indeks veya yoğunluk tahminlerine olanak sağlayacak şekilde ölçülmesi, yüksek algılama olasılığına ve bilinen örnekleme alanına sahip bir yöntem gerektirir. Açıklanan yöntemlerin çoğu türlerin varlığını, zenginliğini ve çeşitliliğini tanımlamak için yeterli niteliksel veya yarı nicel bir tahmin sağlarken, çok azı yeterli tutarlı bir algılama olasılığı ve bilinen veya tutarlı örnekleme alanları sağlamak için çevresel, mekansal veya zamansal değişkenler arasındaki bolluk farklılıklarını tespit etmek için yeterli hassasiyetle bir indeks veya tahmin. Yaprakta yaşayan eklembacaklıların bir torbadaki dalların yapraklarını ve ucunu mühürleyerek, torbalanmış malzemeyi kırpma ve dondurma yla ve eklembacaklıları substrattan ayırmak ve ölçmek için suda önceden dondurulmuş malzemeyi durulayarak nasıl ölçülebileceğimizi anlatıyoruz. Gösterdiğimiz gibi, bu yöntem, uzaysal, zamansal, çevresel ve ekolojik değişkenlerin eklembacak zenginliğini ve bolluğunu nasıl etkilediğini test etmek ve açıklamak için yeterli hassasiyetle yaprak tabirinde bulunan eklembacaklıları ölçmek için bir peyzaj ölçeğinde kullanılabilir. Bu yöntem, güneydoğu yaprak döken ormanlarda yaygın olarak bulunan 5 cins ağaç cinsi arasındaki yoğunluk, zenginlik ve yaprak-yaşayan eklembacaklıların çeşitliliği farklılıklarını tespit etmemizi sağladı.

5 ağaç grubu oluşturan 323 ayrı ağaçtan 626 örnek topladık. Örneklenmiş dal ların metre başına toplam eklembacaklı biyokütle tahminleri için, standart hata 5 ağaç grubu için ortalamanın %12 ila %18'i arasında değişmektedir(Tablo 1). Bu hassasiyet düzeyi ağaç grupları arasındaki değişimi ve25. Bu teknik, 5 ağaç grubu içinde ortalama çeşitliliğin %3 ila %7'si arasında değişen eklembacaklı lonca çeşitliliğini...

Watch this Scientific Journal Video about A Method for Quantifying Foliage-Dwelling Arthropods at JoVE.com

A Method for Quantifying Foliage-Dwelling Arthropods

Bir torbadaki dalların yapraklarını ve ucunu mühürleyerek, torbalanmış malzemeyi kırpıp dondurarak ve eklembacaklıları nicelleştirmek için alt tabakadan ayırmak için suda önceden dondurulmuş malzemeyi durulayarak yaprak lı eklembacaklıların nasıl ölçüleceklerini anlatıyoruz.

Yaprak-Konut Eklembacaklıların Ölçülme Yöntemi

Terrestrial arthropods play an important role in our environment. Quantifying arthropods in a way that allows for a precise index or estimates of density ...

