Loading the Phylogenetic Codon Substitution Frequencies (PhyloCSF) Track Hub to the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser
1:25
Navigating to Genes of Interest Using Gene Identifiers
2:20
Navigating to Genomic Regions of Interest Using Sequence Information
3:10
Identifying Conserved Short Open Reading Frames (sORFs) Using PhyloCSF Track Data
4:06
Viewing Homologous Regions in Other Genomes
4:51
Generating Multi-Species Sequence Alignments for Microproteins of Interest
6:47
Results: Identification of Genomic Regions of Interest for Microprotein-Coding Potential
8:47
Conclusion
Transcript
Das hier beschriebene Protokoll enthält detaillierte Anweisungen zur Analyse genomischer Regionen von Interesse auf Proteinkodierungspotenzial mit phyloCSF im benutzerfreundlichen UCSC-Genombrowser. PhloCSF kann effektiv konservierte kurze offene
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Das hier beschriebene Protokoll enthält detaillierte Anweisungen zur Analyse genomischer Regionen von Interesse auf Mikroprotein-kodierendes Potenzial mit PhyloCSF im benutzerfreundlichen UCSC Genome Browser. Darüber hinaus werden mehrere Werkzeuge und Ressourcen empfohlen, um die Sequenzeigenschaften identifizierter Mikroproteine weiter zu untersuchen und Einblicke in ihre mutmaßlichen Funktionen zu erhalten.