Name: separation of bioactive small molecules, peptides from natural sources and proteins from microbes by preparative isoelectric focusing (ief) method
Uploaded: 2020-06-14T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Separation of Bioactive Small Molecules, Peptides from Natural Sources and Proteins from Microbes by Preparative Isoelectric Focusing IEF Method at JoVE.com

우리는 GV에 각각, BRIEF와 IRA 상을위한 생물학과 존슨 암 연구 센터의 자금 출처에 감사드립니다. 또한 RV에 대한 K-INBRE 박사 후 상을 수상해 주셔서 감사합니다. 이 작품은 보조금 번호 P20 GM103418에서 건강의 국립 연구소의 국립 일반 의학 연구소에서 기관 개발 상 (IDeA)에 의해 부분적으로 지원되었다. 콘텐츠는 전적으로 저자의 책임이며 반드시 국립 일반 의학 연구소 또는 국립 보건 원의 공식 견해를 나타내는 것은 아닙니다. 익명의 검토자에게 유용한 의견을 전해 주셔서 감사합니다.

1. 표준 액체 상 IEF 장치의 설치 및 사전 실행
<ol><li>사용 설명서에 따라 각각의 교환 멤브레인과 함께 액체 위상 IEF 전극(양극-빨간색 버튼 및 음극-블랙 버튼)을 조립합니다(재료표참조). 새로운 멤브레인을 사용할 때 0.1 M NaOH 및 양이온 교환 멤브레인을 0.1 M H3PO4로 최소 16시간 동안 상화한다.<ol>
<li>멤브레인을 전해질(0.1M NaOH 또는 0.1 M H3PO4)에저장하?...