Bu protokolün en büyük avantajı, araştırmacıların hem uçan hem de sürünen eklembacaklıları yeşilliklerden yakalamalarına olanak sağlamasıdır. Bu tekniği ağaçlarda kullanmamıza rağmen çalı ve çalılarda da kullanılabilir. Aktif eklembacaklıların yakalanmaktan kaçmaması için yeşillikleri bozmadan dalları hızlı bir şekilde poşetleme alıştırması yapmaya dikkat edin.Bu prosedürü başlatmak için, yaklaşık 55 santimetre uzunluğunda olacak şekilde 30 santimetrelik tel domates kafesinin alt üçte birini çıkarmak için cıvata kesiciler, büyük tel kesiciler veya elektrikli öğütme diski kullanın. Daha sonra, alüminyum boru veya benzer bir yarı-sert malzemeden iki 50 santimetre parantez kesme ek çubuklar ve domates kafesin in en büyük ucunun her iki tarafında parantez olarak kullanmak için. Sonundan 38 santimetre uzakta, parantezi yaklaşık 30 derecelik bir açıya bükmek için bir masa üstü yardımcısı veya kanal kilitleri gibi daha büyük kavrama araçları kullanın.Zip bağları ile domates kafesi zıt uçlarına her ek çubuk uzun ucunu takın. Bu eki desteklemek için koli bandı veya elektrik bandı kullanın ve bandın kafes ve çubuğun en az altı santimetre etrafında sarılı olduğundan emin olun. Zip bağları ile genişletilebilir bir direğin ucunun zıt taraflarında her çubuğun diğer ucunu takın.Bandı birden çok kez sardığından ve kutup ve çubuklarla en az altı santimetre örtüştüğünden emin olmak için bu eki desteklemek için koli bandı veya elektrik bandı kullanın. Kafesin açılmasının kafes takılıyken teleskopdirdir inin ucuyla temas ettiğinden emin olun. Daha sonra kafesi bant kullanarak direğin ucuna doğrudan takın.Daha önce bağlı direğin 90 derece açıklığa iki noktada kanca ve döngü bağlantı şeritleri takın. İlk olarak, kanca ve döngü bağlantı elemanı iki adet çantanın dış açılış böylece kanca ve kafesin açılmasına bağlı döngü bağlantı elemanı ile hizalamak. Kanca ve döngü bağlantı elemanının hizalandığından emin olun, böylece çanta takılınca ve çantanın çekme iplerine bağlanan açıklık teleskopdire paralel olarak çalıştırın.Tel domates kafesi içine 49 litrelik mutfak çöp torbası takın. Üç timsah klipsi eşit olarak çantanın alt her tarafına dağılmış yerleştirin ve çanta kafese karşı tutulur, böylece hem çanta hem de tel kafes klipleri ekleyin. Torbadaki timsah klibini, kutup ekinin bulunduğu yerin karşısındaki teleskopik direğe paralel olarak çekme ipine bağlı olacak şekilde aç.Direğe en yakın olan çantanın çekmecesine paracord takın. Dört santimetrelik bölümlerde dört parça plastik veya sert kauçuk boru kesin ve koli bandı veya elektrik bandı ile dört yerde takın. Önce domates kafesine en yakın direğin ucuna yaklaşık 0,5 metre kutup uzanan kısmına yerleştirilmelidir.Kalan üç alt bölümün üst kısmından yaklaşık beş santimetre başlayan uzanan kutup alt bölümü boyunca eşitlik yerleştirilmelidir. Plastik boru ile torbaya bağlı olmayan paracord ucu iplik. Bu çalıştırdıktan sonra her iki paracord dizeleri birlikte plastik boru ekler aracılığıyla yerinde tutmak için çalıştırın.Her örnek ağaç için, maksimum uzunlukta uzatıldığında uzatma kutbu yüksekliği içinde bir örnek yükseklik seçmek için rasgele bir sayı üreteci kullanın. Ağaç gövdesinden örnek bir mesafe seçmek ve yeşilliken en az rahatsızlık la torbaya sığacak bir dalı belirlemek için rastgele sayı üretecisini kullanın. Ve üretilen sayılara göre gövdeden uygun yükseklik ve uzaklık.Örnekleme direğini istenilen dalile paralel bir yüksekliğe yükseltin. Çantayı hızla dalın üzerine kaydırın ve sonra çantayı mühürlemek için drawstring'lere bağlı paracord iplerini hızlıca çekin. İkinci bir kişinin, çantanın açIlişi bitişik konumdaki dalı kesmek için uzatma direği prunerini kullanmasını sağlayın.Daha sonra numune çantasını dikkatlice yere getirin ve çantanın iplerini hızla kapatın. Torbalı dalı laboratuvar eklembacaklı analizini yapmaya hazır olana kadar dondurucuda saklayın. Dondurulmuş çanta ve dal dik tutun ve çanta içine eklembacaklıçıkarmak için çanta iken örnek dalı sallayın.Dikkatlice çantadan dalı çıkarın ve kalan eklembacaklıları kaldırmak için büyük toplama tavada durulayın. Daha sonra, çantada kalan malzemeyi toplama tavasına boşaltın ve eklembacaklı olmayan bir enkazı çıkarın. Artropodları istenilen taksonomik gruplara ayırın.Larvalar ve yetişkinler arasındaki farklılıklara dikkat çekiyor. Artropodları istenilen şekilde ölçün. Biyokütle ilgi ise ya eklembacaklıların uzunluğunu ölçmek ve biyokütle tahmin etmek için yayınlanan uzunluk kitle tablosu kullanın.Küçük kurutma tavalarında eklembacaklıları değiştirin. Kurutma fırınında 45 derecede 24 saat kurulayın ve elektronik dengeyi tartın. 45 santigrat derece 48 saat boyunca bir kurutma fırında yaprakları kuru ve elektronik bir denge üzerinde tartın.Veya numune içindeki tüm odunsu dalların uzunluğunu ölçün. Temsili bir çalışmada, 5 ağaç grubu oluşturan 323 ayrı ağaçtan 626 örnek toplanmıştır. Şubenin metre başına toplam eklembacaklı biyokütle tahminleri için beş ağaç grubu için ortalamanın %12 ila %18'i arasında standart hata aralıkları elde edilebilmektedir.Bu hassasiyet düzeyi, tarihe göre biyokütledeki kuadratik bir değişiklikteki ağaç grupları arasındaki değişimi tespit etmek için yeterlidir. Bu teknik, beş ağaç grubu içinde ortalama çeşitliliğin %3 ila %7'si arasında değişen eklembacaklı lonca çeşitliliğinin standart hatasından da anlaşılarak lonca çeşitliliğini tahmin ederken daha hassas bir hassasiyet sağlar. Bu düzeydeki hassasiyet, beş ağaç grubu arasındaki varyasyonu algılamak için yeterlidir.Beş ağaç grubu arasındaki ortalama zenginliğin %3 ila %7'si arasında değişen standart hatalardan da anlaşıldığı gibi, zenginlik tahminlerinin hassasiyeti de çok hassastır. Bu hassasiyet düzeyi, ağaç grupları arasındaki varyasyonu belirlemek için yeterlidir. Tarih ile bir kuadratik ilişki, ağaç yüksekliği ile zenginlik azalma, ve eklembacaklı zenginliği ve ağaç gövdesinden mesafe arasında olumlu bir ilişki.Aktif eklembacaklıların yakalanmaktan kaçmamasını sağlamak için yeşillikleri bozmadan dalı hızlı bir şekilde içine aldığınızdan emin olun.

