Name: determining binding affinity (kd) of radiolabeled antibodies to immobilized antigens
Uploaded: 2022-06-23T13:40:00
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저자들은 [89Zr]Zr-oxalate의 생산에 대한 3D Imaging 및 Janssen Pharmaceuticals의 Sheri Moores 박사에게 항체를 제공 한 것에 대해 감사드립니다.

참고: 프로토콜의 그래픽 표현은 그림 2 를 참조하십시오.
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63927/63927fig02.jpg"> 그림 2: 프로토콜의 회로도. 행 및 열 레이블은 파손 가능한 96웰 플레이트를 설정하기 위한 지침으로 표시됩니다. 예상되는 결합은 항원 및 BSA에 대한 예에서 잘 도...

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rAbs 개발의 일부로서, rAb가 높은 결합 친화도로 그의 표적에 특이적으로 결합하도록 보장하는 것이 중요하다. 결합 친화도를 결정하는 것은 rAb의 면역반응성이 고정화된 항원을 사용하는 방사성리간드 포화 분석을 통한 방사성접합에 의해 영향을 받는지 여부를 알릴 수 있다. BSA에 대한 rAb 결합을 결정하는 것은 고정화된 항원에 대한 특이적 결합을 보다 정확하게 측정하기 위해 비특이적 결합을...

