Name: image rendering techniques in postmortem computed tomography: evaluation of biological health and profile in stranded cetaceans
Uploaded: 2020-09-27T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Image Rendering Techniques in Postmortem Computed Tomography: Evaluation of Biological Health and Profile in Stranded Cetaceans at JoVE.com

Forfatterne vil gjerne takke landbruks-, fiskeri- og konserveringsavdelingen i Hong Kong Special Administrative Region Government for kontinuerlig støtte i dette prosjektet. Oppriktig takknemlighet er også utvidet til veterinærer, ansatte og frivillige fra Aquatic Animal Virtopsy Lab, City University of Hong Kong, Ocean Park Conservation Foundation Hong Kong og Ocean Park Hong Kong for å betale stor innsats på stranding respons i dette prosjektet. Spesiell takknemlighet skyldes teknikere i CityU Veterinary Medical Centre og Hong Kong Veterinary Imaging Centre for drift av CT- og MR-enheter for den nåværende studien. Eventuelle meninger, funn, konklusjoner eller anbefalinger uttrykt her gjenspeiler ikke nødvendigvis synspunktene til Marine Ecology Enhancement Fund eller Bobestyreren. Dette prosjektet ble finansiert av Hong Kong Research Grants Council (Grant number: UGC/FDS17/M07/14), og Marine Ecology Enhancement Fund (tilskuddsnummer: MEEF2017014, MEEF2017014A, MEEF2019010 og MEEF2019010A), Marine Ecology Enhancement Fund, Marine Ecology & Fisheries Enhancement Funds Trustee Limited. Spesiell takk til Dr. María José Robles Malagamba for engelsk redigering av dette manuskriptet.

MERK: Innenfor rammen av Hong Kong cetacean virtopsy stranding responsprogram, strandet cetaceans ble rutinemessig undersøkt av PMCT. Forfatterne var ansvarlig for virtopsy skanning, data etterbehandling (f.eks bilde rekonstruksjon og gjengivelse), datatolkning, og virtopsy rapportering1. Denne avanserte teknologien legger vekt på oppmerksomme funn og gir innsikt i den første undersøkelsen av PM-funn før konvensjonell necropsy (https://www.facebook.com/aquanimallab).
<p class="jove_title"...

