Loading the Phylogenetic Codon Substitution Frequencies (PhyloCSF) Track Hub to the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser
1:25
Navigating to Genes of Interest Using Gene Identifiers
2:20
Navigating to Genomic Regions of Interest Using Sequence Information
3:10
Identifying Conserved Short Open Reading Frames (sORFs) Using PhyloCSF Track Data
4:06
Viewing Homologous Regions in Other Genomes
4:51
Generating Multi-Species Sequence Alignments for Microproteins of Interest
6:47
Results: Identification of Genomic Regions of Interest for Microprotein-Coding Potential
8:47
Conclusion
Transcript
הפרוטוקול המתואר כאן מספק הוראות מפורטות לניתוח אזורים גנומיים בעלי עניין עבור פוטנציאל קידוד חלבונים באמצעות phyloCSF בדפדפן הגנום הידידותי למשתמש UCSC. PhloCSF יכול לזהות ביעילות מסגרות קריאה פתוחות קצרות ושמורות עם פוטנציאל קידוד מיקרו-חלבונים
Sign in or start your free trial to access this content
הפרוטוקול המתואר כאן מספק הוראות מפורטות כיצד לנתח אזורים גנומיים בעלי עניין עבור פוטנציאל קידוד מיקרופרוטאין באמצעות PhyloCSF בדפדפן הגנום הידידותי למשתמש UCSC. בנוסף, מומלץ להמשיך ולחקור את מאפייני הרצף של מיקרופרוטאינים שזוהו כדי לקבל תובנה לגבי הפונקציות הפוטטיביות שלהם.