방사성 표지 항체 (rAb)는 의학에서 다양한 용도를 갖는다. 대다수가 종양학에서 이미징 및 치료제로 활용되지만, 류마티스학 관련 염증, 심장학 및 신경학에 대한 이미징 응용 프로그램이있습니다 1. 이미징 rAbs는 병변을 감지하는 데 높은 민감도를 가지며 치료 2,3,4,5에 대한 환자 선택을 도울 가능성이 있습니다. 그들은 또한 각각의 항원에 대한 특이성 때문에 치료에 사용됩니다. 테라노스틱스(theranostics)로 알려진 전략에서, 동일한 rAb가 이미징 및 치료6 둘 다에 사용된다.
이상적으로는, 방사성 표지를 위해 선택된 항체는 비방사성 표지 방법을 사용하여 높은 결합 친화도 및 특이성을 갖는 것으로 이미 입증된 것이다. 항체의 방사성 표지는 안정한 공유 결합 (예를 들어, 방사성 요오드)을 형성하는 방사성 핵종을 갖는 항체의 직접적인 화학적 변형을 통해 또는 후속적으로 방사성 금속 7,8에 배위되는 킬레이터와의 접합을 통해 간접적으로 달성 될 수 있습니다. 방사성 요오드와 같은 직접 방사성 표지는 항체 상의 티로신 및 히스티딘 잔기를 특이적으로 변형시킨다. 이들 잔기가 항원 결합에 중요하다면, 이 방사성 접합은 결합 친화도를 변화시킬 것이다. 반대로, 항체의 접합 및 간접 방사성 표지를 위한 다수의 확립된 프로토콜이 있다. 예를 들어, 항체의 PET 영상화를 위해 지르코늄-89 (89Zr)에 결합하는데 사용되는 일반적인 킬레이터는 p-이소티오시아네이토벤질-데스페리옥사민 (DFO)이며, 이는 항체 9,10의 리신 잔기에 랜덤하게 접합된다. 항원 결합 영역에 리신 잔기가 있는 경우, 이들 부위에서의 컨쥬게이션은 항원 결합을 입체적으로 방해할 수 있고, 따라서 항체-항원 결합을 손상시킬 수 있다. 따라서, 항체의 간접적 또는 직접 방사성 표지에 사용되는 상이한 방사성접합 방법은 잠재적으로 면역반응성에 영향을 미칠 수 있으며, 이는 항체 방사성접합체가 그의 항원(7,11)에 결합하는 능력으로 정의된다. 부위-특이적 컨쥬게이션 방법은 이러한 제한을 회피할 수 있지만, 이들 기술은 추가적인 시스테인 잔기 또는 탄수화물 잔기 12,13,14,15,16에 대한 효소 반응에 대한 전문 지식을 통합하기 위해 항체 공학을 필요로 한다. 일단 항체가 방사성 표지되면, 면역반응성이 rAb의 특성화의 일부로서 유지되는지를 시험하는 것이 중요하다. 면역반응성을 측정하는 한 가지 방법은 rAb의 결합 친화도를 결정하는 것이다.
이 프로토콜의 목적은 rAb-항원 결합을 정량화하기 위해 확립된 방사성리간드 포화 검정을 사용하여 rAbs에 대한 결합 친화도를 결정하는 과정을 기술하는 것이다. 결합 추세는 그림 1에 요약되어 있습니다. 결합된 항원의 양은 고정화된 항원의 고정된 양에 더 많은 rAb가 첨가됨에 따라 증가할 것이다. 일단 모든 항원-결합 부위가 포화되면, 고원에 도달할 것이고, 더 많은 rAbs를 첨가하는 것은 결합된 항원의 양에 아무런 영향을 미치지 않을 것이다. 이 모델에서, 평형 해리 상수(KD)는 항원 수용체17의 절반을 차지하는 항체의 농도이다. KD는 항체가 더 높은 결합 친화도에 상응하는 더 낮은 KD를 갖는 그의 표적에 얼마나 잘 결합하는지를 나타낸다. 이상적인 rAb는 18 나노몰이하의 KD를 가져야 한다는 것이 이전에 보고되었다. 그러나, 보다 최근의 rAbs는 낮은 나노몰범위의 KD와 함께 개발되었으며, 비침습적 이미징 응용(19,20,21,22)에 적합한 것으로 간주된다. rAbs의 방사성 리간드 포화 분석에서 결정될 수 있는 또 다른 파라미터는 항원 결합의 최대량에 상응하는Bmax이다. Bmax는 필요한 경우 항원 분자의 수를 계산하는데 사용될 수 있다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63927/63927fig01.jpg"> 그림 1: 대표적인 포화 결합 곡선. 결합된 항원의 백분율은 고정된 양의 항원에 첨가된 항체의 농도 증가에 대해 플롯팅된다. 팝 아웃은 다양한 지점에서 바인딩을 보여줍니다. KD 및Bmax에 상응하는농도 및 결합이 각각 도시되어 있다. 이 그림은 BioRender.com 로 만들어졌습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63927/63927fig01large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
이러한 분석은 방사성 표지된 이중특이적 항체 구축물이 그들의 각각의 항원과 결합하는 방사성 표지된 이중특이적 항체의 각각의 단편 항원 결합 영역 (Fab) 암에 대한 KD를 결정하기 위해 특히 중요하다. 이 프로토콜은 각각의 항원에 대한 각각의 Fab 아암의 결합 친화도가 방사성접합 후에 영향을 받았는지 여부를 독립적으로 특성화하기 위해 고정화된 항원 상에서 개별적으로 각각의 Fab 아암의 KD를 결정하는데 사용될 수 있다. 이 프로토콜은 표피 성장 인자 수용체 (EGFR) 및 세포질 중간엽 상피 전이 (cMET) 단백질19에 대한 이중특이적 항체인 방사성 표지된 아미반타맙의 사용에 의해 입증된다. 방사성 표지된 단일-아암 항체, 여기서 하나의 Fab 아암은 EGFR (α-EGFR) 또는 cMET (α-cMET)에 결합하고, 다른 Fab 아암은 이소형인 대조군이고, 또한 실시예19로서 사용되었다. 이 프로토콜은 또한 고정화될 수 있는 공지된 항원을 갖는 임의의 방사성 표지된 항체에 적합하다. 이 프로토콜에서, rAb의 희석 시리즈는 rAb의 각 Fab 암에 특이적인 지정된 웰 내의 고정화된 항원의 고정된 양에 첨가된다. rAb는 또한 항원 없이 소 혈청 알부민(BSA)으로만 차단된 웰에 첨가되어, 비특이적 결합을 결정한다. 특이적 결합을 결정하기 위해, 고정화된 항원에 대한 비특이적 결합은 총 rAb 결합에서 뺍니다. 이어서, 생성된 포화 결합 곡선은 전술한 바와 같이 KD를 결정하는데 사용된다.
이 방법의 한 가지 장점은 세포주를 항원의 공급원으로 사용하는 것에 비해 정제된 항원을 사용할 때 항원 발현 수준이 세포 배양 중에 영향을 받을 수 있고 상이한 세포주가 항원 발현의 가변 수준을 갖는다는 점을 고려할 때 재현성이 더 높다는 것이다. 방사성 표지된 이중특이적 항체의 경우에, 다른 항원 중 하나만을 발현하지 않고 단지 하나의 항원을 발현하는 세포주는 이용가능하지 않을 수 있고, 이는 개별 Fab 아암의 결합 친화도를 특성화하는 것을 매우 어렵게 만들 것이다. 주목할 만하게, 비방사성 표지된 방법에 비해 방사성 리간드 포화 분석 방법의 주요 이점은 rAb의 비접합 분획의 기여 없이 rAb의 결합 친화도의 특이적 특성화이다. 저자가 아는 한, 현재 rAb를 그의 모 접합되지 않은 항체로부터 분리하는 정제 기술은 없다. 킬레이터 및 방사성핵종의 비교적 작은 크기를 감안할 때, rAb의 전체 분자량에 대한 이들의 기여는 크기 배제 크로마토그래피에서 중요하지 않다. 따라서, 임의의 방사성 표지 기술로부터 생성된 생성물은 거의 항상 rAb 및 그의 모 접합되지 않은 항체의 혼합물이다. 방사성 표지된 포화 검정을 사용하여 결합 친화도를 특성화하면 테스트 중인 제품이 전적으로 rAb임을 확인할 수 있습니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin (BSA)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A9647</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gamma Counter</td>
			<td>Hidex</td>
			<td>Hidex Automatic Gamma Counter</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GraphPad Prism Software</td>
			<td>GraphPad</td>
			<td></td>
			<td>version 9.2; used for statistical analyses in this study</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Immuno Breakable MaxiSorp 96-well plates</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>473768</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microplate Sealing Tape</td>
			<td>Corning</td>
			<td>4612</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microsoft Excel</td>
			<td>Microsoft</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate Buffered Saline (PBS)</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>14190144</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Bicarbonate</td>
			<td>JT Baker</td>
			<td>3506-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Carbonate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>S7795</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tween-20</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P7949</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

