Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
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Conclusion
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Dieses analytische Protokoll ermöglicht die Untersuchung pathogener Bakterienpopulationen in großem Maßstab. Das ist sehr wichtig, weil es die Art und Weise verbessert, wie ökologische und epidemiologische Untersuchungen durchgeführt werden können
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Diese analytische Berechnungsplattform bietet praktische Anleitungen für Mikrobiologen, Ökologen und Epidemiologen, die sich für die Genomik der Bakterienpopulation interessieren. Insbesondere zeigte die hier vorgestellte Arbeit, wie man Folgendes durchführt: i) phylogenie-geführte Kartierung hierarchischer Genotypen; ii) frequenzbasierte Analyse von Genotypen; iii) Verwandtschafts- und Klonalitätsanalysen; iv) Identifizierung der Abstammungsdifferenzierung der akzessorischen Loci.