Name: long-range channelrhodopsin-assisted circuit mapping of inferior colliculus neurons with blue and red-shifted channelrhodopsins
Uploaded: 2020-02-07T13:00:00
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Este trabajo fue apoyado por una Beca Deutsche Forschungsgemeinschaft Research Fellowship (GO 3060/1-1, número de proyecto 401540516, a DG) y la beca de los Institutos Nacionales de Salud R56 DC016880 (MTR).

Obtener la aprobación del Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales (IACUC) y adherirse a las directrices de NIH para el cuidado y uso de animales de laboratorio. Todos los procedimientos de este protocolo fueron aprobados por la Universidad de Michigan IACUC y estaban de acuerdo con las directrices de NIH para el cuidado y uso de animales de laboratorio.
1. Preparaciones de cirugía
<ol><li>Realizar cirugías en condiciones asépticas. Autoclave/esterilizar todas las herramientas ...

<ol>
	<li>Petreanu, L., Huber, D., Sobczyk, A., Svoboda, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Channelrhodopsin-2-assisted+circuit+mapping+of+long-range+callosal+projections.">Channelrhodopsin-2-assisted circuit mapping of long-range callosal projections.</a> Nature Neuroscience. 10, 663-668 (2007).</li><li>Atasoy, D., Aponte, Y., Su, H. H., Sternson, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+FLEX+Switch+Targets+Channelrhodopsin-2+to+Multiple+Cell+Types+for+Imaging+and+Long-Range+Circuit+Mapping.">A FLEX Switch Targets Channelrhodopsin-2 to Multiple Cell Types for Imaging and Long-Range Circuit Mapping.</a> Journal of Neuroscience. 28, 7025-7030 (2008).</li><li>Deisseroth, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optogenetics.">Optogenetics.</a> Nature Methods. 8, 26-29 (2011).</li><li>Nagel, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Channelrhodopsin-2,+a+directly+light-gated+cation-selective+membrane+channel.">Channelrhodopsin-2, a directly light-gated cation-selective membrane channel.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 100, 13940-13945 (2003).</li><li>Boyden, E. S., Zhang, F., Bamberg, E., Nagel, G., Deisseroth, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Millisecond-timescale+genetically+targeted+optical+control+of+neural+activity.">Millisecond-timescale genetically targeted optical control of neural activity.</a> Nature Neuroscience. 8, 1263-1268 (2005).</li><li>Klapoetke, N. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Independent+optical+excitation+of+distinct+neural+populations.">Independent optical excitation of distinct neural populations.</a> Nature Methods. 11, 338-346 (2014).</li><li>Flotte, T. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+Therapy+Progress+and+Prospects:+Recombinant+adeno-associated+virus+(rAAV)+vectors.">Gene Therapy Progress and Prospects: Recombinant adeno-associated virus (rAAV) vectors.</a> Gene Therapy. 11, 805-810 (2004).</li><li>Aponte-Ubillus, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+design+for+recombinant+adeno-associated+virus+(rAAV)+vector+production.">Molecular design for recombinant adeno-associated virus (rAAV) vector production.</a> Applied Microbiology and Biotechnology. 102, 1045-1054 (2018).</li><li>Kim, C. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simultaneous+fast+measurement+of+circuit+dynamics+at+multiple+sites+across+the+mammalian+brain.">Simultaneous fast measurement of circuit dynamics at multiple sites across the mammalian brain.</a> Nature Methods. 13, 325-328 (2016).</li><li>Lin, J. Y., Knutsen, P. M., Muller, A., Kleinfeld, D., Tsien, R. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ReaChR:+a+red-shifted+variant+of+channelrhodopsin+enables+deep+transcranial+optogenetic+excitation.">ReaChR: a red-shifted variant of channelrhodopsin enables deep transcranial optogenetic excitation.</a> Nature Neuroscience. 16, 1499-1508 (2013).</li><li>Mager, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+frequency+neural+spiking+and+auditory+signaling+by+ultrafast+red-shifted+optogenetics.">High frequency neural spiking and auditory signaling by ultrafast red-shifted optogenetics.</a> Nature Communications. 9, (2018).</li><li>Oda, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crystal+structure+of+the+red+light-activated+channelrhodopsin+Chrimson.">Crystal structure of the red light-activated channelrhodopsin Chrimson.</a> Nature Communications. 9, (2018).