determining binding affinity (kd) of radiolabeled antibodies to immobilized antigens

결합 친화도(KD)를 결정하는 것은 방사성 표지된 항체 (rAb)의 특성화의 중요한 측면이다. 전형적으로, 결합 친화도는 평형 해리 상수, KD로 표시되고, 항체 결합 부위의 절반이 평형에서 점유되는 항체의 농도로서 계산될 수 있다. 이러한 방법은 임의의 방사성 표지된 항체 또는 다른 단백질 및 펩티드 스캐폴드로 일반화될 수 있다. 세포-기반 방법과 대조적으로, 고정화된 항원의 선택은 항체의 장기간 저장 후 결합 친화도를 검증하고, 이중특이적 항체 구축물에서 단편 항원 결합 영역 (Fab) 암의 결합 친화도를 구별하고, 상이한 세포주 사이의 항원 발현에 가변성이 있는지를 결정하는데 특히 유용하다. 이 방법은 고정된 양의 항원을 파손가능한 96-웰 플레이트 상의 지정된 웰에 고정시키는 것을 포함한다. 이어서, 비특이적 결합은 소 혈청 알부민(BSA)으로 모든 웰에서 차단되었다. 이어서, rAb를 모든 웰에 농도 구배로 첨가하였다. rAb가 포화에 도달할 수 있도록 농도의 범위, 즉 모든 항원이 rAb에 의해 연속적으로 결합되는 항체의 농도를 선택하였다. 항원이 고정화되지 않은 지정된 웰에서, rAb의 비특이적 결합이 결정될 수 있다. 고정화된 항원을 갖는 웰에서의 총 결합으로부터 비특이적 결합을 뺀 것으로써, 항원에 대한 rAb의 특이적 결합이 결정될 수 있다. rAb의 KD를 생성된 포화 결합 곡선으로부터 계산하였다. 예로서, 결합 친화도는 표피 성장 인자 수용체 (EGFR) 및 세포질 중간엽-상피 전이 (cMET) 단백질에 대한 이중특이적 항체인 방사성 표지된 아미반타맙을 사용하여 결정되었다.

이 방법은 고정화된 항원의 고정된 양에 상이한 농도의 rAb가 첨가된 포화 결합 검정에 기초하여 rAb에 대한 결합 친화도(KD)를 계산한다. 결합 곡선은 처음에는 가파른 대수 성장을 따라야하며 항원이 포화됨에 따라 고원화되어야합니다. 결정된 KD가 정확하다는것을 보장하기 위해, rAb의 농도는 포화에 도달하기에 충분히 높아야 한다. 이 검정을 위해, 방사성 표지된 항체를 DFO에 접...

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Determining Binding Affinity KD of Radiolabeled Antibodies to Immobilized Antigens

여기에서, 고정화된 항원에 대한 방사성 표지된 항체의 결합 친화도(KD)를 결정하는 방법이 기재되어 있다. KD 는 다양한 농도에서 그의 항원에 대한 방사성 표지된 항체의 전체적, 특이적, 및 비특이적 결합을 측정함으로써 포화 결합 실험으로부터 결정될 수 있는 평형 해리 상수이다.