<ol>
	<li>Jankowska, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimized+procedure+of+extraction,+purification+and+proteomic+analysis+of+nuclear+proteins+from+mouse+brain.">Optimized procedure of extraction, purification and proteomic analysis of nuclear proteins from mouse brain.</a> Journal of Neuroscience Methods. 261, 1-9 (2016).</li><li>Pergande, M. R., Cologna, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isoelectric+Point+Separations+of+Peptides+and+Proteins.">Isoelectric Point Separations of Peptides and Proteins.</a> Proteomes. 5 (1), (2017).</li><li>Stoyanov, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=IEF-based+multidimensional+applications+in+proteomics:+toward+higher+resolution.">IEF-based multidimensional applications in proteomics: toward higher resolution.</a> Electrophoresis. 33 (22), 3281-3290 (2012).</li><li>Vesterberg, O. A. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Method of Isoelectric Fractionation. , (1964).</li><li>Vesterberg, O., Svensson, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isoelectric+fractionation,+analysis,+and+characterization+of+ampholytes+in+natural+pH+gradients.+IV.+Further+studies+on+the+resolving+power+in+connection+with+separation+of+myoglobins.">Isoelectric fractionation, analysis, and characterization of ampholytes in natural pH gradients. IV. Further studies on the resolving power in connection with separation of myoglobins.</a> Acta Chemica Scandinavica. 20 (3), 820-834 (1966).</li><li>Righetti, P. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Isoelectric Focusing: Theory, Methodology and Applications. , 1 (1983).</li><li>Vesterberg, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+Isoelectric+Fractionation+of+Carrier+Ampholytes.">Synthesis and Isoelectric Fractionation of Carrier Ampholytes.</a> Acta Chemica Scandinavica. 23, 2653-2666 (1969).</li><li>Bier, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recycling+isoelectric+focusing+and+isotachophoresis.">Recycling isoelectric focusing and isotachophoresis.</a> Electrophoresis. 19 (7), 1057-1063 (1998).</li><li>Bier, M., Palusinski, O. A., Mosher, R. A., Saville, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electrophoresis:+mathematical+modeling+and+computer+simulation.">Electrophoresis: mathematical modeling and computer simulation.</a> Science. 219 (4590), 1281-1287 (1983).</li><li>Ayala, A., Parrado, J., Machado, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+Rotofor+preparative+isoelectrofocusing+cell+in+protein+purification+procedure.">Use of Rotofor preparative isoelectrofocusing cell in protein purification procedure.</a> Applied Biochemistry and Biotechnology. 69 (1), 11-16 (1998).</li><li>Wagner, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+dipeptidyl+peptidase+IV+(DP+4)+isoforms+from+porcine+kidney+by+preparative+isoelectric+focusing+to+improve+crystallization.">Isolation of dipeptidyl peptidase IV (DP 4) isoforms from porcine kidney by preparative isoelectric focusing to improve crystallization.</a> Biological Chemistry. 392 (7), 665-677 (2011).</li><li>Hosken, B. D., Li, C., Mullappally, B., Co, C., Zhang, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+Characterization+of+Monoclonal+Antibody+Charge+Variants+by+Free+Flow+Isoelectric+Focusing.">Isolation and Characterization of Monoclonal Antibody Charge Variants by Free Flow Isoelectric Focusing.</a> Analytical Chemistry. 88 (11), 5662-5669 (2016).</li><li>Yu, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Francisella+tularensis+T-cell+antigen+identification+using+humanized+HLA-DR4+transgenic+mice.">Francisella tularensis T-cell antigen identification using humanized HLA-DR4 transgenic mice.</a> Clinical Vaccine Immunology. 17 (2), 215-222 (2010).</li><li>Riyong, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Size+and+charge+antigens+of+Dirofilaria+immitis+adult+worm+for+IgG-ELISA+diagnosis+of+bancroftian+filariasis.">Size and charge antigens of Dirofilaria immitis adult worm for IgG-ELISA diagnosis of bancroftian filariasis.</a> Southeast Asian Journal of Tropical Medicine and Public Health. 41 (2), 285-297 (2010).</li><li>Vediyappan, G., Bikandi, J., Braley, R., Chaffin, W. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+surface+proteins+of+Candida+albicans:+preparation+of+extracts+and+improved+detection+of+proteins.">Cell surface proteins of Candida albicans: preparation of extracts and improved detection of proteins.</a> Electrophoresis. 21 (5), 956-961 (2000).</li><li>Vediyappan, G., Dumontet, V., Pelissier, F., d'Enfert, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gymnemic+acids+inhibit+hyphal+growth+and+virulence+in+Candida+albicans.">Gymnemic acids inhibit hyphal growth and virulence in Candida albicans.</a> PLoS One. 8 (9), 74189 (2013).</li><li>Bradford, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+rapid+and+sensitive+method+for+the+quantitation+of+microgram+quantities+of+protein+utilizing+the+principle+of+protein-dye+binding.">A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding.</a> Analytical Biochemistry. 72, 248-254 (1976).</li><li>Laemmli, U. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cleavage+of+structural+proteins+during+the+assembly+of+the+head+of+bacteriophage+T4.">Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4.</a> Nature. 227 (5259), 680-685 (1970).</li><li>Riazi, S., Dover, S., Turovskiy, Y., Chikindas, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Commercial+ampholytes+used+for+isoelectric+focusing+may+interfere+with+bioactivity+based+purification+of+antimicrobial+peptides.">Commercial ampholytes used for isoelectric focusing may interfere with bioactivity based purification of antimicrobial peptides.</a> Journal of Microbiological Methods. 71 (1), 87-89 (2007).</li><li>Kamei, K., Takano, R., Miyasaka, A., Imoto, T., Hara, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Amino-Acid-Sequence+of+Sweet-Taste-Suppressing+Peptide+(Gurmarin)+from+the+Leaves+of+Gymnema-Sylvestre.">Amino-Acid-Sequence of Sweet-Taste-Suppressing Peptide (Gurmarin) from the Leaves of Gymnema-Sylvestre.</a> Journal of Biochemistry. 111 (1), 109-112 (1992).</li><li>Craik, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemistry.+Seamless+proteins+tie+up+their+loose+ends.">Chemistry. Seamless proteins tie up their loose ends.</a> Science. 311 (5767), 1563-1564 (2006).</li><li>Craik, D. J., Daly, N. L., Bond, T., Waine, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+cyclotides:+A+unique+family+of+cyclic+and+knotted+proteins+that+defines+the+cyclic+cystine+knot+structural+motif.">Plant cyclotides: A unique family of cyclic and knotted proteins that defines the cyclic cystine knot structural motif.</a> Journal of Molecular Biology. 294 (5), 1327-1336 (1999).</li><li>Stoecklin, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemistry+and+physiological+properties+of+gymnemic+acid,+the+antisaccharine+principle+of+the+leaves+of+Gymnema+sylvestre.">Chemistry and physiological properties of gymnemic acid, the antisaccharine principle of the leaves of Gymnema sylvestre.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 17 (4), 704-708 (1969).</li><li>Liu, H. M., Kiuchi, F., Tsuda, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+structure+elucidation+of+gymnemic+acids,+antisweet+principles+of+Gymnema+sylvestre.">Isolation and structure elucidation of gymnemic acids, antisweet principles of Gymnema sylvestre.</a> Chemical &amp; Pharmaceutical Bulletin (Tokyo). 40 (6), 1366-1375 (1992).</li><li>Veerapandian, R., Vediyappan, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gymnemic+Acids+Inhibit+Adhesive+Nanofibrillar+Mediated+Streptococcus+gordonii-Candida+albicans+Mono-Species+and+Dual-Species+Biofilms.">Gymnemic Acids Inhibit Adhesive Nanofibrillar Mediated Streptococcus gordonii-Candida albicans Mono-Species and Dual-Species Biofilms.</a> Frontiers in Microbiology. 10, 2328 (2019).</li><li>Chaffin, W. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Candida+albicans+cell+wall+proteins.">Candida albicans cell wall proteins.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 72 (3), 495-544 (2008).</li></ol>