<ol>
	<li>Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W., Chung, T. Y. T., Chan, D. K. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Virtopsy+as+a+revolutionary+tool+for+cetacean+stranding+programs:+Implementation+and+management.">Virtopsy as a revolutionary tool for cetacean stranding programs: Implementation and management.</a> Frontiers in Marine Sciences. , (2020).</li><li>Jacobsen, C., Bech, B. H., Lynnerup, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparative+study+of+cranial,+blunt+trauma+fractures+as+seen+at+medicolegal+autopsy+and+by+computed+tomography.">A comparative study of cranial, blunt trauma fractures as seen at medicolegal autopsy and by computed tomography.</a> BMC Medical Imaging. 9 (18), 1-9 (2009).</li><li>Jacobsen, C., Lynnerup, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Craniocerebral+trauma--congruence+between+post-mortem+computed+tomography+diagnoses+and+autopsy+results:+a+2-year+retrospective+study.">Craniocerebral trauma--congruence between post-mortem computed tomography diagnoses and autopsy results: a 2-year retrospective study.</a> Forensic Science International. 194 (1-3), 9-14 (2010).</li><li>Plattner, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Virtopsy-postmortem+multislice+computed+tomography+(MSCT)+and+magnetic+resonance+imaging+(MRI)+in+a+fatal+scuba+diving+incident.">Virtopsy-postmortem multislice computed tomography (MSCT) and magnetic resonance imaging (MRI) in a fatal scuba diving incident.</a> Journal of Forensic Sciences. 48 (6), 1347-1355 (2003).</li><li>Jackowski, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualization+and+quantification+of+air+embolism+structure+by+processing+postmortem+MSCT+data.">Visualization and quantification of air embolism structure by processing postmortem MSCT data.</a> Journal of Forensic Sciences. 49 (6), 1339-1342 (2004).</li><li>Aghayev, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pneumomediastinum+and+soft+tissue+emphysema+of+the+neck+in+postmortem+CT+and+MRI;+a+new+vital+sign+in+hanging.">Pneumomediastinum and soft tissue emphysema of the neck in postmortem CT and MRI; a new vital sign in hanging.</a> Forensic Science International. 153 (2-3), 181-188 (2005).</li><li>Jackowski, C., Persson, A., Thali, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Whole+Body+Postmortem+Angiography+with+a+High+Viscosity+Contrast+Agent+Solution+Using+Poly+Ethylene+Glycol+as+Contrast+Agent+Dissolver.">Whole Body Postmortem Angiography with a High Viscosity Contrast Agent Solution Using Poly Ethylene Glycol as Contrast Agent Dissolver.</a> Journal of Forensic Sciences. 53 (2), 465-468 (2008).</li><li>Jackowski, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Virtopsy:+postmortem+minimally+invasive+angiography+using+cross+section+techniques+-+implementation+and+preliminary+results.">Virtopsy: postmortem minimally invasive angiography using cross section techniques - implementation and preliminary results.</a> Journal of Forensic Sciences. 50 (5), 1175-1186 (2005).</li><li>Grabherr, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Postmortem+CT+angiography+compared+with+autopsy:+a+forensic+multicenter+study.">Postmortem CT angiography compared with autopsy: a forensic multicenter study.</a> Radiology. 288 (1), 270-276 (2018).</li><li>Yuen, A. H. L., Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Accuracy+and+reliability+of+cetacean+cranial+measurements+using+computed+tomography+three+dimensional+volume+rendered+images.">Accuracy and reliability of cetacean cranial measurements using computed tomography three dimensional volume rendered images.</a> PloS one. 12 (3), 0174215 (2017).</li><li>Kot, B. C. W., Chan, D. K. P., Yuen, A. H. L., Tsui, H. C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diagnosis+of+atlanto-occipital+dissociation:+Standardised+measurements+of+normal+craniocervical+relationship+in+finless+porpoises+(genus+Neophocaena)+using+postmortem+computed+tomography.">Diagnosis of atlanto-occipital dissociation: Standardised measurements of normal craniocervical relationship in finless porpoises (genus Neophocaena) using postmortem computed tomography.</a> Scientific Reports. 8, 8474 (2018).</li><li>Chan, D. K. P., Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Database+documentation+of+marine+mammal+stranding+and+mortality:+current+status+review+and+future+prospects.">Database documentation of marine mammal stranding and mortality: current status review and future prospects.</a> Diseases of Aquatic Organisms. 126 (3), 247-256 (2017).</li><li>Chan, D. K. P., Kot, B. C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cetaceans+postmortem+multimedia+analysis+platform+(CPMAP):+pilot+web-accessed+database+of+a+virtopsy-driven+stranding+response+program+in+the+Hong+Kong+waters.">Cetaceans postmortem multimedia analysis platform (CPMAP): pilot web-accessed database of a virtopsy-driven stranding response program in the Hong Kong waters.</a> Proceedings of International Association for Aquatic Animal Medicine 48th Annual Conference, Cancun, MEX. , (2017).</li><li>Hamel, P. E. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Postmortem+computed+tomography+and+magnetic+resonance+imaging+findings+in+a+case+of+coinfection+of+dolphin+morbillivirus+and+Aspergillus+fumigatus+in+a+juvenile+bottlenose+dolphin+(Tursiops+truncatus).">Postmortem computed tomography and magnetic resonance imaging findings in a case of coinfection of dolphin morbillivirus and Aspergillus fumigatus in a juvenile bottlenose dolphin (Tursiops truncatus).</a> Journal of Zoo and Wildlife Medicine. 51 (2), 448-454 (2020).</li><li>Weisbrod, T. C., Walsh, M. T., Marquardt, S., Giglio, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Computed+tomography+diagnosis+of+pneumothorax+and+cardiac+foreign+body+secondary+to+stingray+injury+in+a+bottlenose+dolphin+(Tursiops+truncatus).">Computed tomography diagnosis of pneumothorax and cardiac foreign body secondary to stingray injury in a bottlenose dolphin (Tursiops truncatus).</a> Aquatic Mammals. 46 (3), 326-330 (2020).</li><li>Kot, B. C. W., Tsui, H. C. L., Chung, T. Y. T., Lau, A. P. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Postmortem+neuroimaging+of+cetacean+brains+using+computed+tomography+and+magnetic+resonance+imaging.">Postmortem neuroimaging of cetacean brains using computed tomography and magnetic resonance imaging.</a> Frontiers in Marine Science. , (2020).</li><li>Lundstr&#246;m, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=State-of-the-art+of+visualization+in+post-mortem+imaging.">State-of-the-art of visualization in post-mortem imaging.</a> Acta Pathologica, Microbiologica, et Immunologica Scandinavica. 120 (4), 316-326 (2012).</li><li>Lipson, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> MDCT and 3D Workstations. , (2006).</li><li>Perandini, S., Faccioli, N., Zaccarella, A., Re, T. J., Mucelli, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+diagnostic+contribution+of+CT+volumetric+rendering+techniques+in+routine+practice.">The diagnostic contribution of CT volumetric rendering techniques in routine practice.