Name: visualization and analysis of pharyngeal arch arteries using whole-mount immunohistochemistry and 3d reconstruction
Uploaded: 2020-03-31T14:00:00
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Wir danken Brianna Alexander, Caolan O'Donnell und Michael Warkala für die sorgfältige Lektüre und Bearbeitung dieses Manuskripts. Diese Arbeit wurde durch die Finanzierung durch das National Heart, Lung and Blood Institute des NIH R01 HL103920, R01 HL134935, R21 OD025323-01 bis SA unterstützt; AJR wird unterstützt von NHLBI HL103920-08S1 und dem National Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases Training Grant T32052283-11.

Die Verwendung und die Verfahren für Tiere wurden vom Institutional Animal Care and Use Committee der Rutgers University genehmigt.
1. Vorbereitung von Lösungen
<ol><li>1 L Phosphat gepufferte Salin mit 0,1% Triton-X-100 (PBST) und Filtersterilisieren vorbereiten. Diese Lösung kann mindestens ein Jahr lang bei Raumtemperatur (RT) gelagert werden.</li>
	<li>Bereiten Sie 600 l Blockierpuffer vor, der aus 10 % des normalen Eselsserums in PBST besteht. Machen Sie diese Lösung jedes Mal frisc...

<ol>
	<li>Hiruma, T., Nakajima, Y., Nakamura, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+pharyngeal+arch+arteries+in+early+mouse+embryo.">Development of pharyngeal arch arteries in early mouse embryo.</a> Journal of Anatomy. 201 (1), 15-29 (2002).</li><li>Hutson, M. R., Kirby, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Model+systems+for+the+study+of+heart+development+and+disease+Cardiac+neural+crest+and+conotruncal+malformations.">Model systems for the study of heart development and disease Cardiac neural crest and conotruncal malformations.</a> Seminars in Cell &amp; Developmental Biology. 18 (1), 101-110 (2007).</li><li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endothelium+in+the+pharyngeal+arches+3,+4+and+6+is+derived+from+the+second+heart+field.">Endothelium in the pharyngeal arches 3, 4 and 6 is derived from the second heart field.</a> Developmental Biology. 421 (2), 108-117 (2017).</li><li>Jerome, L. A., Papaioannou, V. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DiGeorge+syndrome+phenotype+in+mice+mutant+for+the+T-box+gene,+Tbx1.">DiGeorge syndrome phenotype in mice mutant for the T-box gene, Tbx1.</a> Nature Genetics. 27 (3), 286-291 (2001).</li><li>Lindsay, E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tbx1+haploinsufficieny+in+the+DiGeorge+syndrome+region+causes+aortic+arch+defects+in+mice.">Tbx1 haploinsufficieny in the DiGeorge syndrome region causes aortic arch defects in mice.</a> Nature. 410 (6824), 97-101 (2001).</li><li>Weninger, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualising+the+Cardiovascular+System+of+Embryos+of+Biomedical+Model+Organisms+with+High+Resolution+Episcopic+Microscopy+(HREM).">Visualising the Cardiovascular System of Embryos of Biomedical Model Organisms with High Resolution Episcopic Microscopy (HREM).</a> Journal of Cardiovascular Development and Disease. 5 (4), 58 (2018).</li><li>Phillips, H. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pax9+is+required+for+cardiovascular+development+and+interacts+with+Tbx1+in+the+pharyngeal+endoderm+to+control+4th+pharyngeal+arch+artery+morphogenesis.">Pax9 is required for cardiovascular development and interacts with Tbx1 in the pharyngeal endoderm to control 4th pharyngeal arch artery morphogenesis.</a> Development. 146 (18), (2019).</li><li>Vlaeminck-Guillem, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Ets+family+member+Erg+gene+is+expressed+in+mesodermal+tissues+and+neural+crests+at+fundamental+steps+during+mouse+embryogenesis.">The Ets family member Erg gene is expressed in mesodermal tissues and neural crests at fundamental steps during mouse embryogenesis.</a> Mechanisms of Development. 91 (1-2), 331-335 (2000).</li><li>Ert&#252;rk, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+imaging+of+the+unsectioned+adult+spinal+cord+to+assess+axon+regeneration+and+glial+responses+after+injury.">Three-dimensional imaging of the unsectioned adult spinal cord to assess axon regeneration and glial responses after injury.</a> Nature Medicine. 18 (1), 166-217 (2012).</li><li>Azaripour, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+survey+of+clearing+techniques+for+3D+imaging+of+tissues+with+special+reference+to+connective+tissue.">A survey of clearing techniques for 3D imaging of tissues with special reference to connective tissue.</a> Progress in Histochemistry and Cytochemistry. 51 (2), 9-23 (2016).</li><li>Richardson, D. S., Lichtman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clarifying+Tissue+Clearing.">Clarifying Tissue Clearing.</a> Cell. 162 (2), 246-257 (2015).</li><li>Becker, K., J&#228;hrling, N., Saghafi, S., Weiler, R., Dodt, H. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+Clearing+and+Dehydration+of+GFP+Expressing+Mouse+Brains.">Chemical Clearing and Dehydration of GFP Expressing Mouse Brains.</a> PLoS One. 7 (3), e33916 (2012).</li><li>Ert&#252;rk, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+imaging+of+solvent-cleared+organs+using+3DISCO.">Three-dimensional imaging of solvent-cleared organs using 3DISCO.</a> Nature Protocols. 7 (11), 1983-1995 (2012).</li><li>Kuwajima, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ClearT:+a+detergent-+and+solvent-free+clearing+method+for+neuronal+and+non-neuronal+tissue.">ClearT: a detergent- and solvent-free clearing method for neuronal and non-neuronal tissue.</a> Development. 140 (6), 1364-1368 (2013).</li></ol>