천연 제품 소스에서 작은 분자 (예를 들어, 식물) 화학 구조에서 매우 다양 한 복잡 한 이차 대사 산물을 포함. 그들은 식물 방어 메커니즘에 관여하는 것으로 추정된다. 또한, 폴리펩타이드는 식물조직(22)에도존재한다. 이러한 천연 제품 작은 분자는 약물 발견 및 개발을 위한 테스트 분자의 풍부한 소스. 그러나, 그들의 격리 및 정화에 필요한 어렵고 지루한 방법은 치료 응용 프...

복잡한 생물학적 샘플로부터의 생체 분자의 정제는 생물학적 실험1에서필수적이고 종종 어려운 단계이다. 동전 적 초점 (IEF)은 캐리어 앰프가 자신의 전하에 여행하고 전기 필드3에서pH 그라데이션을 설정하는 복잡한 생체 분자의 고해상도 분리에 적합합니다. IEF를 위한 최초의 상용 캐리어 앰프는 1964년 올로프 베스터버그에 의해 개발되었으며4,5의5특허를 받았습니다. 담체 앰플은 다양한 길이와 분지6의알리팔 올리고-아미노 올리고 카복실산 분자이다. 그 후, 베스터버그 와 그 외는 생체 분자를분리하는 확장된 사용을 위해 담체 앰프를6,7로개선하였다.
생체분자를 분리하는 방법에는 아가로즈 및 다환핵증 겔 전기포레시스, 2차원 겔 전기포전증(2-DE), 이소전 초점, 모세관 전기포리스, 이소타초포레시스 및 기타 크로마토그래피 기술(예를 들어, TLC, FPLC, HPLC)2를포함한다. "로토포"라는 기기에서 수행된 액체 상 IEF는 밀라노 비어8에의해 발명되었다. 그는 이 기기의 개념과 디자인을 개척했으며 전기 전구 이동 이론에 광범위하게 기여했습니다. 그의 팀은 또한 컴퓨터 시뮬레이션9에대한 전기 전구 분리 프로세스의 수학적 모델을 개발했다.
상기 액상 IEF 장치는 20개의 다공성 구획과 순환수 냉각 세라믹 로드로 나일론 코어로 구성된 수평 회전 원통형 세포이다. 다공성 챔버는 분자가 전극 사이의 수성 단계를 통해 마이그레이션하고 분획에서 진공 상태에서 정제 된 시료의 수집을 허용합니다. 이 정제 시스템은 &4 시간 에서 특정 분자의 최대 1000 배 정제를 제공 할 수 있습니다. 이 악기의 귀중한 특징은 복잡한 혼합물에서 정화를 위한 첫 번째 단계로 또는순도(10)를달성하기 위한 최종 단계로 적용될 수 있다는 것이다. 관심있는 분자가 단백질인 경우, 또 다른 장점은 분리 중에 그것의 토착 형성이 유지될 것이라는 점입니다.
액체상 IEF의 사용은 단백질, 효소 및 항체 정화6,,10,,11,,,12,13,,14에대해 널리 보고되었다. 여기서 우리는 약용 식물 Gymnema sylvestre에서작은 분자와 펩티드를 분리하고 정화하기위한이 접근 법의 사용을 설명합니다. 이 프로토콜은 연구원이 낮은 비용으로 다운스트림 응용 프로그램을 위해 식물 추출물에서 활성 소분자를 집중하고 정화하는 데 도움이 될 것입니다. 또한, 우리는 또한 칸디다 알비칸스 균류(15)로부터 의 복잡한 단백질 추출물로부터 단백질의 농축이 두 번째 예로 이 IEF 기반 시스템에서 있음을 입증합니다.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>0.45 &#181;m syringe filter</td>
			<td>Fisher scientfic</td>
			<td>09-720-004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2-Mercaptoethanol</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>M3148</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium carbonate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>207861-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bio-Lyte 3/10 Ampholyte</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>163-1113</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bio-Lyte 5/8 Ampholyte</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>163-1192</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Compact low temperature thermostat</td>
			<td>Lauda -Brinkmann</td>
			<td>RM 6T</td>
			<td>Set water cooling to 4 oC and it can be run even at 0 oC as when it passes through the Rotofor cooling core, the circulating water temperature will be around 5 or more depending on the voltage.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Coomassie Brilliant Blue R</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>B7920</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dialysis tubing (3,500 MWCO)</td>
			<td>Spectrum Spectra/Por</td>
			<td>132112T</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gymnema plant leaf extract powder (&#62;25% Gymnemic acids)</td>
			<td>Suan Farma, NJ USA</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Incubator</td>
			<td>Lab companion</td>
			<td>SI 300R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope</td>
			<td>Leica</td>
			<td>DM 6B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mini protean electrophoresis</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pH meter</td>
			<td>Mettler Toledo</td>
			<td>S20</td>
			<td>Useful to determine the pH of the Rotofor (liquid-phase IEF) fractions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Rotofor</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>170-2972</td>
			<td>http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/M1702950E.pdf (Rotofor Instruction manual for assembling the unit)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 Medium</td>
			<td>HyClone</td>
			<td>DH30255.01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sealing tape</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>170-2960</td>
			<td>Scotch tape may also be used.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorvall legend micro 17 centrifuge</td>
			<td>Thermo scientific</td>
			<td>75002432</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TPP tissue culture plate -96 well flat bottom</td>
			<td>TPP</td>
			<td>TP92696</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