</li><li>Hooks, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dual-Channel+Photostimulation+for+Independent+Excitation+of+Two+Populations.">Dual-Channel Photostimulation for Independent Excitation of Two Populations.</a> Current Protocols in Neuroscience. 85, e52 (2018).</li><li>Schild, L. C., Glauser, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dual+Color+Neural+Activation+and+Behavior+Control+with+Chrimson+and+CoChR+in+Caenorhabditis+elegans.">Dual Color Neural Activation and Behavior Control with Chrimson and CoChR in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 200, 1029-1034 (2015).</li><li>Rost, B. R., Schneider-Warme, F., Schmitz, D., Hegemann, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optogenetic+Tools+for+Subcellular+Applications+in+Neuroscience.">Optogenetic Tools for Subcellular Applications in Neuroscience.</a> Neuron. 96, 572-603 (2017).</li><li>Maimon, B. E., Sparks, K., Srinivasan, S., Zorzos, A. N., Herr, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spectrally+distinct+channelrhodopsins+for+two-colour+optogenetic+peripheral+nerve+stimulation.">Spectrally distinct channelrhodopsins for two-colour optogenetic peripheral nerve stimulation.</a> Nature Biomedical Engineering. 2, 485 (2018).</li><li>Asrican, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Next-generation+transgenic+mice+for+optogenetic+analysis+of+neural+circuits.">Next-generation transgenic mice for optogenetic analysis of neural circuits.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li><li>Oliver, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dorsal+cochlear+nucleus+projections+to+the+inferior+colliculus+in+the+cat:+A+light+and+electron+microscopic+study.">Dorsal cochlear nucleus projections to the inferior colliculus in the cat: A light and electron microscopic study.</a> Journal of Comparative Neurology. 224, 155-172 (1984).</li><li>Oliver, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Projections+to+the+inferior+colliculus+from+the+anteroventral+cochlear+nucleus+in+the+cat:+Possible+substrates+for+binaural+interaction.">Projections to the inferior colliculus from the anteroventral cochlear nucleus in the cat: Possible substrates for binaural interaction.</a> Journal of Comparative Neurology. 264, 24-46 (1987).</li><li>Glendenning, K. K., Masterton, R. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acoustic+chiasm:+efferent+projections+of+the+lateral+superior+olive.">Acoustic chiasm: efferent projections of the lateral superior olive.</a> Journal of Neuroscience. 3, 1521-1537 (1983).</li><li>Adams, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ascending+projections+to+the+inferior+colliculus.">Ascending projections to the inferior colliculus.</a> Journal of Comparative Neurology. 183, (1979).</li><li>Winer, J. A., Larue, D. T., Diehl, J. J., Hefti, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Auditory+cortical+projections+to+the+cat+inferior+colliculus.">Auditory cortical projections to the cat inferior colliculus.</a> Journal of Comparative Neurology. 400, 147-174 (1998).</li><li>Salda&#241;a, E., Mercha&#324;, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intrinsic+and+commissural+connections+of+the+rat+inferior+colliculus.">Intrinsic and commissural connections of the rat inferior colliculus.</a> Journal of Comparative Neurology. 319, 417-437 (1992).</li><li>Sivaramakrishnan, S., Sanchez, J. T., Grimsley, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+concentrations+of+divalent+cations+isolate+monosynaptic+inputs+from+local+circuits+in+the+auditory+midbrain.">High concentrations of divalent cations isolate monosynaptic inputs from local circuits in the auditory midbrain.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li><li>Felix, R. A., Gour&#233;vitch, B., Portfors, C. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Subcortical+pathways:+Towards+a+better+understanding+of+auditory+disorders.">Subcortical pathways: Towards a better understanding of auditory disorders.</a> Hearing Research. 362, 48-60 (2018).</li><li>Winer, J. A., Schreiner, C., Winer, J. A., Schreiner, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The inferior colliculus: with 168 illustrations. , (2005).</li><li>Goyer, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+class+of+inferior+colliculus+principal+neurons+labeled+in+vasoactive+intestinal+peptide-Cre+mice.">A novel class of inferior colliculus principal neurons labeled in vasoactive intestinal peptide-Cre mice.</a> eLife. 8, e43770 (2019).</li></ol>