Die Möglichkeit, das Endothel in Mausembryonen in 3D zu visualisieren, hat neue Einblicke in ihre Entwicklung 3gegeben. Hier stellen wir ein Protokoll vor, das eine hochauflösende 3D-Bildgebung von Embryonen, die Visualisierung der vaskulären Konnektivität und quantitative Analysen der PAA-Bildung ermöglicht. Dieses Protokoll kann verwendet werden, um zu sehen, wie genetische Veränderungen oder Umweltbeleidigungen die ENTWICKLUNG der PAA beeinflussen. Das hier beschriebene Verfahren verwende...

Während der Mausembryogenese entstehen Pharyngealbogenarterien (PAAs) als symmetrische, bilaterale Arterienpaare, die das Herz mit der dorsalen Aortae1verbinden. Während sich der Embryo entwickelt, gehen das erste und zweite PAAs-Paar zurück, während die3.,4.und6. PAAs eine Reihe asymmetrischer Umbauereignisse durchlaufen, um die Aortenbogenarterien zu bilden2.
Die PAAs 3, 4 und 6 entwickeln sich über Vaskulogenese, die die de novo Bildung von Blutgefäßen3ist. Defekte bei der Bildung oder Umgestaltung dieser Bogenarterien führen zu verschiedenen angeborenen Herzfehlern, wie sie bei Patienten mit DiGeorge-Syndrom4,5beobachtet werden. Daher kann das Verständnis von Mechanismen, die die Entwicklung von PAAs regulieren, zu einem besseren Verständnis der angeborenen Herzkrankheit (CHD) Ätiologie führen.
Aktuelle Ansätze zur Visualisierung und Analyse der PAA-Entwicklung umfassen die Immunfluoreszenz von Gewebeabschnitten, Gefäßabgüsse, Indien-Tinteninjektion, hochauflösende episkopische Mikroskopie und/oder Ganzleitimmunhistochemie1,4,5,6,7. Hierin beschreiben wir ein Protokoll, das Immunfluoreszenz, konfokale Mikroskopie und 3D-Bildwiedergabe kombiniert, um volumetrische Daten, vaskuläre Konnektivität und Zellidentität zu sammeln, zu analysieren und zu quantifizieren. Darüber hinaus beschreiben wir eine Methode zur Abschottung und Quantifizierung der Anzahl der ECs in jedem Rachenbogen als Mittel zur Untersuchung der Bildung des Pharyngealbogen-Gefäßplexus und dessen Umgestaltung in die PAAs. Während dieses Protokoll für die Analyse der PAA-Entwicklung entwickelt wurde, kann es verwendet werden, um andere sich entwickelnde Gefäßnetzwerke zu analysieren.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>10x PBS</td>
			<td>MP Biomedicals</td>
			<td>PBS10X02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>20x water immersion objective</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>MRD77200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose</td>
			<td>Bio-Rad Laboratories</td>
			<td>1613101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor 488 anti-goat</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A-11055</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor 555 anti-mouse</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A-31570</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Analysis Software</td>
			<td>Imaris 9.2.0</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Benzyl Alcohol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>305197</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Benzyl Benzoate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>8.18701.0100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cover Slips</td>
			<td>VWR</td>
			<td>16004-312</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI (5 mg/mL stock)</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>D3571</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf Tubes (2.0 mL)</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>05-408-138</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol</td>