separation of bioactive small molecules, peptides from natural sources and proteins from microbes by preparative isoelectric focusing (ief) method

식물과 미생물에서 파생 된 천연 제품은 생리 활성 분자의 풍부한 소스입니다. 사용하기 전에 복잡한 추출물의 활성 분자는 다운스트림 응용 제품에 대해 정제되어야 합니다. 이러한 목적을 위해 사용할 수 있는 다양한 크로마토그래피 방법이 있지만 모든 실험실이 고성능 방법을 감당할 수 있는 것은 아니며 복잡한 생물학적 샘플로부터의 격리가 어려울 수 있다. 여기서 우리는 전두엽 액체 상 등소 초점 (IEF)이 그들의 동전 점 (pI)에 따라 복잡한 식물 추출물에서 작은 분자 및 펩티드를 포함하여 분자를 분리 할 수 있음을 보여줍니다. 우리는 복잡한 생물학적 샘플 분별 및 특성화를 위한 방법을 사용했습니다. 개념의 증거로, 우리는 체메마 실베스트레 식물 추출물을 분획하여 테르페노이드 사포닌 소분자와 펩타이드 가족을 격리시켰습니다. 우리는 또한 모델 시스템으로 칸디다 알비칸스 균구를 사용하여 효과적인 미생물 단백질 분리를 시연했습니다.

짐네마 실베스트레 식물 추출물에서 작은 분자와 펩티드의 분리 및 정제 전균형 액체상 IEF 방법을 사용하여, 우리는 인간 병원성 곰팡이, C. 알비칸으로부터약용 식물 추출물과 세포 표면 단백질을 분획하였다. 이러한 분별 프로토콜의 회로도는 그림 1에표시됩니다.
액체 상 IEF로부터 얻은 G. 실베스트레 추출물의 20분?...

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Separation of Bioactive Small Molecules, Peptides from Natural Sources and Proteins from Microbes by Preparative Isoelectric Focusing IEF Method

목표는 액체 상 이소전 초점 (IEF) 방법을 채택하여 생리 활성 소분자, 복잡한 식물 추출물에서 펩티드 및 병원성 미생물의 단백질을 분수하고 분리하는 것입니다. 또한, 분리된 분자가 확인되었고 그들의 생체 활성이 확인되었다.