Hemos encontrado que craCM es una técnica poderosa para identificar y caracterizar entradas sinápticas de largo alcance a las neuronas en el IC del ratón. Siguiendo el protocolo detallado aquí, logramos una transfección robusta de las neuronas en el DCN y el IC, así como el tráfico axonal confiable de Chronos y ChrimsonR a terminales sinápticos en el IC. Además, demostramos que esta técnica permite la medición y el análisis de eventos postsinápticos, incluyendo amplitud de PSP, medio ancho, tiempo de decaimi...

Las conexiones sinápticas son críticas para la función del circuito neural, pero la topología precisa y la fisiología de las sinapsis dentro de los circuitos neuronales a menudo son difíciles de sondear experimentalmente. Esto se debe a que la estimulación eléctrica, la herramienta tradicional de la electrofisiología celular, activa indiscriminadamente los axones cerca del sitio de estimulación, y en la mayoría de las regiones cerebrales, los axones de diferentes fuentes (locales, ascendentes y/o descendentes) se entrelazan. Sin embargo, mediante el uso de channelrhodopsin asignación de circuito asistido (CRACM)1,2, esta limitación ahora se puede superar3. Channelrhodopsin (ChR2) es un canal iónico activado por la luz, selectivo de cationes originalmente encontrado en la alga verde Chlamydomonas reinhardtii. ChR2 se puede activar por luz azul de una longitud de onda alrededor de 450-490 nm, despolarizando la célula a través de la afluencia catiónica. ChR2 fue descrito y expresado por primera vez en ovocitos de Xenopus por Nagel y sus colegas4. Poco después, Boyden y sus colegas5 expresaron ChR2 en neuronas de mamíferos y demostraron que podían usar pulsos de luz para controlar de forma fiable el pico en una escala de tiempo de milisegundos, induciendo potenciales de acción de 10 ms después de la activación de ChR2 con luz azul. Recientemente se han encontrado canales optogenéticos con cinética aún más rápida (por ejemplo, Chronos6).
El enfoque básico de un experimento craCM es transfectar una población de neuronas hipotápticas putativas con un virus adeno-asociado recombinante (rAAV) que lleva la información genética para un canalrhodopsin. La transfección de las neuronas con rAAV conduce a la expresión de la canalrodonina codificada. Típicamente, la canalrhodopsina se etiqueta con una proteína fluorescente como GFP (Proteína Fluorescente Verde) o tdTomato (una proteína fluorescente roja), por lo que la transfección de las neuronas en la región objetivo se puede confirmar fácilmente con imágenes de fluorescencia. Debido a que los ARV no son patógenos, tienen un bajo potencial inflamatorio y expresión génica de larga duración7,8, se han convertido en una técnica estándar para entregar clasrodoninas a las neuronas. Si, después de la transfección de una población presináptica putativa de neuronas, la activación de una cedrodrodina a través de destellos de luz provoca potenciales o corrientes postsinápticas en las neuronas objetivo, esto es evidencia de una conexión axonal desde el núcleo transfected a la célula registrada. Debido a que los axones cortados en experimentos de corte de cerebro pueden ser conducidos a liberar neurotransmisor a través de la activación de la cifrodonina, los núcleos que se encuentran fuera de la rebanada aguda pero envían axones a la región del cerebro postsináptico se pueden identificar con CRACM. El poder de esta técnica es que la conectividad y la fisiología de las entradas sinápticas de largo alcance identificadas se pueden investigar directamente.
Además de las cedrodoninas que son excitables por la luz azul, los investigadores han identificado recientemente varias channelrhodopsins de cambio rojo9,10,incluyendo Chrimson y su ChrimsonR analógico más rápido, los cuales están excitados con luz roja de 660 nm6. Las opsins de cambio rojo son de interés porque la luz roja penetra mejor en el tejido que la luz azul, y la luz roja puede tener una citotoxicidad inferior a la luz azul10,11,12. Las cardrepsinas de cambio rojo también abren la posibilidad de experimentos CRACM de doble color, donde la convergencia de axones de diferentes núcleos en la misma neurona se puede probar en un experimento6,13,14. Sin embargo, las operaciones actuales de cambio rojo a menudo exhiben activación cruzada no deseada con luz azul15,16,17, lo que dificulta dos experimentos de color. Además, algunos informes han indicado que ChrimsonR se somete a un tráfico axonal limitado, lo que puede dificultar el uso de ChrimsonR para experimentos CRACM16,17.
Casi todas las proyecciones ascendentes de los núcleos del tronco cerebral auditivo inferior convergen en el colículo inferior (IC), el centro del cerebro medio de la vía auditiva central. Esto incluye proyecciones del núcleo coclear (CN)18,19, la mayor parte del complejo olivar superior (SOC)20,y los núcleos dorsal (DNLL) y ventral (VNLL) del lemnisco lateral21. Además, una gran proyección descendente de la corteza auditiva termina en el IC18,19,20,21,22,y las neuronas IC sí mismas sinapsis ampliamente dentro de los lóbulos locales y contralaterales del IC23. La mezcla de axónes de muchas fuentes ha hecho difícil sondear circuitos IC utilizando la estimulación eléctrica24. Como resultado, a pesar de que las neuronas en el IC realizan cálculos importantes para la localización del sonido y la identificación del habla y otros sonidos de comunicación25,26, la organización de los circuitos neuronales en el IC es en gran medida desconocida. Recientemente identificamos las neuronas VIP como la primera clase de neuronas identificables molecularmente en el IC27. Las neuronas VIP son neuronas estelares glutamatérgicas que se proyectan a varios objetivos de largo alcance, incluyendo el tálamo auditivo y el colículo superior. Ahora somos capaces de determinar las fuentes y la función de las entradas locales y de largo alcance a las neuronas VIP y determinar cómo estas conexiones de circuito contribuyen al procesamiento de sonido.