</a> Indian Journal of Radiology and Imaging. 20 (2), 92-97 (2010).</li><li>Pavone, P., Luccichenti, G., Cademartiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=From+maximum+intensity+projection+to+volume+rendering.">From maximum intensity projection to volume rendering.</a> Seminars in Ultrasound, CT and MRI. 22 (5), 413-419 (2001).</li><li>Fishman, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+rendering+versus+maximum+intensity+projection+in+CT+angiography:+what+works+best,+when,+and+why.">Volume rendering versus maximum intensity projection in CT angiography: what works best, when, and why.</a> RadioGraphics. 26 (3), 905-922 (2006).</li><li>Udupa, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+visualization+and+analysis+methodologies:+a+current+perspective.">Three-dimensional visualization and analysis methodologies: a current perspective.</a> RadioGraphics. 19 (3), 783-806 (1999).</li><li>Thali, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=a+new+imaging+horizon+in+forensic+pathology:+virtual+autopsy+by+postmortem+multislice+computed+tomography+(MSCT)+and+magnetic+resonance+imaging+(MRI)+-+a+feasibility+study.">a new imaging horizon in forensic pathology: virtual autopsy by postmortem multislice computed tomography (MSCT) and magnetic resonance imaging (MRI) - a feasibility study.</a> Journal of Forensic Sciences. 48 (2), 386-403 (2003).</li><li>Dalrymple, N. C., Prasad, S. R., Freckleton, M. W., Chintapalli, K. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Informatics+in+radiology+(infoRAD):+introduction+to+the+language+of+three-dimensional+imaging+with+multidetector+CT.">Informatics in radiology (infoRAD): introduction to the language of three-dimensional imaging with multidetector CT.</a> RadioGraphics. 25 (5), 1409-1428 (2005).</li><li>Thali, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Virtopsy+-+documentation,+reconstruction+and+animation+in+forensic:+individual+and+real+3D+data+based+geo-metric+approach+including+optical+body/object+surface+and+radiological+CT/MRI+scanning.">Virtopsy - documentation, reconstruction and animation in forensic: individual and real 3D data based geo-metric approach including optical body/object surface and radiological CT/MRI scanning.</a> Journal of Forensic Sciences. 50 (2), 428-442 (2015).</li><li>Tsui, H. C. L., Kot, B. C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+image+reformation+techniques+in+postmortem+computed+tomography+imaging+of+stranded+cetaceans.">Role of image reformation techniques in postmortem computed tomography imaging of stranded cetaceans.</a> Proceedings of International Association for Aquatic Animal Medicine 47th Annual Conference. , (2016).</li><li>Ampanozi, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Format+preferences+of+district+attorneys+for+post-mortem+medical+imaging+reports:+understandability,+cost+effectiveness,+and+suitability+for+the+courtroom:+a+questionnaire+based+study.">Format preferences of district attorneys for post-mortem medical imaging reports: understandability, cost effectiveness, and suitability for the courtroom: a questionnaire based study.</a> Legal Medicine (Tokyo). 14 (3), 116 (2012).</li><li>Ebert, L. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Forensic+3D+visualization+of+CT+data+using+cinematic+volume+rendering:+a+preliminary+study.">Forensic 3D visualization of CT data using cinematic volume rendering: a preliminary study.</a> American Journal of Roentgenology. 208 (2), 233-240 (2017).</li><li>Alonso-Farr&#233;, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cross-sectional+anatomy,+computed+tomography+and+magnetic+resonance+imaging+of+the+head+of+common+dolphin+(Delphinus+delphis)+and+striped+dolphin+(Stenella+Coeruleoalba).">Cross-sectional anatomy, computed tomography and magnetic resonance imaging of the head of common dolphin (Delphinus delphis) and striped dolphin (Stenella Coeruleoalba).</a> Anatomia, Histologia, Embryologia. 44 (1), 13-21 (2015).</li><li>Gascho, D., Thali, M. J., Niemann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Post-mortem+computed+tomography:+technical+principles+and+recommended+parameter+settings+for+high-resolution+imaging.">Post-mortem computed tomography: technical principles and recommended parameter settings for high-resolution imaging.</a> Medicine, Science and the Law. 58 (1), 70-83 (2018).</li><li>Lee, E. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MDCT+evaluation+of+thoracic+aortic+anomalies+in+pediatric+patients+and+young+adults:+comparison+of+axial,+multiplanar,+and+3D+images.">MDCT evaluation of thoracic aortic anomalies in pediatric patients and young adults: comparison of axial, multiplanar, and 3D images.</a> American Journal of Roentgenology. 182 (3), 777-784 (2004).</li><li>Errickson, D., Thompson, T. J. U., Rankin, B. W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+application+of+3D+visualization+of+osteological+trauma+for+the+courtroom:+a+critical+review.">The application of 3D visualization of osteological trauma for the courtroom: a critical review.</a> Journal of Forensic Radiology and Imaging. 2 (3), 132-137 (2014).</li><li>Prokop, M., Galanski, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Spiral and multislice computed tomography of the body. , (2003).</li><li>Kawel, N., Seifert, B., Luetolf, M., Boehm, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+slab+thickness+on+the+CT+detection+of+pulmonary+nodules:+use+of+sliding+thin-slab+maximum+intensity+projection+and+volume+rendering.">Effect of slab thickness on the CT detection of pulmonary nodules: use of sliding thin-slab maximum intensity projection and volume rendering.</a> American Journal of Roentgenology. 192 (5), 1324-1329 (2009).</li><li>Vlassenbroek, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+use+of+isotropic+imaging+and+computed+tomography+reconstructions.">The use of isotropic imaging and computed tomography reconstructions.</a> Comparative Interpretation of CT and Standard Radiography of the Chest, Medical Radiology. , 53-73 (2011).</li><li>van Ooijen, P. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Noninvasive+coronary+imaging+using+electron+beam+CT:+surface+rendering+versus+volume+rendering.">Noninvasive coronary imaging using electron beam CT: surface rendering versus volume rendering.</a> American Journal of Roentgenology. 180 (1), 223-226 (2003).</li><li>Remy-Jardin, M., Remy, J., Artaud, D., Fribourg, M., Duhamel, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+rendering+of+the+tracheobronchial+tree:+clinical+evaluation+of+bronchographic+images.">Volume rendering of the tracheobronchial tree: clinical evaluation of bronchographic images.</a> Radiology. 208 (3), 761-770 (1998).</li><li>Bassett, J. T., Liotta, R. A., Barlow, D., Lee, D., Jensen, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colonic+perforation+during+screening+CT+colonography+using+automated+CO2+insufflation+in+an+asymptomatic+adult.">Colonic perforation during screening CT colonography using automated CO2 insufflation in an asymptomatic adult.</a> Abdominal Imaging. 33 (5), 598-600 (2008).</li></ol>