			<td>VWR</td>
			<td>89370-084</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Falcon tubes (50 mL)</td>
			<td>Corning</td>
			<td>352098</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fast wells</td>
			<td>Grace Bio Labs</td>
			<td>664113</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forceps</td>
			<td>Roboz</td>
			<td>RS-5015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat anti-VEGFR2</td>
			<td>R&#38;D Systems, Inc.</td>
			<td>AF644</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>VWR</td>
			<td>BDH1135-4LP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>A1HD25</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse anti-ERG</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab214341</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Normal Donkey Serum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D9663</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15710</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pasteur pipets</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>13-678-20D</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dishes (35 mm)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>32-103</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dishes (60 mm)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>32-105</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic Molds</td>
			<td>VWR</td>
			<td>18000-128</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Scapels</td>
			<td>Exelint International Co.</td>
			<td>29552</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton-X-100</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP 151-500</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

visualization and analysis of pharyngeal arch arteries using whole-mount immunohistochemistry and 3d reconstruction

Unsachgemäße Bildung oder Umgestaltung der Pharyngealbogenarterien (PAAs) 3, 4 und 6 tragen zu einigen der schwersten Formen der angeborenen Herzkrankheit bei. Um die Bildung von PAAs zu untersuchen, entwickelten wir ein Protokoll mit ganzer Immunfluoreszenz in Verbindung mit Benzylalkohol/Benzylbenzoat (BABB) Gewebeclearing und konfokaler Mikroskopie. Dies ermöglicht die Visualisierung des Pharyngealbogenendothel summieren bei feiner Zellauflösung sowie die 3D-Konnektivität der Vaskulatur. Mithilfe von Software haben wir ein Protokoll zur Quantifizierung der Anzahl der Endothelzellen (ECs) in PAAs sowie der Anzahl der ECs innerhalb des Gefäßplexus, der die PAAs in den Pharyngealbögen 3, 4 und 6 umgibt, erstellt. Wenn sie auf den gesamten Embryo angewendet wird, bietet diese Methode eine umfassende Visualisierung und quantitative Analyse der embryonalen Vaskulatur.

Das hier vorgestellte Immunfluoreszenzprotokoll mit ganzer Montaterzeugtkeit liefert klare und saubere Ergebnisse, die eine 3D-Rekonstruktion des Pharyngealbogenendothel ermöglichen, wie in Abbildung 1Adargestellt. Es ist wichtig, Embryonen für eine ausreichende Zeit in jeder Antikörperlösung zu inkubieren, um eine vollständige Penetration durch die Probe zu gewährleisten, sowie, gründlich waschen Embryonen nach Derinkubation. In <stro...

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Visualization and Analysis of Pharyngeal Arch Arteries using Whole-mount Immunohistochemistry and 3D Reconstruction

Hier beschreiben wir ein Protokoll zur Visualisierung und Analyse der Rachenbogenarterien 3, 4 und 6 von Mausembryonen mit ganzer Immunfluoreszenz, Gewebeklärung, konfokaler Mikroskopie und 3D-Rekonstruktion.