El protocolo presentado aquí está diseñado para investigar las entradas sinápticas a las neuronas VIP en el IC de los ratones, específicamente desde el IC contralateral y el DCN(Figura 1). El protocolo se puede adaptar fácilmente a diferentes fuentes de entrada, un tipo de neurona diferente o una región cerebral diferente en conjunto. También mostramos que ChrimsonR es un canal de cambio rojo eficaz para el mapeo de circuitos de largo alcance en el tronco encefálico auditivo. Sin embargo, demostramos que ChrimsonR está fuertemente activado por la luz azul, incluso a bajas intensidades, y por lo tanto, para combinar ChrimsonR con Chronos en experimentos CRACM de dos colores, se deben utilizar controles cuidadosos para evitar la activación cruzada de ChrimsonR.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>AAV1.Syn.ChrimsonR-tdTomato.WPRE.bGH</td>
			<td>Addgene</td>
			<td>59171-AAV1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AAV1.Syn.Chronos-GFP.WPRE.bGH</td>
			<td>Addgene</td>
			<td>59170-AAV1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ai14 reporter mice (B6.Cg-Gt(ROSA)26Sortm14(CAG-tdTomato)Hze/J)</td>
			<td>Jackson Laboratory</td>
			<td>stock #007914</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amber (590nm) LUXEON Rebel LED</td>
			<td>Luxeon Star LEDs</td>
			<td>SP-01-A8</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blue (470nm) LUXEON Rebel LED</td>
			<td>Luxeon Star LEDs</td>
			<td>SP-01-B4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Carproject (carprofen)</td>
			<td>Henry Schein Animal Health</td>
			<td>59149</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Drummond glas capillaries</td>
			<td>Drummond Scientific Company</td>
			<td>3-000-203-G/X</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Drummond Nanoject 3</td>
			<td>Drummond Scientific Company</td>
			<td>3-300-207</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Electrode beveler</td>
			<td>Sutter Instrument</td>
			<td>FG-BV10-D</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethilon 6-0 (0.8 metric) nylon sutures</td>
			<td>Ethicon</td>
			<td>local pharmacy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fixed stage microscope</td>
			<td>any</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gas anesthesia head holder</td>
			<td>David Kopf Instruments</td>
			<td>933-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>General surgery tools</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Golden A5 pet clipper</td>
			<td>Oster</td>
			<td>078005-010-003</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heating pad</td>
			<td>Custom build</td>
			<td>N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hooded induction chamber w/ vacuum system</td>
			<td>Patterson Scientific</td>
			<td>78917760</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hot bead sterilizer Steri 250</td>
			<td>Inotech</td>
			<td>IS-250</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Iodine solution 10%</td>
			<td>MedChoice</td>
			<td>local pharmacy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isoflurane vaporizer</td>
			<td>Patterson Scientific</td>
			<td>07-8703592</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lidocain topical jelly 2%</td>
			<td>Akorn</td>
			<td>local pharmacy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micro motor drill 1050</td>
			<td>Henry Schein Animal Health</td>
			<td>7094351</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micro motor drill bits 0.5 mm</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>19007-05</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Motorized Micromanipulator</td>
			<td>Sutter Instrument</td>
			<td>MP-285/R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ophthalmic ointment Artificial Tears</td>
			<td>Akorn</td>
			<td>local pharmacy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>P-1000 electrode puller</td>
			<td>Sutter Instrument</td>
			<td>P-1000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Patch clamp amplifier incl data acquisition software</td>
			<td>any</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Portable anethesia machine</td>
			<td>Patterson Scientific</td>
			<td>07-8914724</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Small animal steroetaxic frame</td>
			<td>David Kopf Instruments</td>
			<td>930-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard chemicals</td>
			<td>local vendors</td>
			<td>N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>standard imaging solutions</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile towel drapes</td>
			<td>Dynarex</td>
			<td>4410</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surgical marker</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>18000-30</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Temperature controller</td>
			<td>Custom build</td>
			<td>N/A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vibratome</td>
			<td>any</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>VIP-IRES-Cre mice (Viptm1(cre)Zjh/J)</td>
			<td>Jackson Laboratory</td>
			<td>stock #010908</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water bath</td>
			<td>any</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

