Denna metod för dissektion och immunofluorescens anvĂ€nds av mĂ„nga C.elegans-laboratorier. Det kan antas för att detektera vilket protein som helst som en antikropp eller taggat fusionsprotein Ă€r tillgĂ€ngligt för. Ăven om det krĂ€ver viss övning för att fĂ„ denna dissektion rĂ€tt, Ă€r detta protokoll flexibelt och enkelt att felsöka.
För oss fungerar DAPI-fÀrgning alltid och vi kan vanligtvis hitta ett tillstÄnd som fungerar för varje antikropp. Den största utmaningen för denna teknik Àr dissektionssteget. Du mÄste arbeta snabbt men sÀkert för att fÄ bra bakterieprofiler.
Ăvning Ă€r nyckeln. För att börja, placera en hĂ„llbild pĂ„ scenen i ett dissekerande mikroskop och placera tĂ€ckglaset ovanpĂ„ hĂ„llbilden. Pipettera sedan fyra mikroliter av dissekeringslösningen i mitten av tĂ€ckglaset och flytta hĂ„llbilden till ena sidan av scenen för att frigöra vyn.
VÀlj 10 till 20 hermafroditer frÄn en NGM-platta i droppen av dissekeringslösning. Det Àr bÀst att vÀlja cirka 10 per bild men inte sÄ mÄnga att de inte kan dissekeras inom fem minuter. För att dissekera djuren, korsa nÄlarnas punkter för att göra en X-form och anvÀnd botten av X för att fÀsta en vuxen ner till ytan av tÀckglaset.
Placera sedan X-formen omedelbart bakom struphuvudet, ungefÀr en femtedel av kroppslÀngden hos en ung vuxen eller strax under den klara delen av huvudet. Halshugga sedan djuret med en saxrörelse och slÀpp helt frÄn kroppshÄlan, tillsammans med en eller bÄda halvorna av tarmen. För att fixera provet med formaldehyd, pipettera fyra mikroliter av fixlösningen pÄ tÀckglaset, mycket nÀra droppen med djur, samtidigt som man undviker att pipettera direkt i dissektionsdroppen och förskjuta de dissekerade slaktkropparna.
FÀst tÀckglaset pÄ hÄllarbilden med ett finger. Med den andra handen, knÀpp försiktigt tÀckglaset nÄgra gÄnger för att blanda dropparna. HÄll en positivt laddad glid framsida nedÄt, anvÀnd den för att plocka upp tÀckglaset i mitten av bilden genom att försiktigt röra provfallet, och ytspÀnningen pÄ droppen kommer att plocka upp tÀckglaset.
StÀll in rutschkanan pÄ bÀnken och fixa i exakt fem minuter vid rumstemperatur. Under denna tid, mÀrk bilden med en penna. För att frysa spricka provet med flytande kvÀve medan du hÄller den mÀrkta kanten pÄ bilden med pincett, sÀnk det försiktigt till flytande kvÀve.
SlÀpp bilden, sÄ att den lutar sig mot bÀgarens sida med tÀckglassidan uppÄt, och bilderna fryses inom 10 sekunder. Om du anvÀnder torris för att frysa, efter att ha skrapat frosten frÄn aluminiumblockets yta med en rakhyvel, hÄll fast den mÀrkta kanten pÄ bilden och stÀll den pÄ den rensade ytan och applicera lite tryck nedÄt för att sÀkerstÀlla full kontakt med blocket. Frysning sker inom 10 sekunder nÀr provet under tÀckglaset förvandlas till is.
Ta bort den frusna rutschkanan genom att ta ett fast grepp om rutschkanans mÀrkta kortkant och hÄll en lÄng kant mot bÀnken. Med den andra handen tar du ett fast tag i en rakhyvel och skjuter rakhyvelns kant nerför rutschkanan för att knÀppa tÀckglaset av och bort frÄn provet. Placera omedelbart bilden i en Coplin-burk som innehÄller 95% etanol och lÀmna glasen i etanol i minst fem minuter.
TvÀtta sedan bilderna i PBST tre gÄnger i fem minuter vardera vid rumstemperatur, medan du anvÀnder fÀrsk PBST för varje tvÀtt. Fluorescensavbildningsresultat av bakteriekÀrnor visade att DAPI binder starkt till DNA. ImmunofluorescensfÀrgning var effektiv nÀr antikroppen riktad mot RAD-51, en markör för dubbelstrÀngsbrott, var nÀrvarande som diskreta foci i miotiska kÀrnor, samlokaliserade pÄ kromosomer markerade med DAPI.
Kle-2-heterozygotmutanterna har mindre defekter i kromosomstrukturen, vilket framgÄr av nÄgot oordnad DAPI-fÀrgning och en ökning av dubbelstrÀngsbrytningstalet, vilket Äterspeglas i det högre antalet RAD-51-foci. BÄde dissektions- och fryssprickorna kan vara knepiga sÄ det Àr viktigt att arbeta snabbt och smidigt. Vi rekommenderar att du övar dessa steg innan du försöker hela protokollet.
Du kan till exempel öva pÄ att dissekera i en större volym vÀtska, som 200 mikroliter, och gradvis arbeta ner till vÄr rekommenderade volym pÄ fyra mikroliter i en tÀckslip. Denna teknik kan anvÀndas för högupplöst avbildning pÄ ett konfokalt eller strukturerat belysningsmikroskop, eller sÄ kan den anvÀndas i kombination med DNA eller RNA-FISH, fluorescens in situ hybridisering, för att visualisera hur proteiner lokaliseras i förhÄllande till specifika sekvenser.