Visualisierung und Analyse von Pharyngeal Arch Arterien mittels ganzer Immunhistochemie und 3D-Rekonstruktion

Improper formation or remodeling of the pharyngeal arch arteries (PAAs) 3, 4, and 6 contribute to some of the most severe forms of congenital heart ...

Mit dieser Methode kann jeder Rachenbogen unterteilt werden. Endothelzellzahlen können dann in jedem Bogen quantifiziert werden, um die Entwicklung der Pharyngealbogenarterie zu untersuchen. Die Hauptvorteile dieses Ansatzes sind die Fähigkeit, die Beziehung zwischen verschiedenen Gefäßstrukturen zu visualisieren und die Fähigkeit, quantitativ zu bestimmen, wie sich die Strukturen auf die Mutanten auswirkten.Aortenbogenarterien werden häufig bei angeborenen Herzerkrankungen mutiert. Unsere Methode ermöglicht die Untersuchung, wie Mutationen den physiologischen Prozess der Gefäßbildung und -umgestaltung verändern. Obwohl wir diese Methode verwenden, um Einblicke in die Mechanismen der angeborenen Herzkrankheit zu gewinnen, kann sie auf andere Systeme angewendet werden, insbesondere mit dem Aufkommen der Lichtbogenmikroskopie.Beginnen Sie mit einer Glaspipette, um jeden Maus-Embryonaltag 9,5 oder 10,5 Embryo in einzelne zwei Milliliter-Röhren mit einem Milliliter PBS zu übertragen. Nach der Fixierung verwenden Sie feine Zangen, um den Embryo vorsichtig über dem Hinterglied zu kneifen und einen Querschnitt zu machen, um die hintere Hälfte des Embryos zu entfernen. Um die Embryonen zu permeabilisieren, ersetzen Sie das PBS durch PBST und platzieren Sie die Embryonen über Nacht bei vier Grad Celsius mit sanfter Erregung.Ersetzen Sie am nächsten Tag den PBST durch 600 Mikroliter Sperrpuffer, ohne die Embryonen für eine 16- bis 18-stündige Inkubation bei vier Grad Celsius mit sanfter Rührung zu berühren. Ersetzen Sie am nächsten Morgen den Sperrpuffer durch 600 Mikroliter des primären, interessierenden Antikörpers pro Röhre für eine vier- bis fünftägige Inkubation bei vier Grad Celsius mit sanfter Rührung. Am Ende der Inkubation die Embryonen in einem Milliliter PBST vier bis fünf Stunden waschen, mit sanfter Erregung bei Raumtemperatur, die die PBS stündlich ändert, gefolgt von einer nächtlichen Inkubation in frischem PBST bei vier Grad Celsius und vier bis fünf zusätzlichen einstündigen Wähteilen am nächsten Tag.Nach der letzten Wäsche den PBST in jedem Rohr durch 600 Mikroliter der entsprechenden Sekundärantikörperlösung für eine vier- bis fünftägige Inkubation bei vier Grad Celsius ersetzen. Waschen Sie die Embryonen am Ende der Inkubation in einem Milliliter frischer PBST pro Wäsche, wie gerade gezeigt, und verwenden Sie eine Glaspipette, um jeden Embryo sanft in einzelne Kunststoffparaffinformen zu übertragen. Entfernen Sie vorsichtig jeden PBST um jeden Embryo herum und orientieren Sie jeden Embryo in einer sagittalen Position.Dann fügen Sie schnell etwa 500 Mikroliter heiße Agarose zu jeder Form, bis jeder Embryo ist nur bedeckt und legen Sie die Formen auf Eis mit Aluminiumfolie bedeckt, bis die Agarose verfestigt hat. Zur Dehydrierung der embryonalen Proben verwenden Sie ein sauberes Skalpell, um einen