생리 활성 소분자의 분리, 천연 공급원에서 펩티드 및 미생물에서 단백질(Preparative IEF) 방법에 의한

Natural products derived from plants and microbes are a rich source of bioactive molecules. Prior to their use, the active molecules from complex extracts ...

우리의 프로토콜은 식물 추출물에서 활성 분자의 분리 및 정제에 대한 새로운 발견을 설명합니다. 과학자들은 이러한 방법을 사용하여 치료 사용자를 위한 천연 제품 소스에서 작은 분자와 펩티드를 분리할 수 있습니다. 계측기 구성 요소와 조립 방법에 익숙해지십시오.분리할 샘플은 제안된 지침에 의해 제조되는 것이 중요합니다. 이 메서드는 계측기의 여러 조립 프로세스를 포함 합니다. 그리고 시각적 데모는 사용자가 따라 성공적으로 연구에 적용하는 데 도움이됩니다.액체 상을 조립한 후, IEF 장치는 사용 설명서에 기재된 바와 같이, 0.1 어금강 나트륨 수산화및 양이온 교환 막을 0.1 의 어금강산으로 양화하여 음이온 교환 막을 평형화한다. 고무 개스킷을 정렬하여 3개의 큰 직사각형 구멍이 고무에 의해 차단되지 않도록 합니다. 이것은 전기 전염 도중 막을 통해 전극과 견본 구획 사이 이온을 교환하는 것을 도울 것입니다.이온 교환 개스킷에 3개의 직사각형 구멍을 정렬하여 전극의 내부 및 외부 부분을 조립합니다. 그런 다음 전극을 각각의 전해질로 채우면 멤브레인이 건조되는 것을 방지하십시오. 다음으로 플라스틱 나사 홀더를 조여 누출 방지 조립을 보장합니다.샘플 수집 보드를 밀봉 테이프로 덮습니다. 다음으로 다음 순서로 세라믹 냉각 손가락 위에 초점 챔버의 부분을 조립 : 양극 전극, 나일론 멤브레인 코어, 초점 챔버 및 음극 전극. 50 밀리리터 주사기를 사용하여, 미리 냉각 된 증류수로 초점 챔버를 채웁니다.표준 IEF 셀의 경우 60 밀리리터의 물을 추가합니다. IEF 장치를 섭씨 4도에서 순환 냉각수에 연결합니다. 전압이 안정될 때까지 약 3~5분 동안 15와트 및 3000볼트로 장치를 작동합니다.그런 다음 전원을 끕다. 분수 수집기를 사용하여 셀에서 물을 제거합니다. 밀봉 테이프로 컬렉션 보드를 다시 밀봉합니다.0.6 그램의 Gymnema sylvestre 식물 추출물을 증류수 60 밀리리터에 추가하십시오. 롤러 튜브에 5분 동안 혼합하여 식물 추출물을 녹입니다. 불용성 입자를 제거하려면 이 용액을 5분 동안 10, 000배 G로 원심분리합니다.150 밀리리터 유리 비커로 상체를 옮기고 앰프를 추가하여 볼륨별로 1%의 용액을 만듭니다. 1.5 인치 19 게이지 무딘 엔드 바늘이있는 50 밀리리터 주사기를 사용하여 샘플 수집 보드를 통해 이 솔루션을 IEF 셀에 로드합니다. 그런 다음 스탠드에서 셀을 제거하고 전극 챔버를 탭하여 거품을 제거하고 제거합니다.장치를 냉각수에 연결합니다. 일정한 15 와트에 전원 공급 장치가 분수 시작. 전압이 일정한 값에 도달할 때까지 약 3시간 동안 IEF 장치를 실행합니다.버튼을 누르면 분수 수집핀을 컬렉션 보드와 정렬합니다. 밀봉 테이프를 통해 핀을 밀어 짐네마 실베스트레 분획을 수집하기 시작합니다. C.albicans와 효모 펩티톤 덱스트로스 국물의 단일 식민지를 밤새 섭씨 30도에서 흔들어.배양을 원심분리기 튜브로 옮기고 5분 동안 10회, 000회 G에서 원심분리로 효모 세포를 수집한다. 상체를 제거한 후, 효모 세포를 완충제로 중단하고 5°C에서 1시간 동안 롤러튜브에서 서스펜션을 회전시한다. 효모 세포를 제거하기 위해 서스펜션을 5 분 동안 10, 000 배 G로 원심 분리합니다.그런 다음 0.45 마이크로미터 필터를 통해 단백질 추출물을 필터링합니다. 단백질 추출물을 투석 튜브로 옮기고 4°C에서 15시간 동안 물에 투석을 합니다. 