Construction of the Markov State Model from Atomic Molecular Dynamics Simulations
6:26
Conducting Coarse-Grained Simulation to Sample Long-Time Dynamics
6:57
Results: Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements
8:45
Conclusion
Transcript
الهدف من هذا البروتوكول هو الكشف عن الديناميكيات الهيكلية لنشر البروتين أحادي البعد على طول الحمض النووي ، باستخدام عامل النسخ النباتي WRKY مجال البروتين كنظام مثالي. تكشف المحاكاة الذرية في إطار بناء نموذج حالة ماركوف عن حركات خطوة بمقدار 1 نقطة
Sign in or start your free trial to access this content
الهدف من هذا البروتوكول هو الكشف عن الديناميكيات الهيكلية لنشر البروتين أحادي البعد على طول الحمض النووي ، باستخدام عامل النسخ النباتي WRKY مجال البروتين كنظام مثالي. للقيام بذلك ، تم تنفيذ كل من محاكاة الديناميكا الجزيئية الذرية والحبيبات الخشنة جنبا إلى جنب مع عينات حسابية واسعة النطاق.