通过旗-生物素串联纯化通过交叉链接和免疫沉淀对蛋白质-RNA相互作用进行转录组-全过程分析

只有和只有结合的蛋白质控制多个生物过程。这种 FLAG-Biotin CLIP-seq 方法，因此在全球范围内描述哺乳动物细胞中RNA和RBB的特殊和时间排列。这种方法允许有效地检测直接蛋白结合的RNA，无需SDS-PAGE和膜转移程序。

与传统的 CLIP-seq 相比，它是无同位素的，不需要蛋白质特异性抗体。首先将大约300万只小鼠胚胎STEM细胞镀在10厘米的盘子里，并在一夜之间孵育。第二天，用真空去除介质，在室温下用两毫升0.25%的三丁辛EDTA治疗细胞两分钟。