고정화된항원에 대한 방사성 표지된 항체의 결합 친화도 (KD) 결정

Determining binding affinity (KD) is an important aspect of the characterization of radiolabeled antibodies (rAb). Typically, binding affinity is ...

이 방법은 그의 항원에 대한 방사성 표지된 항체의 결합 친화도를 결정할 수 있다. 또한 결합의 특이성을 측정할 것이다. 이러한 간단한 방법의 주요 이점은 접합되지 않은 모 항체로부터의 간섭 없이 방사성표지된 항체만의 결합 친화도의 특이적 특성화이다.이 기술은 방사성 표지된 항체가 그의 표적에 결합하는 능력을 정량적으로 검증한다. 이것은 핵 영상 및 다양한 질병에서의 핵 요법에 응용하는 데 중요합니다. 절차를 시연하는 것은 내 실험실의 대학원 동료 인 Erika Belitzky가 될 것입니다.시작하려면 191 밀리그램의 중탄산나트륨과 23.9 밀리그램의 탄산나트륨을 50 밀리리터 원뿔형 튜브에 첨가하여 고정화 완충액을 준비하십시오. 그런 다음 40 밀리리터의 18 메가 옴 물을 넣고 볼텍싱하여 녹입니다. 이제 총 부피를 50 밀리리터로 가져 오기 전에 pH를 9.0으로 조정하십시오.다음으로, 200 밀리리터의 PBS와 100 마이크로리터의 트윈 20을 250 밀리리터 병에 첨가하여 200 밀리리터의 세척 완충액을 준비한다. 또한 50 밀리그램의 BSA와 25 마이크로리터의 트윈 20 ~ 50 밀리리터의 PBS를 첨가하고 볼텍싱하여 혼합하여 50 밀리리터의 결합 완충액을 준비하십시오. PBS 50 밀리리터에 BSA 1.5 그램을 첨가하여 블로킹 버퍼를 제조하고 부드럽게 와류하여 혼합한다.고정화 완충액에 항원을 희석하십시오. 그런 다음 깨지기 쉬운 96 웰의 평평한 바닥 플레이트를 취하여 100 마이크로 리터의 항원을 8 x 세 개의 배열로 24 웰의 각 웰 바닥에 첨가하십시오. 플레이트를 밀봉 테이프로 덮고 하룻밤 사이에 섭씨 네 도에서 배양하십시오.다음날, 세척 완충액으로 접시를 세 번 씻으십시오. 싱크대에서 플레이트를 활발하게 뒤집어 액체를 처분하고 종이 타월 더미에 접시를 두드려 과도한 액체를 제거하십시오. 이어서, 항원을 함유하는 웰에, 다채널 피펫을 사용하여 웰당 300 마이크로리터의 세척 완충액을 첨가한다.웰당 300마이크로리터의 블로킹 버퍼를 24개의 항원 코팅 웰과 96웰 플레이트의 24개의 빈 웰 모두에 첨가한다. 이어서, 플레이트를 주변 온도에서 한 시간 동안 인큐베이션하고, 플레이트의 각 웰을 300 마이크로리터의 세척 완충액으로 세 번 세척한다. 방사성 표지된 항체의 세 배 연속 희석물을 플레이트 상의 A 내지 H로 지정된 여덟 행에 대한 결합 완충액 내에 만든다.먼저, 첫 번째 농도의 1.2 밀리리터 용액을 만드는 데 필요한 스톡 방사성 표지 항체의 부피를 계산하십시오. 그런 다음, B를 H로 표지된 마이크로원심분리 튜브에 800 마이크로리터의 결합 완충액을 첨가하고, 필요한 부피의 결합 완충액을 A로 표지된 마이크로원심분리 튜브에 첨가한다.스톡 방사성 표지된 항체의 계산된 부피를 튜브 A에 첨가하고 부드럽게 와류시킨다. 그런 다음, 미니 마이크로 원심분리기를 사용하여 스핀 다운하여 튜브의 바닥에있는 모든 액체를 수집하십시오.다음으로, 두 개의 A에서 튜브 B에 400 마이크로 리터의 액체를 넣으십시오.볼텍스 한 후 미니 마이크로 원심 분리기를 사용하여 스핀 다운하십시오. 마찬가지로, 튜브 B에서 튜브 C로, C에서 D까지, 튜브 H까지 용액을 추가하십시오.항원으로 고정 된 세 개의 웰과 BSA로만 차단 된 세 개의 웰에 웰 당 각 희석액의 100 마이크로 리터를 추가하십시오. 이제 A 표준에서 H 표준으로 표지 된 마이크로 원심분리 튜브에 각 희석액 100 마이크로 리터를 추가하고 감마 카운터에서 분석 할 방사성 표지 항체 표준으로 이러한 튜브를 저장합니다.플레이트를 섭씨 37도에서 한 시간 동안 부드럽게 흔들면서 배양하십시오. 원고에 설명된 바와 같이 각 웰에 대해 마이크로원심분리 튜브를 라벨링한다. 방사성 표지된 항체를 진공 흡인기기를 사용하여 96-웰 플레이트의 웰로부터 흡인한다.이제 다중 채널 피펫을 사용하여 300 마이크로 리터의 세척 버퍼를 각 웰에 추가하십시오. 세척 완충액을 흡인하고 세척을 네 번 더 반복하십시오. 웰을 적절한 마이크로 원심분리 튜브로 분해하십시오.H1, H2, H3, H3에서 A1, A2, A3으로 표시된 항원으로 튜브의 방사능을 계산한 다음 감마 카운터를 사용하여 H4, H5, H6, A4, A5, A6으로 표시된 BSA로만 표시하십시오. 방사성 표지된 아미반타맙은 EGFR 및 cMET 단백질에 대해 특이적 결합을 나타냈다. 유사하게 결합 친화도는 또한 EGFR 및 cMET 단백질에 결합된 단일팔 방사성 표지된 팹에 의해 유지되었다.포화 결합 플롯은 방사성 표지된 항체의 농도가 너무 낮을 때, 선형 곡선으로 표시된 바와 같이 포화가 달성되지 않았다는 것을 보여주었다. 너무 높았던 방사성 표지된 항체의 농도는 수평 고원에 의해 나타난 바와 같이 뚜렷한 대수 성장 없이 포화를 가져왔다. 또한, 높은 비특이적 결합은 고농도의 방사성 표지된 항체로 인해 나타났다.이 절차는 각각의 특정 방사성 표지된 항체에 대한 농도 범위를 최적화하기 위해 다수의 시도를 취할 수 있다. 부정적인 결과의 데이터를 사용하여 향후 실험을 설계할 수 있습니다. 일단 결합 친화도가 알려지면, 이는 방사성 표지된 항체의 특성화의 일부로서 다른 시험관내 검정에 대한 벤치마크로서 사용될 수 있다.