For den klare visualiseringen av virtopsy datasett, 8 bilde gjengivelse teknikker, bestående av både 2D og 3D gjengivelse, ble rutinemessig brukt på hver strandet for PM undersøkelse av deres biologiske helse og profil. Disse gjengivelsesteknikkene inkluderte MPR, HLR, MIP, MinIP, DVR, segmentering, TF og PVR. Ulike gjengivelsesteknikker brukes komplementært sammen med vindusjustering. Begrepene for hver bilde reformasjon teknikk og fordeler er også beskrevet.
Multiplanar rekonst...

Virtopsy, også kjent som postmortem (PM) avbildning, er undersøkelsen av et med avanserte tverrsnittsavbildningsmodaliteter, inkludert postmortem computertomografi (PMCT), postmortem magnetisk resonansavbildning (PMMRI) og ultrasonografi1. Hos mennesker er PMCT nyttig i å undersøke traumatiske tilfeller av skjelettendringer2,3, fremmedlegemer, gassfunn4,,5,,6og patologier i det vaskulære systemet7,8,9. Siden 2014 har virtopsy blitt rutinemessig implementert i Hong Kong cetacean stranding responsprogram1. PMCT og PMMRI er i stand til å skildre pato-morfologiske funn på som er for nedbrutt til å bli evaluert av konvensjonell necropsy. Den ikke-invasive radiologiske vurderingen er objektiv og digitalt storbar, slik at andre mening eller retrospektive studier årsenere 1,10,11. Virtopsy har blitt en verdifull alternativ teknikk for å gi ny innsikt av PM funn i strandet marine dyr12,13,14,15,16. Kombinert med necropsy, som er gullstandarden for å forklare patofysiologiskrekonstruksjon og dødsårsak 17, kan dyrenes biologiske helse og profil tas opp. Virtopsy har blitt gradvis anerkjent og implementert i stranding responsprogrammer over hele verden, inkludert, men ikke begrenset til Costa Rica, Japan, Fastlands-Kina, New Zealand, Taiwan, Thailand og USA1.
Bildegjengivelsesteknikker i radiologi bruker dataalgoritmer til å forvandle tall til informasjon om vevet. For eksempel uttrykkes radiologisk tetthet i konvensjonelle røntgenstråler og CT. Den enorme mengden volumetriske data lagres i Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM)-format. CT-bilder kan brukes til å produsere isotropiske voxel-data ved hjelp av todimensjonale (2D) og tredimensjonale (3D) bildegjengivelse i en postprosessering 3D-arbeidsstasjon for visualisering med høy oppløsning18,,19. Kvantitative data og resultater tilordnes for å transformere serielt anskaffede aksiale bilder til 3D-bilder med gråskala- ellerfargeparametere 19,,20,,21. Å velge en passende datavisualiseringsmetode fra ulike gjengivelsesteknikker er en viktig teknisk determinant for visualiseringskvaliteten, noe som i betydelig grad påvirker analysen og tolkningen av radiologiskefunn 21. Dette er spesielt viktig for stranding arbeid som involverer personell uten radiologi bakgrunn, som trenger å forstå resultatene i ulike omstendigheter17. Målet med å implementere disse bildegjengivelsesteknikkene er å forbedre kvaliteten på visualiseringen av anatomiske detaljer, relasjoner og kliniske funn, noe som øker den diagnostiske verdien av bildebehandling og tillater en effektiv gjengivelse av de definerte områdeneav interesse 17,,19,,22,,23,,24,,25.
Selv om de primære aksiale CT/MR-bildene inneholder mest informasjon, kan de begrense nøyaktig diagnose eller dokumentasjon av patologier, da strukturer ikke kan ses i ulike ortogonale plan. Bildereformasjon ved andre anatomisk justerte fly tillater visualisering av strukturelle relasjoner fra et annet perspektiv uten å måtte omplassere kroppen26. Som medisinsk anatomi og rettsmedisinske patologi data er overveiende 3D i naturen, fargekodede PMCT bilder og 3D rekonstruerte bilder foretrekkes til gråskala bilder og 2D skive bilder i lys av forbedret forståelse og egnethet for rettssalenbedømmelser 27,28. Med fremskritt i PMCT-teknologi, en bekymring for visualisering leting (det vil vil vil at etableringen og tolkningen av 2D og 3D-bilde) i cetacean PM undersøkelse har blitt reist12,29. Ulike volumetriske gjengivelsesteknikker i radiologiarbeidsstasjonen tillater radiologer, teknikere, henvisende klinikere (f.eks. veterinærer og marine pattedyrforskere), og til og med lekmenn (f.eks. stranding responspersonell, offentlige tjenestemenn og allmennheten) å visualisere og studere regionene av interesse. Likevel er valget av en passende teknikk og forvirring av terminologi fortsatt et stort problem. Det er nødvendig å forstå det grunnleggende konseptet, styrkene og begrensningene i de vanlige teknikkene, siden det vil påvirke diagnostisk verdi og tolkning av radiologiske funn betydelig. Misbruk av teknikker kan generere villedende bilder (f.eks. bilder som har forvrengninger, gjengivelsesfeil, rekonstruksjonslyder eller gjenstander) og føre til feildiagnose 30.
Den nåværende studien tar sikte på å vurdere 8 viktige bildegjengivelsesteknikker i PMCT som ble brukt til å identifisere de fleste pm-funnene i strandede cetaceans i Hong Kong-farvann. Beskrivelser og praktiske eksempler på hver teknikk er gitt for å veilede radiologer, klinikere og veterinærer over hele verden gjennom det ofte vanskelige og kompliserte riket av PMCT-bildegjengivelse og gjennomgang for evaluering av biologisk helse og profil.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Aquarius iNtuition workstation</td>
			<td>TeraRecon Inc</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Siemens 64-row multi-slice spiral CT scanner Somatom go.Up</td>
			<td>Siemens Healthineers</td>
			<td>NA</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