단백질 농도를 추정한 후 총 단백질 500밀리그램을 함유한 단백질 추출물을 수집합니다.500 밀리그램의 단백질을 60 밀리리터의 물에 희석시켜 1%ampholyte를 함유합니다. 주사기를 사용하여 희석된 단백질 추출물을 IEF 세포에 적재하고 4시간 동안 일정한 15와트로 장치를 작동시합니다. 이 계측기는 고전압 전기 공급을 사용하기 때문에 사용자는 라이브 전극과의 직접적인 접촉을 피하기 위해 모든 예방 조치를 취해야합니다.분수 수집기에는 20개의 플라스틱 튜브가 포함되어 있으며, 각각 12밀리미터x 75밀리미터가 들어있습니다. 그리고 그것은 진공 펌프에 연결되어 있습니다. 버튼에 수확을 눌러 분수를 수집 할 준비합니다.그런 다음 분획 수집기의 20개의 컬렉션 핀을 20개의 수집 보드와 정렬하여 밀봉된 초점 셀을 정렬합니다. 밀봉 테이프를 통해 컬렉션 핀을 밀어 동시에 진공 펌프를 켭니다. 각 튜브는 약 3 밀리리터의 단백질 분수를 수집합니다.단백질 분획을 줄이고 끓인 후 12.5%SDS 페이지 젤로 분석합니다. 쿠마시 블루 염료로 젤을 염색하고 실온에서 로커에 놓습니다. 2 ~3 시간 후에 젤을 디스테인.그런 다음 젤 이미저를 사용하여 젤 이미지를 기록합니다. 50 밀리몰러 포도당으로 보충된 RPMI 세포 배양 배지에서 1:1000 비율로 C.albicans의 하룻밤 배양을 희석하여 효모 세포 현탁액을 준비합니다. 96 웰 플레이트의 각 웰에 셀 서스펜션의 90 마이크로 리터를 추가합니다.다음으로 각 G.sylvestre 분획의 마이크로리터 10개를 추가하여 우물을 분리합니다. 음의 대조군으로서 10 마이크로리터의 물을 별도의 우물에 1%amp홀리트로 넣습니다. 12 시간 동안 섭씨 37도에서 96 웰 플레이트를 배양 한 후 현미경으로 플레이트를 관찰하십시오.필라멘트 성장의 부족은 C.albicans 효모-hypha 변환의 억제를 나타냅니다. G.sylvestre 추출물의 20분은 액체 상 IEF에 의해 수득되었다. 어두운 색깔의 분자, 체육관 산은, 이동하고 장치의 양극 끝에 풍부했다.음극 끝에서 반투명 라이트 노란색 분획이 관찰되었습니다. 각 G.sylvestre 굴절의 알리쿼트(Aliquots)는 SDS 페이지에서 감소, 삶기 및 해결되었습니다. 쿠마시 블루 스테인은 약 5킬로달톤에서 다른 폴리펩티드 밴드를 보여주었으며, 16-19까지분수로 농축되었다.분수 하나에 있는 Gymnemic 산, 그리고 그(것)들이 단백질이 아니기 때문에 다음 몇몇 분수는 검출되지 않았습니다. 그러나, 이러한 분자는 TLC에 의해 분리되고 UV 빛 하에서 검출될 수 있다. 분수 10 유기 작은 분자의 대부분이 분수 1 ~3에서 농축되었다는 것을 건의하는 이 작은 분자의 검출 가능한 양을 포함하지 않았습니다.모든 20 G.sylvestre 분획은 C.albicans에서 효모 -hypha 변환 및 최면 성장의 억제를 위해 분석되었다. 가장 큰 억제는 분수 10 이상에서 관찰된 거의 또는 전혀 억제되지 않은 분수에서 관찰되었다. C.albicans에서 세포 표면 단백질액체 상 IEF를 사용하여 분별되었다.그리고 18분별에서 알리쿼트S를 SDS 페이지에 의해 분석되었다. 농축 된 단백질은 여러 분수에서 볼 수 있었습니다. 시작, 작은 분자는 비 외래로 믿어지기 때문에 등전기 초점에 의해 분리 될 수 없습니다.우리의 연구 결과는 그(것)들이 외래, 적어도 매주, 및 이 방법은 그밖 작은 분자를 위해 더 탐구될 수 있다는 것을 보여줍니다.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Separation of Bioactive Small Molecules, Peptides from Natural Sources and Proteins from Microbes by Preparative Isoelectric Focusing (IEF) Method