Research

JoVE Journal

Medicine

Determining Binding Affinity (KD) of Radiolabeled Antibodies to Immobilized Antigens

The Measurement and Treatment of Suppression in Amblyopia

약시의 억제의 측정 및 치료

Amblyopia, a developmental disorder of the visual cortex, is one of the leading causes of visual dysfunction in the working age population. Current ...

연구

의학

Determining The Electromyographic Fatigue Threshold Following a Single Visit Exercise Test

단일 방문 연습 시험을 다음과 근전도 피로 임계 값 결정

Theoretically, the electromyographic (EMG) fatigue threshold is the exercise intensity an individual can maintain indefinitely without the need to recruit ...

Determining Glucose Metabolism Kinetics Using 18F-FDG Micro-PET/CT

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사용 포도당 대사 속도론 결정<sup&gt; (18)</sup&gt; F-FDG 마이크로 PET / CT

This paper describes the use of 18F-FDG and micro-PET/CT imaging to determine in vivo glucose metabolism kinetics in mice (and is transferable to rats). ...

A Clinical Trial Assessing the Safety, Efficacy, and Delivery of Olive-Oil-Based Three-Chamber Bags for Parenteral Nutrition

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Limited evidence exists to precisely estimate efficacy and safety differences between parenteral nutrition (PN) prepared using olive-oil-based ...

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The benefits of renal sympathetic denervation (RDN) on blood pressure have been proved in a large number of clinical trials in recent years. However, the ...

Network Pharmacology Prediction and Experimental Validation of Trichosanthes-Fritillaria thunbergii Action Mechanism Against Lung Adenocarcinoma

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Author Spotlight: Understanding the Mechanism of Tuina Manipulation in Rats 

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Clinical trials suggest that Tuina manipulation is effective in treating knee osteoarthritis (KOA), while further studies are required to discover its ...