Identifiering av alternativ skarvning och polyadenylering i RNA-seq-data

Alternativ skarvning (AS) och alternativ polyadenylation (APA) utökar mångfalden av transkriptisoformer och deras produkter. Här beskriver vi bioinformatiska protokoll för att analysera bulk RNA-seq och 3 'end sequencing assays för att detektera och visualisera AS och APA som varierar över experimentella förhållanden.