Block Agarose um jeden Embryo zu schneiden und die Agarose mit Zangen zu erfassen, um die Agarose für den Transfer in eine beschriftete Zwei-Milliliter-Röhre mit einem Milliliter 25%Methanol zu erfassen. Nach einer einstündigen Inkubation mit sanfter Erregung im Dunkeln 25% Methanol durch einen Milliliter 50% Methanol pro Tube für eine zusätzliche einstündige Inkubation im Dunkeln ersetzen.Nach dem Ende der Austrocknung das 100%methanol durch einen Milliliter 50%BABB für eine einstündige Inkubation mit sanfter Erregung im Dunkeln ersetzen. Am Ende der Inkubation die 50%BABB durch einen Milliliter 100%BABB pro Röhre für eine einstündige Inkubation mit sanfter Unruhe im Dunkeln ersetzen, gefolgt von einer zweiten Inkubation mit 100%BABB, wie gerade gezeigt. Um die Embryonen für die Bildgebung zu montieren, entfernen Sie den Klebstoff aus einem schnellen Brunnenstoßfänger und legen Sie den Stoßfänger auf eine 24 mal sechs Milliliter Nummer 1,5 Glasabdeckung.Tragen Sie sanften Druck auf den Klebstoff auf, um Luftblasen zwischen dem Deckelund der Stoßstange zu entfernen und die 100%BABB vorsichtig aus jedem Rohr zu entsorgen. Dann verwenden Sie feine Zangen, um den Embryo vorsichtig in den schnellen Brunnen zu übertragen, ohne den Embryo zu berühren und legen Sie einen zweiten Deckelrutsch auf die Stoßstange. Um das Endothel im gesamten dritten Pharyngealbogen zu beschaffen, öffnen Sie das Bild von Interesse an der Software und klicken Sie auf neue Oberfläche hinzufügen.Doppelklicken Sie auf Fläche eins, und benennen Sie die neue Fläche in dritten Pharyngealbogen um. Wählen Sie automatische Erstellung überspringen, manuell bearbeiten und die Oberflächenausrichtung auf die YZ-Ebene festlegen. Verwenden Sie die Schnittposition, um die dritte Pharyngealbogen-Oberflächenebene an die Stelle zu platzieren, an der sich die dritte PAA und die dorsale Aorta verbinden.Drehen Sie das Bild so, dass die dritte Pharyngealbogen-Oberflächenebene sichtbar ist, und deaktivieren Sie den Orthoschneider. Wählen Sie im Zeichnungsmodus die Funktion des Abstandszeichnungsmodus aus und passen Sie die Parametereinstellungen nach Bedarf an. Wenn alle Parameter festgelegt sind, drücken Sie die Escape-Taste und klicken Sie auf Zeichnen, um den Umfang des dritten Rachenbogens mit dem Mauszeiger zu verfolgen.Verwenden Sie dann die Slice-Position, um 10 bis 25 Scheiben zu verschieben und den Umfang des Rachenbogens nachzuverfolgen. Wenn der gesamte Bogen nachverfolgt wurde, klicken Sie auf Fläche erstellen, um die Oberfläche des verfolgten Bereichs zu generieren. Um die oberflächenbeschaffenen Strukturen zu maskieren, wählen Sie im Bearbeitungsmenü die Maskenauswahl für die dritte PAA und DAPI aus, und klicken Sie auf OK. Benennen Sie dann den neuen Kanal in PAA DAPI um.Wiederholen Sie diesen Schritt für die verbleibenden Kanäle. Um den Endothelplexus getrennt von der PAA zu visualisieren, wählen Sie die Maskenauswahl für die dritte PAA und DAPI aus. Deaktivieren Sie die Option Voxel außerhalb der Oberfläche, und überprüfen Sie die Option Voxel innerhalb der Oberfläche.Setzen Sie die Auswahl der