long-range channelrhodopsin-assisted circuit mapping of inferior colliculus neurons with blue and red-shifted channelrhodopsins

Al investigar los circuitos neuronales, una limitación estándar del enfoque de abrazadera de parche in vitro es que los axones de múltiples fuentes a menudo se mezclan, lo que dificulta aislar las entradas de fuentes individuales con estimulación eléctrica. Sin embargo, mediante el uso de la asignación de circuitos asistidos de channelrhodopsin (CRACM), esta limitación ahora se puede superar. Aquí, informamos de un método para utilizar el CRACM para mapear las entradas ascendentes de núcleos de tronco cerebral auditivo inferior y entradas commissurales a una clase identificada de neuronas en el colículo inferior (IC), el núcleo cerebral medio del sistema auditivo. En el IC, los axones locales, comisarios, ascendentes y descendentes están fuertemente entrelazados y, por lo tanto, son indistinguibles con la estimulación eléctrica. Mediante la inyección de una construcción viral para impulsar la expresión de una canalizarpsina en un núcleo presináptico, seguido de la grabación de abrazaderas de parche para caracterizar la presencia y fisiología de entradas sinápticas que expresan la canalizar, proyecciones de una fuente específica a una población específica de neuronas IC se puede mapear con precisión específica del tipo de célula. Mostramos que este enfoque funciona tanto con Chronos, un canal rhodopsin activado por luz azul, como con ChrimsonR, un canal de cambio rojo. A diferencia de los informes anteriores del anteceleo, encontramos que ChrimsonR se trafica sólidamente por los axones de las neuronas principales del núcleo coclear dorsal, lo que indica que ChrimsonR puede ser una herramienta útil para los experimentos CRACM en el tronco cerebral. El protocolo presentado aquí incluye descripciones detalladas de la cirugía de inyección de virus intracraneal, incluyendo coordenadas estereolíticas para apuntar las inyecciones al núcleo coclear dorsal y el IC de los ratones, y cómo combinar la grabación de la abrazadera de parche de células enteras con activación de la cdicrodona para investigar proyecciones de largo alcance a las neuronas IC. Aunque este protocolo está diseñado para caracterizar las entradas auditivas del IC, se puede adaptar fácilmente para investigar otras proyecciones de largo alcance en el tronco cerebral auditivo y más allá.

Cruzamos ratones VIP-IRES-Cre (Viptm1(cre)Zjh/J) y Ai14 Cre-reporter ratones (B6. Cg-Gt(ROSA)26Sortm14(CAG-tdTomato)Hze/J) para generar descendencia F1 en la que las neuronas VIP expresan la proteína fluorescente tdTomato. Se utilizaron descendencia F1 de ambos sexos, envejecida del día postnatal (P) 21 a P70. Un total de 22 animales fueron utilizados en este estudio.
Inyección estereot...

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Long-range Channelrhodopsin-assisted Circuit Mapping of Inferior Colliculus Neurons with Blue and Red-shifted Channelrhodopsins

El mapeo de circuitos asistidos por Cifrodonina (CRACM) es una técnica de precisión para el mapeo funcional de proyecciones neuronales de largo alcance entre grupos de neuronas identificadas anatómicamente y/o genéticamente. Aquí, describimos cómo utilizar craCM para mapear las conexiones del tronco cerebral auditivo, incluyendo el uso de una opsin de cambio rojo, ChrimsonR.

Asignación de circuito asistida por Channelrhodopsin de largo alcance de neuronas coliculus inferiores con Channelrhodopsins de cambio azul y rojo

When investigating neural circuits, a standard limitation of the in vitro patch clamp approach is that axons from multiple sources are often intermixed, ...