a-method-for-quantifying-foliage-dwelling-arthropods

Research

JoVE Journal

Environment

A Simple Method for Automated Solid Phase Extraction of Water Samples for Immunological Analysis of Small Pollutants

A new method for solid phase extraction (SPE) of environmental water samples is proposed. The developed prototype is cost-efficient and user friendly, and enables to perform rapid, automated and simple SPE. The pre-concentrated solution is compatible with analysis by immunoassay, with a low organic solvent content. A method is described for the extraction and pre-concentration of natural hormone 17&#946;-estradiol in 100 ml water samples. Reverse phase SPE is performed with octadecyl-silica sorbent and elution is done with 200 &#181;l of methanol 50% v/v. Eluent is diluted by adding di-water to lower the amount of methanol. After preparing manually the SPE column, the overall procedure is performed automatically within 1 hr. At the end of the process, estradiol concentration is measured by using a commercial enzyme-linked immune-sorbent assay (ELISA). 100-fold pre-concentration is achieved and the methanol content in only 10% v/v. Full recoveries of the molecule are achieved with 1 ng/L spiked de-ionized and synthetic sea water samples.

A protocol for the extraction and pre-concentration of estradiol from water samples by using an automated and miniaturized system is presented.

Küçük Kirleticilerin İmmünolojik Analizi Su Örneklerinin Otomatik Katı Faz Ekstraksiyon Basit Bir Yöntem

A new method for solid phase extraction (SPE) of environmental water samples is proposed. The developed prototype is cost-efficient and user friendly, and ...

Çevre

Administering and Detecting Protein Marks on Arthropods for Dispersal Research

Monitoring arthropod movement is often required to better understand associated population dynamics, dispersal patterns, host plant preferences, and other ecological interactions. Arthropods are usually tracked in nature by tagging them with a unique mark and then re-collecting them over time and space to determine their dispersal capabilities. In addition to actual physical tags, such as colored dust or paint, various types of proteins have proven very effective for marking arthropods for ecological research. Proteins can be administered internally and/or externally. The proteins can then be detected on recaptured arthropods with a protein-specific enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Here we describe protocols for externally and internally tagging arthropods with protein. Two simple experimental examples are demonstrated: (1) an internal protein mark introduced to an insect by providing a protein-enriched diet and (2) an external protein mark topically applied to an insect using a medical nebulizer. We then relate a step-by-step guide of the sandwich and indirect ELISA methods used to detect protein marks on the insects. In this demonstration, various aspects of the acquisition and detection of protein markers on arthropods for mark-release-recapture, mark-capture, and self-mark-capture types of research are discussed, along with the various ways that the immunomarking procedure has been adapted to suit a wide variety of research objectives.

Proteins are often used to mark arthropods for dispersal research. Methods for administering internal and external protein marks on arthropods are demonstrated. Protein mark detection techniques, either through indirect or sandwich enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), are also illustrated.