Voxel innerhalb der Oberfläche auf Null und klicken Sie auf OK. Benennen Sie den neuen Kanal in Nicht-PAA-DAPI um. Wiederholen Sie diesen Schritt für die verbleibenden Kanäle. Wählen Sie die Maskenauswahl für den dritten PA aus, und wählen Sie nicht-PAA-DAPI aus, und klicken Sie auf OK. Benennen Sie den neuen Kanal in plexus DAPI um.Wiederholen Sie diesen Schritt für die verbleibenden Kanäle. Um die einzelnen Endothelzellen innerhalb jeder Interessenstruktur im Display-Anpassungspanel zu quantifizieren, schalten Sie alle Kanäle außer dem PAA ERG-Kanal aus. Klicken Sie im Menü Eigenschaften auf Neue Flecken hinzufügen, und klicken Sie auf , um die Orte umzubenennen, bei der die Gesamtzahl der Endothelzellen als PAA angezeigt wird.Klicken Sie auf den blauen Pfeil und wählen Sie den PAA ERG-Kanal für den Quellkanal aus. Passen Sie den geschätzten XY-Durchmesser auf vier Mikrometer an, und klicken Sie auf den blauen Pfeil, um zum nächsten Bedienfeld zu gelangen. Verwenden Sie die Gleiterskala, um die Anzahl der Flecken anzupassen, um sicherzustellen, dass jeder ERG-positive Endothelzellkern durch einen Punkt dargestellt wird.Klicken Sie als Nächstes auf den grünen Doppelpfeil und schalten Sie den PAA ERG-Kanal im Anzeige-Anpassungsfenster aus. Aktivieren Sie den PAA VEGFR2-Kanal, um das PAA-Endothel zu visualisieren, und klicken Sie auf Bearbeiten und Hinzufügen/Löschen, um die Oberfläche des Objekts auszuwählen. Drücken Sie dann Escape und halten Sie die Umschalttaste gedrückt, um alle Punkte zu löschen, die nicht VEGFR2 positiv sind, und klicken Sie auf die Registerkarte Statistik, um die Gesamtzahl der Endothelzellen zu bestimmen.Die Immunfluoreszenz der ganzen Halterung liefert klare und saubere Ergebnisse, die die 3D-Rekonstruktion des Pharyngealbogenendothel ermöglichen. In diesem Bild ist das Vorhandensein der großen hellen Punkte das Ergebnis von Partikeln im Antikörper oder blockierenden Pufferlösungen. Nach der Pharyngealbogen- und PAA-Oberflächenfärbung ermöglicht die Verwendung der Maskenfunktion, die oberflächeten Bereiche visuell zu trennen und unabhängig zu analysieren.Die Maskierung ermöglicht auch die individuelle Analyse und Quantifizierung von Endothelzellnummern innerhalb jeder Struktur. Hier wurde z. B. das Spot-Feature verwendet, um die Gesamtzahl der Endothelzellen sowohl in der PAA als auch im Plexus zu quantifizieren, indem jedem Kern, der ERG exzessiiert, ein einziger Punkt zugewiesen wurde. In diesem Bild kann ein ERG-positiver VEGFR2-Negativpunkt beobachtet werden, der durch die Spotfunktion erzeugt wurde.Daher ist es wichtig zu überprüfen, ob jeder von der Software erkannte Punkt tatsächlich eine einzelne Endothelzelle darstellt. Um saubere und klare Bilder zu erhalten, denken Sie daran, alle Lösungen herunterzuspinnen und jeden Embryo nach Antikörper-Inkubationen richtig und gründlich zu waschen. Es ist wichtig, sich daran zu erinnern, dass BABB ätzend und giftig ist.Behandeln und entsorgen Sie das Lösungsmittel ordnungsgemäß und achten Sie darauf, die geschmolzenen Embryonen vollständig zu versiegeln, um EIN Leck in BABB zu verhindern.

