Mappatura ad alta risoluzione delle interazioni proteina-DNA nei neuroni derivati dalle cellule staminali del topo utilizzando l'immunoprecipitazione-esonucleasi della cromatina (ChIP-Exo)
Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
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Conclusion
Transcript
The main advantage of our ChIP-exo method is the improved mapping resolution of protein DNA interactions in the cell compared to the conventional chromatin immunoprecipitation method. To prepare protein G magnetic beads for ChIP, mix the magnetic
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La determinazione precisa delle posizioni di legame proteico in tutto il genoma è importante per comprendere la regolazione genica. Qui descriviamo un metodo di mappatura genomica che tratta il DNA immunoprecipitato di cromatina con digestione dell'esonucleasi (ChIP-exo) seguito da sequenziamento ad alta produttività. Questo metodo rileva le interazioni proteina-DNA con una risoluzione di mappatura vicina alla coppia di basi e un elevato rapporto segnale-rumore nei neuroni dei mammiferi.