image rendering techniques in postmortem computed tomography: evaluation of biological health and profile in stranded cetaceans

Med 6 års erfaring i å implementere virtopsy rutinemessig inn i Hong Kong cetacean stranding responsprogram, standardiserte virtopsy prosedyrer, postmortem computertomografi (PMCT) oppkjøp, etterbehandling, og evaluering ble vellykket etablert. I denne pioneren cetacean virtopsy stranding responsprogram, PMCT ble utført på 193 strandet cetaceans, gi postmortem funn for å hjelpe necropsy og kaste lys over biologisk helse og profil av dyrene. Denne studien hadde som mål å vurdere 8 bildegjengivelsesteknikker i PMCT, inkludert multiplanarrekonstruksjon, buet planreformasjon, maksimal intensitetsprojeksjon, minimum intensitetsprojeksjon, direkte volumgjengivelse, segmentering, overføringsfunksjon og perspektivvolumgjengivelse. Illustrert med praktiske eksempler, disse teknikkene var i stand til å identifisere de fleste av PM funn i strandet cetaceans og fungerte som et verktøy for å undersøke deres biologiske helse og profil. Denne studien kan veilede radiologer, klinikere og veterinærer gjennom det ofte vanskelige og kompliserte riket av PMCT-bildegjengivelse og gjennomgang.

