Construction of the Markov State Model from Atomic Molecular Dynamics Simulations
6:26
Conducting Coarse-Grained Simulation to Sample Long-Time Dynamics
6:57
Results: Structure-Based Simulation and Sampling of Transcription Factor Protein Movements
8:45
Conclusion
Transcript
इस प्रोटोकॉल का लक्ष्य डीएनए के साथ प्रोटीन के एक आयामी प्रसार की संरचनात्मक गतिशीलता को प्रकट करना है, एक अनुकरणीय प्रणाली के रूप में एक संयंत्र प्रतिलेखन कारक WRKY डोमेन प्रोटीन का उपयोग करना। मार्कोव राज्य मॉडल निर्माण के तहत परमाणु सिमुलेशन पर
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इस प्रोटोकॉल का लक्ष्य डीएनए के साथ प्रोटीन के एक आयामी प्रसार की संरचनात्मक गतिशीलता को प्रकट करना है, एक अनुकरणीय प्रणाली के रूप में एक संयंत्र प्रतिलेखन कारक WRKY डोमेन प्रोटीन का उपयोग करना। ऐसा करने के लिए, दोनों परमाणुवादी और मोटे दानेदार आणविक गतिशीलता सिमुलेशन के साथ-साथ व्यापक कम्प्यूटेशनल नमूने लागू किए गए हैं।