La asignación de circuitos asistidos por Channelrhodopsin es una técnica de precisión para el mapeo funcional de proyecciones neuronales de largo alcance. Aquí, mostramos cómo utilizar este enfoque para investigar circuitos en el tallo cerebral auditivo. En las rebanadas cerebrales, los axones de múltiples fuentes a menudo se entremezclan, lo que dificulta aislar las entradas individuales mediante estimulación eléctrica.Mediante el uso de CRACM, esta limitación se puede superar. Encontrar lambda y definir constantemente el sistema de coordenadas estereotaxicas es un reto, al igual que mantener la duración del procedimiento corta. Tener todos los pasos cuidadosamente asignados aumentará su tasa de éxito.Comience por rociar el área de la cirugía con 70%etanol para desinfectar y colocar cortinas de toalla estériles para cubrir el área de la cirugía. Retire la ropa de cama de la jaula para limitar el riesgo de asfixia de la jaula de recuperación. A continuación, coloque una almohadilla de calefacción debajo de la jaula y proporcione una fuente de alimentos y agua.A continuación, transfiera el animal a un marco estereotaxico y continúe con la anestesia. Inserte una sonda de temperatura rectal y encienda el controlador de temperatura homeostático. Luego, aplica pomada oftálmica para evitar que los ojos se sequen.Administrar analgésico preventivo. Por último, afeita el cuero cabelludo con pinzas eléctricas. Desinfectar el cuero cabelludo con tres hisopos alternos de yodo povidona y 70%etanol.Comience la cirugía haciendo una incisión en el cuero cabelludo a lo largo de la línea media, comenzando entre las orejas y continuando rostral a los ojos, exponiendo las suturas lambda y bregma. Empuje la piel hacia un lado y retire el periosteo del hueso expuesto si es necesario. A continuación, marque la sutura lambda con un marcador quirúrgico, coloque la punta del nanoinyector para que esté tocando lambda y cero las coordenadas del micromanipulator.Utilice la punta del nanoinyectores y el micromanibultor para medir la diferencia de elevación entre las suturas lambda y bregma. Ajuste la altura de la barra de paletas para que la expresión y el bregma sufibran a más o menos 100 micrómetros de altura. Mapear el lugar de inyección utilizando la punta del nanoinyectores y el sistema de coordenadas del micromanipador y marcar el sitio con un marcador quirúrgico.A continuación, utilice un taladro micromotor con una rebaba de taladro de 0,5 milímetros para realizar una craneotomía sobre el lugar de inyección. Para asegurar una amplia transfección de las neuronas en el núcleo objetivo, utilice un nano-inyector para hacer inyecciones a varias profundidades en el tejido y en el caso de regiones cerebrales más grandes, como el colliículo inferior, hacer inyecciones en el transcurso de dos o más penetraciones en diferentes coordenadas X e Y. Para inyectar el colicóculo inferior, deposite 20 nanolitros de virus en los intervalos de 250 micrómetros a lo largo del eje Z entre 2, 250 micrómetros y 1, 750 micrómetros de profundidad.Para las inyecciones en el núcleo coclear dorsal, depositar 20 nanolitros de virus a una profundidad de 4, 750 micrómetros