Loading the Phylogenetic Codon Substitution Frequencies (PhyloCSF) Track Hub to the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser
1:25
Navigating to Genes of Interest Using Gene Identifiers
2:20
Navigating to Genomic Regions of Interest Using Sequence Information
3:10
Identifying Conserved Short Open Reading Frames (sORFs) Using PhyloCSF Track Data
4:06
Viewing Homologous Regions in Other Genomes
4:51
Generating Multi-Species Sequence Alignments for Microproteins of Interest
6:47
Results: Identification of Genomic Regions of Interest for Microprotein-Coding Potential
8:47
Conclusion
Transcript
يوفر البروتوكول الموصوف هنا تعليمات مفصلة حول تحليل المناطق الجينومية ذات الأهمية لإمكانات ترميز البروتين باستخدام phyloCSF على متصفح الجينوم UCSC سهل الاستخدام. يمكن ل PhloCSF تحديد أطر القراءة المفتوحة القصيرة المحفوظة بشكل فعال مع إمكانات ترميز
Sign in or start your free trial to access this content
يوفر البروتوكول الموضح هنا تعليمات مفصلة حول كيفية تحليل المناطق الجينومية ذات الأهمية لإمكانات ترميز البروتين الدقيق باستخدام PhyloCSF على متصفح UCSC Genome سهل الاستخدام. بالإضافة إلى ذلك ، يوصى بالعديد من الأدوات والموارد لمواصلة التحقيق في خصائص تسلسل البروتينات الدقيقة المحددة لاكتساب نظرة ثاقبة على وظائفها المفترضة.