Yönetme ve Dağılma Araştırma Arthropodlara Protein Marks algılama

Monitoring arthropod movement is often required to better understand associated population dynamics, dispersal patterns, host plant preferences, and other ...

Alternative Method of Removing Otoliths from Sturgeon

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a transverse vertical incision on the top of the skull with a hand or electrical saw may damage the otolith if not performed correctly. Sturgeons (Acipenseridae) are one family in particular that have a very large and thick skull. A new laboratory method entering the brain cavity from the ventral side of the fish to expose the otoliths was easier than other otolith extraction methods found in the literature. Methods reviewed in the literature are designed for the field and are more efficient at processing large quantities of fish quickly. However, this new technique was designed to be more suited for a laboratory setting when time is not pressing and successful extraction from each specimen is critical. The success of finding and removing otoliths using this technique is very high and does not compromise the structure in any manner. This alternative technique is applicable to other similar fish species for extracting the otoliths.

The goal of the protocol is to show an effective method to extract the otoliths from sturgeon carcasses.

Sturgeon gelen otolitler Çıkarma Alternatif Yöntem

Extracting the otoliths (ear bones) from fish that have very thick skulls can be difficult and very time consuming. The common practice of making a ...

Modification and Application of a Leaf Blower-vac for Field Sampling of Arthropods

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropod populations in rice. When used in combination with an enclosure, application of this sampling device provides absolute estimates of the populations of arthropods as numbers per standardized sampling area. The sampling efficiency depends critically on the sampling duration. In a mature rice crop, a two-minute sampling in an enclosure of 0.13 m2 yields more than 90% of the arthropod population. The device also allows sampling of arthropods dwelling on the water surface or the soil in rice paddies, but it is not suitable for sampling fast flying insects, such as predatory Odonata or larger hymenopterous parasitoids. The modified blower-vac is simple to construct, and cheaper and easier to handle than traditional suction sampling devices, such as D-vac. The low cost makes the modified blower-vac also accessible to researchers in developing countries.

Assessment of arthropod abundance in crops is critical for investigating population dynamics and species interactions. Here we describe the modification and application of a leaf blower-vac for suction sampling of arthropods in rice.

Modifikasyon ve Arthropodların Saha Örnekleme için bir Yaprak Blower-vac Uygulama

Rice fields host a large diversity of arthropods, but investigating their population dynamics and interactions is challenging. Here we describe the ...

Reliable Method for Assessing Seed Germination, Dormancy, and Mortality under Field Conditions

We describe techniques for approximating seed bank dynamics over time using Helianthus annuus as an example study species. Strips of permeable polyester fabric and glue can be folded and glued to construct a strip of compartments that house seeds and identifying information, while allowing contact with soil leachate, water, microorganisms, and ambient temperature. Strips may be constructed with a wide range of compartment numbers and sizes and allow the researcher to house a variety of genotypes within a single species, different species, or seeds that have experienced different treatments. As opposed to individual seed packets, strips are more easily retrieved as a unit. While replicate packets can be included within a strip, different strips can act as blocks or can be retrieved at different times for observation of seed behavior over time. We used a high temperature glue gun to delineate compartments and sealed the strips once the seed and tags identifying block and removal times were inserted. The seed strips were then buried in the field at the desired depth, with the location marked for later removal. Burrowing animal predators were effectively excluded by use of a covering of metal mesh hardware cloth on the soil surface. After the selected time interval for burial, strips were dug up and seeds were assessed for germination, dormancy and mortality. While clearly dead seeds can often be distinguished from ungerminated living ones by eye, dormant seeds were conclusively identified using a standard Tetrazolium chloride colorimetric test for seed viability.

Here we present a protocol for assessing seed survivorship, germination and dormancy under field conditions using buried, labeled seed strips and tetrazolium chloride (TZ) viability testing.

Tarla Şartlarında Tohum çimlenme, dormansi ve Ölümlerini değerlendirilmesi için güvenilir yöntem

We describe techniques for approximating seed bank dynamics over time using Helianthus annuus as an example study species. Strips of permeable polyester ...