y 4, 550 micrómetros respectivamente. Después de inyectar en cada coordenada Z, espere de dos a tres minutos antes de mover el inyector a la siguiente coordenada Z para permitir que el virus se difunda fuera del lugar de inyección, lo que reduce la probabilidad de que el virus sea aspirado por el tracto de inyección cuando se vuelva a colocar el nanoinyentador. Luego, después de la última inyección, espere de tres a cinco minutos antes de retraer el nanoinyector del cerebro.Cuando el nano-inyector se retira del cerebro entre penetraciones y entre animales, expulse un pequeño volumen de virus de la punta para comprobar que la punta no se ha obstruido. Después de las inyecciones, utilice PBS estéril para mojar los bordes cortados del cuero cabelludo y luego mueva suavemente la piel hacia la línea media. Cierre la herida con suturas simples interrumpidas con suturas de nylon 6-0.Luego, aplica de 0,5 a un mililitro de gelatina de 2%lidocaína a la herida. Retire las barras de las orejas y la sonda de temperatura, gire el isoflurano y retire al animal de la barra de paletas y transfiéralo a la jaula de recuperación. Por último, supervise la recuperación de cerca.Una vez que el animal esté completamente despierto, moviéndose y sin mostrar signos de dolor o angustia, transfiera de nuevo a su jaula y devuelva la jaula a la vivarium. Utilice métodos de abrazadera de parche estándar para realizar grabaciones. Comience colocando la rebanada en una cámara de grabación bajo un microscopio vertical de etapa fija y profuso continuamente con líquido cefalorraquídeo artificial a dos mililitros por minuto.A continuación, parchear las neuronas bajo control visual utilizando un amplificador de abrazadera de parche adecuado. Por último, durante las grabaciones al por mayor, active Chronos entregando breves pulsos de luz de 470 nanómetros o ChrimsonR mediante breves pulsos de luz de 580 nanómetros a través de LED disponibles en el mercado. Los resultados indicaron que la inyección de ChrimsonR condujo a una expresión fuerte en el DCN con fluorescencia tdTomato visible en células y fibras.En la CPI contralateral, las fibras fuertemente etiquetadas con tdTomato eran claramente visibles después de tres semanas, demostrando la capacidad de tráfico de largo alcance de la construcción ChrimsonR-tdTomato cuando se inyecta en núcleos del tallo cerebral auditivo. La activación óptica de ChrimsonR provocó EPSP en neuronas VIP IC, lo que indica que ChrimsonR es una herramienta útil para experimentos CRACM de largo alcance cuando los parámetros experimentales exigen el uso de luz roja en lugar de luz azul. Sin embargo, encontramos que ChrimsonR se activó fácilmente con luz azul, mostrando el mismo umbral para la activación de la luz azul que Chronos.Para este protocolo es más importante asegurarse de que las coordenadas estereotaxicas son correctas y confirmar que el virus se expresó sólo en su región cerebral objetivo. Al intercambiar el viroconstrucción De Chronos ChrimsonR con un virus diferente, por ejemplo, un virus Flex específico de la célula, puede responder a varias preguntas anatómicas o fisiológicas sin cambiar el protocolo de cirugía.