Fra januar 2014 til mai 2020 ble totalt 193 cetaceans som strandet i Hong Kong-farvann undersøkt av PMCT, inkludert 42 indo-stillehavskvalp delfiner (Sousa chinensis), 130 indo-stillehavsfinnløse niser (Neophocaena phocaenoides) og 21 andre arter. En helkroppsskanning ble utført på 136, mens 57 var delvise skanninger på hodeskaller og svømmeføtter. Anatomiske egenskaper og patologier som vanligvis observeres ble illustrert med de 8 bildegjengivelsesteknikkene for evaluering av de strandede cetace...

Watch this Scientific Journal Video about Image Rendering Techniques in Postmortem Computed Tomography: Evaluation of Biological Health and Profile in Stranded Cetaceans at JoVE.com

Image Rendering Techniques in Postmortem Computed Tomography: Evaluation of Biological Health and Profile in Stranded Cetaceans

Hong Kong cetacean stranding responsprogrammet har innlemmet postmortem computertomografi, som gir verdifull informasjon om den biologiske helsen og profilen til de avdøde dyrene. Denne studien beskriver 8 bildegjengivelsesteknikker som er avgjørende for identifisering og visualisering av postmortemfunn i strandede cetaceans, som vil hjelpe klinikere, veterinærer og stranding responspersonell over hele verden for å utnytte den radiologiske modaliteten fullt ut.

Bildegjengivelsesteknikker i Postmortem Computered Tomografi: Evaluering av biologisk helse og profil i strandede Cetaceans

With 6 years of experience in implementing virtopsy routinely into the Hong Kong cetacean stranding response program, standardized virtopsy procedures, ...