Protocols for Quantifying Transferable Pesticide Residues in Turfgrass Systems

Plant canopies in established turfgrass systems can intercept an appreciable amount of sprayed pesticides, which can be transferred through various routes onto humans. For this reason, transferable pesticide residue experiments are required for registration and re-registration by the United States Environmental Protection Agency (USEPA). Although such experiments are required, limited specificity is required pertaining to experimental approach. Experimental approaches used to assess pesticide transfer to humans including hand wiping with cotton gloves, modified California roller (moving a roller of known mass over cotton cloth) and soccer ball roll (ball wrapped with sorbent strip) over three treated turfgrass species (creeping bentgrass, hybrid bermudagrass and tall fescue maintained at 0.4, 5 and 9 cm, respectively) are presented. The modified California roller is the most extensively utilized approach to date, and is best suited for use at low mowing heights due to its reproducibility and large sampling area. The soccer ball roll is a less aggressive transfer approach; however, it mimics a very common occurrence in the most popular international sport, and has many implications for nondietary pesticide exposure from hand-to-mouth contact. Additionally, this approach may be adjusted for other athletic activities with limited modification. Hand wiping is the best approach to transfer pesticides at higher mowing heights, as roller-based approaches can lay blades over; however, it is more subjective due to more variable sampling pressure. Utility of these methods across turfgrass species is presented, and additional considerations to conduct transferable pesticide residue research in turfgrass systems are discussed.

Transferable pesticide residue experiments in turfgrass systems are integral components of human risk exposure assessments. Experimental approaches to measure transferable residues should be adjusted to the human interaction of interest and turfgrass system dynamics. Three transferable pesticide residue protocols are presented and the suitability across three turfgrass systems is discussed.

Çim Bitkileri Sistemlerinde Transferli Pestisit Kalıntı miktarının için Protokoller

Plant canopies in established turfgrass systems can intercept an appreciable amount of sprayed pesticides, which can be transferred through various routes ...

Development of New Methods for Quantifying Fish Density Using Underwater Stereo-video Tools

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and estimating fish abundance. We developed and implemented a rotating stereo-video camera tool that covers a full 360 degrees of sampling, which maximizes sampling effort compared to stationary camera tools. A variety of studies have detailed the ability of static, stereo-camera systems to obtain highly accurate and precise measurements of fish; the focus here was on the development of methodological approaches to quantify fish density using rotating camera systems. The first approach was to develop a modification of the metric MaxN, which typically is a conservative count of the minimum number of fish observed on a given camera survey. We redefine MaxN to be the maximum number of fish observed in any given rotation of the camera system. When precautions are taken to avoid double counting, this method for MaxN may more accurately reflect true abundance than that obtained from a fixed camera. Secondly, because stereo-video allows fish to be mapped in three-dimensional space, precise estimates of the distance-from-camera can be obtained for each fish. By using the 95% percentile of the observed distance from camera to establish species-specific areas surveyed, we account for differences in detectability among species while avoiding diluting density estimates by using the maximum distance a species was observed. Accounting for this range of detectability is critical to accurately estimate fish abundances. This methodology will facilitate the integration of rotating stereo-video tools in both applied science and management contexts.

We describe a new method for counting fishes, and estimating relative abundance (MaxN) and fish density using rotating stereo-video camera systems. We also demonstrate how to use distance from camera (Z distance) to estimate species-specific detectability.

Sualtı Stereo video araçları kullanarak balık yoğunluğu miktarının için yeni yöntemler geliştirilmesi

The use of video camera systems in ecological studies of fish continues to gain traction as a viable, non-extractive method of measuring fish lengths and ...

A Novel Method for the Pentosan Analysis Present in Jute Biomass and Its Conversion into Sugar Monomers Using Acidic Ionic Liquid

Recently, ionic liquids (ILs) are used for biomass valorization into valuable chemicals because of their remarkable properties such as thermal stability, lower vapor pressure, non-flammability, higher heat capacity, and tunable solubility and acidity. Here, we demonstrate a method for the synthesis of C5 sugars (xylose and arabinose) from the pentosan present in jute biomass in a one-pot process by utilizing a catalytic amount of Br&#248;nsted acidic 1-methyl-3-(3-sulfopropyl)-imidazolium hydrogen sulfate IL. The acidic IL is synthesized in the lab and characterized using NMR spectroscopic techniques for understanding its purity. The various properties of BAIL are measured such as acid strength, thermal and hydrothermal stability, which showed that the catalyst is stable at a higher temperature (250 &#176;C) and possesses very high acid strength (Ho 1.57). The acidic IL converts over 90% of pentosan into sugars and furfural. Hence, the presenting method in this study can also be employed for the evaluation of pentosan concentration in other kinds of lignocellulosic biomass.