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Ex Vivo Culture of Pharyngeal Arches to Study Heart and Muscle Progenitors and Their Niche

Ex Vivo Culture of Pharyngeal Arches to Study Heart and Muscle Progenitors and Their Niche

Ex-vivo-Kultur von Schlundbögen auf Herz und Muskelvorläuferzellen und ihre Nische Studieren

The pharyngeal mesoderm of developing embryos contributes to broad regions of head and heart musculature. We have developed a novel method to study head ...

Forschung

Entwicklungsbiologie

Organ Culture and Whole Mount Immunofluorescence Staining of Mouse Wolffian Ducts

Orgel, Kultur und Ganze Berge Immunfluoreszenzanfärbung von Maus Wolffschen Gänge

Tubal morphogenesis is a fundamental requirement for the development of most mammalian organs, including the male reproductive system. The epididymis, an ...

Visualization and Quantitative Analysis of Embryonic Angiogenesis in Xenopus tropicalis

Visualization and Quantitative Analysis of Embryonic Angiogenesis in Xenopus tropicalis

Visualisierung und quantitative Analyse der embryonalen Angiogenese in<em&gt; Xenopus tropicalis</em

Blood vessels supply oxygen and nutrients throughout the body, and the formation of the vascular network is under tight developmental control. The ...

Horizontal Whole Mount: A Novel Processing and Imaging Protocol for Thick, Three-dimensional Tissue Cross-sections of Skin

Horizontale Ganze Mount: Ein neuartiges Verarbeitungs- und Imaging-Protokoll für dickes, dreidimensionales Gewebequerschnitt der Haut

Processing a tissue of interest to generate a microscopic image that supports a scientific argument can be challenging. The acquisition of high-quality ...

Visualizing Multiciliated Cells in the Zebrafish Through a Combined Protocol of Whole Mount Fluorescent In Situ Hybridization and Immunofluorescence

Visualizing Multiciliated Cells in the Zebrafish Through a Combined Protocol of Whole Mount Fluorescent In Situ Hybridization and Immunofluorescence

Visualisierung von Multiciliated Zellen in der Zebrabärbling durch ein kombiniertes Protokoll der ganze Berg Leuchtstofflampen In Situ Hybridisierung und Immunfluoreszenz

In recent years, the zebrafish embryo has emerged as a popular model to study developmental biology due to traits such as ex utero embryo development and ...

Whole-mount Clearing and Staining of Arabidopsis Flower Organs and Siliques

Whole-mount Clearing and Staining of Arabidopsis Flower Organs and Siliques

Vollständig-hängen Clearing und Färbung des Arabidopsis Blume Organe und Siliques

Due to its formidable tools for molecular genetic studies, Arabidopsis thaliana is one of the most prominent model species in plant biology and, ...

Quantitative Whole-mount Immunofluorescence Analysis of Cardiac Progenitor Populations in Mouse Embryos

Quantitative ganze-Mount Immunfluoreszenz Analyse der kardialen Vorläuferzellen Populationen in Mausembryonen

The use of ever-advancing imaging techniques has contributed broadly to our increased understanding of embryonic development. Pre-implantation development ...

Whole Mount Immunofluorescence and Follicle Quantification of Cultured Mouse Ovaries

Ganze Mount Immunfluoreszenz und Follikel Quantifizierung der kultivierten Maus Eierstöcke

Research in the field of mammalian reproductive biology often involves evaluating the overall health of ovaries and testes. Specifically, in females, ...

Visualizing the Node and Notochordal Plate In Gastrulating Mouse Embryos Using Scanning Electron Microscopy and Whole Mount Immunofluorescence

Visualisierung der Knoten und Notochordal Platte In Gastrulating Maus-Embryonen mittels Rasterelektronenmikroskopie und ganze Mount Immunfluoreszenz

The post-implantation mouse embryo undergoes major shape changes after the initiation of gastrulation and morphogenesis. A hallmark of morphogenesis is ...

Dissection of the Drosophila Pupal Retina for Immunohistochemistry, Western Analysis, and RNA Isolation

Dissection of the Drosophila Pupal Retina for Immunohistochemistry, Western Analysis, and RNA Isolation

Dissektion der Drosophila Pupal Netzhaut Immunohistochemistry, westlichen Analyse und RNA-Isolation

The Drosophila pupal retina provides an excellent model system for the study of morphogenetic processes during development. In this paper, we present a ...