Denne studien tar sikte på å vurdere ulike bildegjengivelsesteknikker i postmortem computertomografi for evaluering av biologisk helse og profil i strandede cetaceans i Hong Kong farvann. Dette bidrar til å veilede radiologer, klinikere og veterinærer gjennom det ofte vanskelige og kompliserte riket av postmortem computertomografibilderetorikk og gjennomgang. Åtte bildegjengivelsesteknikker består av både 2D- og 3D-gjengivelse som rutinemessig brukes på hver strandede cetaceans for biologisk helse- og profilundersøkelse.Den første er multiplanar rekonstruksjon, MPR. Vis standard MPR fra aksialvisning, koronarvisning og sagittalvisning etter lasting av seriens venstreklikk hold museknappen på sentrene til MPR-trådkors for å justere interesseområdet samtidig og skjære i tre MPR-bilder klikk roter, venstreklikk hold museknappen og dra musen for å rotere MPR-bildene. Klikk penn, venstreklikk hold museknappen og dra musen for å justere plasseringen av bildet inne i panelet.Klikk zoom, venstreklikk hold museknappen og dra musen for å forstørre eller minimere bildet. Velg de aktuelle nåværende vindusnivåene ved å klikke app en, app to, hode, lunge, bein, i vinduet jevnet mini verktøylinje, avhengig av området av interesse, klikk vindusnivå venstre klikk hold museknappen og dra musen for å justere vindusbredden og vindusnivået ct skive manuelt. Klikk stykke, venstreklikk hold museknappen og dra musen for å evaluere virtopsy datasett fra det første bildet til det siste bildet stykke for stykke.Den andre er kurve planar reformasjon, HLR. Design området av anatomiske interesser venstre klikk hold museknappen på sentrene av MPR trådkors til den aktuelle regionen av interesse. Vis MPR fra tre forskjellige visninger, sørg for mpr trådkors plassert på et riktig sted.Juster MPR-trådkorset hvis det ikke er det. Velg ett skjermpanel fra aksial, koronar eller sagittalvisning som et studiepanel. For eksempel, med sikte på å vise flipperen fra en aksial visning avhengig av studiepanelet, justere den utvidede linjen av MPR-trådkors fra koronarvisningen vinkelrett på interesseområdet ved venstreklikk hold museknappen på rotasjonspunktet for utvidet linje, juster en annen utvidet linje med MPR-trådkors fra sagittalvisning parallelt med interesseområdet ved venstreklikk hold museknappen på rotasjonspunktet for utvidet linje.Vis aksialvisningen for å kontrollere om interesseområdet er riktig justert. Juster de utvidede linjene hvis den ikke er det. Evaluer virtopsy datasett ved hjelp av fire hovedfunksjoner av rotasjoner, panorering zooming, og vindusnivå endringer.Den tredje er maksimal intensitetprojeksjon, MIP. Endre gjengivelsesmodus til MIP ved å klikke MIP i gjengivelsesmodus mini verktøylinjen justere skive tykkelsen på høyre øvre hjørne ved å klikke den grønne merknaden og velge en ny tykkelse for å visualisere området av interesse. Evaluer virtopsy datasett ved hjelp av fire hovedfunksjoner for rotasjoner, panorering, zooming og vindusnivåendringer.Den fjerde er minimum intensitet projeksjon, MinIP. Endre gjengivelsesmodus til MinIP ved å klikke MinIP i miniverktøylinjen i gjengivelsesmodus. Juster platetykkelsen øverst til høyre ved å klikke på den grønne merknaden og velge en ny tykkelse for å visualisere interesseområdet.Evaluer virtopsy datasett ved hjelp av fire hovedfunksjoner for rotasjoner, panorering, zooming og vindusnivåendringer. Den femte er direkte volumgjengivelse, DVR. Som et av standard skjermgrensesnitt for to etter to, viser DVR 3D-gjengitte bilder av.Standard DVR-malinnstilling er AAA, noe som gir en brutto skjelettstrukturer av. Juster gjengivelsesinnstillingene automatisk via klikkemalen under seerne og velg de riktige DVR-malene. For eksempel grå, 10%og brudd.Bruk fire hovedfunksjoner for rotasjoner, panorering, zooming og vindusnivåendringer for ytterligere korrigeringer. De seks er segmentering og interesseområde, avkastning, redigering. Segmenter CT-sektoren ved hjelp av tre forskjellige verktøy.Skive og cubed view verktøy, FreeROI verktøy, og dynamisk region voksende verktøy. For skive og cubed visning verktøy, klikk skive under verktøy, noe som gir en parallell visningslinje. Juster skiveplasseringen ved å flytte MPR-trådkorset fra tilsvarende MPR-visninger.Endre skivetykkelsen via skivetykkelseslinjen, noe som resulterer i en segmentering av 3D-gjengitte bilder av. For FreeROI-verktøyet klikker du FreeRO under verktøy. Hold nede skifttasten på tastaturet for å utelate eller inkludere et interesseområde fra MPR-visninger og DVR.Klikk område under verktøy for dynamisk områdevekstverktøy. Hold på skifttastene på tastaturet, venstreklikk hold museknappen og bla midtknappen med musen som gir et uthevet område. Klikk utelat for å slette området.Den syvende er overføringsfunksjoner, TF. Klikk på 3D-innstillinger under visningsprogrammet. Velg kopier for å opprette en ny 3D-rekonstruert modell. Klikk FreeRO eller region under verktøy i den nye 3D-rekonstruerte modellen.Hold nede skifttastene på tastaturet, og bruk 3D VR til å inkludere et interesseområde. Klikk deretter velg, høyreklikk en av glidebryterne i fargelysbildelinjen for å endre fargen på DVR. Velg endre farge, og definer om nødvendig en egendefinert farge fra fargepalmer.Den åttende er perspektiv volumgjengivelse, PVR. For å starte gjennomstrømningsmodulen, høyreklikk på den valgte serien og velg gjennomstrømning fra høyreklikkmenyen. Velg den primære 3D-veiviseren for lesestil for valg av primærvisning.Klikk skjermoppsettet for to og to, og greit. Resulterer i automatisk PVR. Kontroller at interesseområdet er valgt.Bygge en flybane ved å plassere starten og slutten av kontrollpunkter ved å tegne en bane. Rett banen ved å klikke på alternativknappen rediger tilkobling eller rediger bane i verktøypanelet. Hvis det er en ødelagt bane eller manglende struktur, legger du den til kontrollpunktene for jevnere deler av kurven eller retter problemene.Opprett nye kontrollpunkter ved å klikke på flybanen. Når flybanen er riktig, klikker du på ok. Vis gjennomstrømsvinduet som vises som viser et hovedvindu for gjennomstrøming, MPR-visninger og flat visning.Bruk 3D-verktøy ved å klikke på verktøypanelet på høyre side av skjermen for å evaluere armstrukturen. Juster hastigheten og retningen på fly-through ved hjelp av fly bakover, pause, fly fremover, senk farten fly-through, og fremskynde fly-through under 3D-verktøyene. Fra januar 2014 til mai 2020 ble totalt 193 cetaceans strandet i Hong Kong farvann undersøkt av postmortem computertomografi.Her er resultatene for hvert bildegjengivelsesteknikker som brukes i de biologiske helse- og profilundersøkelsene av strandede cetaceans. MPR-funksjon som viser en syk indo-stillehavs-knølhvaldelfin i aksial, rekonstruert 3D, rekonstruert koronar, rekonstruert sagittal utsikt. Lineære og områdemålinger for diagnostisering av atlanto-occipital forvridning er også demonstrert.HLR-funksjon som viser buede strukturer i flipperen til en syk Indo-Pacific Venus Porpoise i synspunkt. MIP-funksjon som fremhever hyper-dempede lungeknoppfeller dukket opp som intense hvite prikker i begge lungene til en syk Indo-Pacific Venus porpoise. MinIP-funksjon som fremhever hyper-dempede gjestevisningsstrukturer som er tracheobronchialtrærne i begge lungene til en syk Indo-Pacific Venus Porpoise.DVR-funksjon, som viser forskjellige komponenter i en syk Indo-Pacific Venus nise. Vaskulatur overlaid med skjelettsystem er uthevet av AAA. Åndedrettssystemet er fremhevet av lunge.Skjelettsystemet, inkludert vertebrale fysioplater, fremheves av bein pluss plater. Hyper-dempede ørebein og fiskekroker er fremhevet av maskinvare. ROI redigeringsfunksjon som viser en syk Indo-Pacific Venus nise, med CT sofaen og med CT sofaen fjernet.TF-funksjon som viser forskjellige komponenter i en syk Indo-Pacific Venus nise. Sand i luftseken er uthevet i cyan. Mageinnhold er uthevet i grønt.Parasittisk granulomatøs mastittlesjon er uthevet i rødt. PVR-funksjon som viser en virtuell enteroskopi av en syk indo-stillehavs-knølfinfin med fly-through-funksjonen. Basert på vår erfaring var de oppførte åtte gjengivelsesteknikkene i stand til å identifisere de fleste av postmortemfunnene i strandede cetaceans, og tjene som et verktøy for å undersøke deres biologiske helse og profil mens andre gjengivelsesteknikker ble omstridt i den nåværende studien på grunn av deres uvanlige bruk og begrenset nytte.En riktig utnyttelse av gjengivelsesteknikker kan forbedre postmortemdiagnosen og effektivt relatere slik komplisert informasjon, for eksempel den underliggende patologien og atomstrukturene, samt skjelettmorfologi og taksonomi til andre henvisende veterinærer, klinikere og forskere på en bedre og enklere forståelse.