We present a protocol for the synthesis of C5 sugars (xylose and arabinose) from a renewable non-edible lignocellulosic biomass (i.e., jute) with the presence of Br&#248;nsted acidic ionic liquids (BAILs) as the catalyst in water. The BAILs catalyst exhibited better catalytic performance than conventional mineral acid catalysts (H2SO4 and HCl).

Pentosan analizi için yeni bir yöntem mevcut Jüt biyokütle ve şeker monomerleri asidik iyonik sıvı kullanarak içine onun dönüşüm

Recently, ionic liquids (ILs) are used for biomass valorization into valuable chemicals because of their remarkable properties such as thermal stability, ...

Quantifying Plant Soluble Protein and Digestible Carbohydrate Content, Using Corn (Zea mays) As an Exemplar

Elemental data are commonly used to infer plant quality as a resource to herbivores. However, the ubiquity of carbon in biomolecules, the presence of nitrogen-containing plant defensive compounds, and variation in species-specific correlations between nitrogen and plant protein content all limit the accuracy of these inferences. Additionally, research focused on plant and/or herbivore physiology require a level of accuracy that is not achieved using generalized correlations. The methods presented here offer researchers a clear and rapid protocol for directly measuring plant soluble proteins and digestible carbohydrates, the two plant macronutrients most closely tied to animal physiological performance. The protocols combine well characterized colorimetric assays with optimized plant-specific digestion steps to provide precise and reproducible results. Our analyses of different sweet corn tissues show that these assays have the sensitivity to detect variation in plant soluble protein and digestible carbohydrate content across multiple spatial scales. These include between-plant differences across growing regions and plant species or varieties, as well as within-plant differences in tissue type and even positional differences within the same tissue. Combining soluble protein and digestible carbohydrate content with elemental data also has the potential to provide new opportunities in plant biology to connect plant mineral nutrition with plant physiological processes. These analyses also help generate the soluble protein and digestible carbohydrate data needed to study nutritional ecology, plant-herbivore interactions and food-web dynamics, which will in turn enhance physiology and ecological research.

Quantifying Plant Soluble Protein and Digestible Carbohydrate Content, Using Corn Zea mays As an Exemplar

The protocols described herein provide a clear and approachable methodology for measuring soluble protein and digestible (non-structural) carbohydrate content in plant tissues. The ability to quantify these two plant macronutrients has significant implications for advancing the fields of plant physiology, nutritional ecology, plant-herbivore interactions and food-web ecology.

Bitki çözünür Protein ve sindirilebilir karbonhidrat içeriği, Mısır (Zea mays) kullanarak bir suret olarak miktarının

Elemental data are commonly used to infer plant quality as a resource to herbivores. However, the ubiquity of carbon in biomolecules, the presence of ...

Design and Use of an Apparatus for Quantifying Bivalve Suspension Feeding at Sea

As shellfish aquaculture moves from coastal embayments and estuaries to offshore locations, the need to quantify ecosystem interactions of farmed bivalves (i.e., mussels, oysters, and clams) presents new challenges. Quantitative data on the feeding behavior of suspension-feeding mollusks is necessary to determine important ecosystem interactions of offshore shellfish farms, including their carrying capacity, the competition with the zooplankton community, the availability of trophic resources at different depths, and the deposition to the benthos. The biodeposition method is used to quantify feeding variables in suspension-feeding bivalves in a natural setting and represents a more realistic proxy than laboratory experiments. This method, however, relies upon a stable platform to satisfy the requirements that water flow rates supplied to the shellfish remain constant and the bivalves are undisturbed. A flow-through device and process for using the biodeposition method to quantify the feeding of bivalve mollusks were modified from a land-based format for shipboard use by building a two-dimensional gimbal table around the device. Planimeter data reveal a minimal pitch and yaw of the chambers containing the test shellfish despite boat motion, the flow rates within the chambers remain constant, and operators are able to collect the biodeposits (feces and pseudofeces) with sufficient consistency to obtain accurate measurements of the bivalve clearance, filtration, selection, ingestion, rejection, and absorption at offshore shellfish aquaculture sites.

A flow-through device for using the biodeposition method to quantify filtration and feeding behavior of bivalve mollusks was modified for shipboard use. A two-dimensional gimbal table built around the device isolates the apparatus from boat motion, thereby allowing the accurate quantification of bivalve filtration variables at offshore shellfish aquaculture sites.

Tasarım ve deniz kabuklu süspansiyon besleme miktarının için bir aparat kullanımı

As shellfish aquaculture moves from coastal embayments and estuaries to offshore locations, the need to quantify ecosystem interactions of farmed bivalves ...