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Functional Mapping with Simultaneous MEG and EEG

Mapeo funcional con MEG y EEG simultáneo

We use magnetoencephalography (MEG) and electroencephalography (EEG) to locate and determine the temporal evolution in brain areas involved in the ...

Investigación

Neurociencias

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Estudio genético de la regeneración axonal en neuronas cultivadas de Adultos ganglio de la raíz dorsal

It is well known that mature neurons in the central nervous system (CNS) cannot regenerate their axons after injuries due to diminished intrinsic ability ...

Intracellular Recording, Sensory Field Mapping, and Culturing Identified Neurons in the Leech, Hirudo medicinalis

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Intracelular de grabación, Sensorial Asignación de campos, y el cultivo de neuronas identificadas en el Leech, Hirudo medicinalis</i

The freshwater leech, Hirudo medicinalis, is a versatile model organism that has been used to address scientific questions in the fields of ...

Whole Mount Immunolabeling of Olfactory Receptor Neurons in the Drosophila Antenna

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Todo el montaje de Immunolabeling olfativa del receptor de las neuronas en el<em&gt; Drosophila</em&gt; Antena

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3-D Imaging and Analysis of Neurons Infected In Vivo with Toxoplasma gondii

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Imaging 3-D y Análisis de neuronas infectadas<em&gt; En Vivo</em&gt; Con<em&gt; Toxoplasma gondii</em

Toxoplasma gondii is an obligate, intracellular parasite with a broad host range, including humans and rodents. In both humans and rodents, Toxoplasma ...

Whole-cell Patch-clamp Recordings for Electrophysiological Determination of Ion Selectivity in Channelrhodopsins

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Wide-field single photon voltage-sensitive dye (VSD) imaging of brain slice preparations is a useful tool to assess the functional connectivity in neural ...

Meta-analysis of Voxel-Based Neuroimaging Studies using Seed-based d Mapping with Permutation of Subject Images (SDM-PSI)

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Ex Vivo Optogenetic Interrogation of Long-Range Synaptic Transmission and Plasticity from Medial Prefrontal Cortex to Lateral Entorhinal Cortex

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Ex Vivo Interrogación optogenética de la transmisión sináptica de largo alcance y la plasticidad de la corteza prefrontal medial a la corteza entorrinal lateral

Studying the physiological properties of specific synapses in the brain, and how they undergo plastic changes, is a key challenge in modern neuroscience. ...