Separation of Single-stranded DNA, Double-stranded DNA and RNA from an Environmental Viral Community Using Hydroxyapatite Chromatography

히드록 시아파 타이트 크로마 토그래피를 사용하여 환경 바이러스성 커뮤니티에서 단일 좌초 DNA, 더블 좌초된 DNA와 RNA의 분리

Viruses, particularly bacteriophages (phages), are the most numerous biological entities on Earth1,2.  Viruses modulate host cell abundance and diversity, ...

연구

면역학 및 감염병학

An Introduction to Parasitic Wasps of Drosophila and the Antiparasite Immune Response

An Introduction to Parasitic Wasps of Drosophila and the Antiparasite Immune Response

의 기생충 말벌에 대한 소개<em&gt; Drosophila</em&gt; 그리고 Antiparasite 면역 반응

Most known parasitoid wasp species attack the larval or pupal stages of Drosophila. While Trichopria drosophilae infect the pupal stages of the host (Fig. ...

Quantitative Imaging of Lineage-specific Toll-like Receptor-mediated Signaling in Monocytes and Dendritic Cells from Small Samples of Human Blood

Monocytes과 인간 혈액의 작은 샘플에서 돌기 세포의 리니지 특정 수신자 같은 수용체 - 매개 시그널링의 정량 이미징

Individual variations in immune status determine responses to infection and contribute to disease severity and outcome.  Aging is associated with an ...

Separation of Plasmodium falciparum Late Stage-infected Erythrocytes by Magnetic Means

Separation of Plasmodium falciparum Late Stage-infected Erythrocytes by Magnetic Means

의 분리<em&gt; Plasmodium falciparum</em자기 수단으로&gt; 늦은 단계에 감염된 적혈구

Unlike other Plasmodium species, P. falciparum can be cultured in the lab, which facilitates its study 1. While the parasitemia achieved can reach the ...

Automated Separation of C. elegans Variably Colonized by a Bacterial Pathogen

Automated Separation of C. elegans Variably Colonized by a Bacterial Pathogen

의 자동 분리<em&gt; C. 엘레</em&gt; 가변 세균성 병원체에 의해 식민지

The wormsorter is an instrument analogous to a FACS machine that is used in studies of Caenorhabditis elegans, typically to sort worms based on expression ...

T Cells Capture Bacteria by Transinfection from Dendritic Cells

T 세포는 수지상 세포에서 Transinfection에 의해 박테리아를 캡처

Recently, we have shown, contrary to what is described, that CD4+ T cells, the paradigm of adaptive immune cells, capture bacteria from infected dendritic ...

An Optimized Method for Isolating and Expanding Invariant Natural Killer T Cells from Mouse Spleen

마우스 비장에서 불변 자연 살해 T 세포를 분리하고 확장을위한 최적화 방법

The ability to rapidly secrete cytokines upon stimulation is a functional characteristic of the invariant natural killer T (iNKT) cell lineage. iNKT cells ...

Isolation of Infiltrating Leukocytes from Mouse Skin Using Enzymatic Digest and Gradient Separation

효소 다이제스트 및 그라데이션 분리를 사용하여 마우스 피부에서 침투 백혈구의 분리

Dissociating murine skin into a single cell suspension is essential for downstream cellular analysis such as the characterization of infiltrating immune ...

Establishment of a High-throughput Setup for Screening Small Molecules That Modulate c-di-GMP Signaling in Pseudomonas aeruginosa

Establishment of a High-throughput Setup for Screening Small Molecules That Modulate c-di-GMP Signaling in Pseudomonas aeruginosa

변조 C 디 GMP가에서 시그널링 그건 작은 분자를 스크리닝하기위한 높은 처리량 설정 구축<em&gt; 녹농균</em

Bacterial resistance to traditional antibiotics has driven research attempts to identify new drug targets in recently discovered regulatory pathways. ...

Phenotypic Characterization of Macrophages from Rat Kidney by Flow Cytometry

유동 세포 계측법에 의해 쥐의 신장에서 대 식세포의 표현형 특성

There is increasing evidence suggesting the important role of inflammation and, subsequently, macrophages in the development and progression of renal ...