Research

JoVE Journal

Biology

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Visualizing  developing organ formation as well as progession and treatment of disease often  heavily relies on the ability to optically interrogate ...

Rapid Homogeneous Detection of Biological Assays Using Magnetic Modulation Biosensing System

A magnetic modulation biosensing system (MMB) [1,2] rapidly and homogeneously detected biological targets at low concentrations without any washing or ...

Evaluation of the Spatial Distribution of &gamma;H2AX following Ionizing Radiation

Evaluation of the Spatial Distribution of &#947;H2AX following Ionizing Radiation

An early molecular response to DNA double-strand breaks (DSBs) is phosphorylation of the Ser-139 residue within the terminal SQEY motif of the histone ...

Patch Clamp and Perfusion Techniques for Studying Ion Channels Expressed in Xenopus oocytes

Patch Clamp and Perfusion Techniques for Studying Ion Channels Expressed in Xenopus oocytes

The protocol presented here is designed to study the activation of the large conductance, voltage- and Ca2+-activated K+ (BK) channels. The protocol may ...

Time-lapse Microscopy of Early Embryogenesis in Caenorhabditis elegans

Time-lapse Microscopy of Early Embryogenesis in Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans has often been used as a model system in studies of early developmental processes.  The transparency of the 
embryos, the genetic ...

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Isolering av ribosome Innbundne begynnende polypeptider<em&gt; In vitro</em&gt; For å identifisere translasjonelle Pause steder langs mRNA

The rate of translational elongation is non-uniform. mRNA secondary structure, codon usage and mRNA associated proteins may alter ribosome movement on the ...

Using SecM Arrest Sequence as a Tool to Isolate Ribosome Bound Polypeptides

Bruke SecM Arrest sekvens som et verktøy for å isolere ribosom Innbundne polypeptider

Extensive research has provided ample evidences suggesting that protein folding in the cell is a co-translational process1-5. However, the exact pathway ...

Gap Junctional Intercellular Communication: A Functional Biomarker to Assess Adverse Effects of Toxicants and Toxins, and Health Benefits of Natural Products

Gap junctional interkommunikasjons: En funksjonell biomarkør for å vurdere skadevirkninger av giftstoffer og giftstoffer, og helsemessige fordeler av Natural Products

This protocol describes a scalpel loading-fluorescent dye transfer (SL-DT) technique that measures intercellular communication through gap junction ...

The Assembly and Application of 'Shear Rings': A Novel Endothelial Model for Orbital, Unidirectional and Periodic Fluid Flow and Shear Stress

Forsamlingen og anvendelse av &#39;Skjær Rings&#39;: A Novel endotel modell for Orbital, Enveis og Periodisk Fluid Flow og skjærspenning

Deviations from normal levels and patterns of vascular fluid shear play important roles in vascular physiology and pathophysiology by inducing adaptive as ...

Preparation and Observation of Thick Biological Samples by Scanning Transmission Electron Tomography

Utarbeidelse og Observasjon av Thick biologiske prøver av Scanning Transmission Electron Tomography

This report describes a protocol for preparing thick biological specimens for further observation using a scanning transmission electron microscope. It ...