Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
5:54
Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
7:23
Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
8:28
Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54
Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45
Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
15:10
Conclusion
Transcript
No contexto da segurança química, o protocolo SeqAPASS fornece um processo rápido e simplificado para avaliar a conservação de proteínas em toda a diversidade de espécies, para extrapolação da toxicidade e do conhecimento da via biológica. O SeqAP
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Aqui, apresentamos um protocolo para utilizar a versão mais recente da ferramenta Alinhamento de Sequência da Agência de Proteção Ambiental dos EUA para Prever a Suscetibilidade entre Espécies (SeqAPASS). Este protocolo demonstra a aplicação da ferramenta on-line para analisar rapidamente a conservação de proteínas e fornecer previsões personalizáveis e facilmente interpretáveis de suscetibilidade química entre espécies.