Karakterisering av en patogen Escherichia coli-stam härledd från Oreochromis spp. Gårdar som använder helgenomsekvensering

Genomförbarheten av strategier för helgenomsekvensering (WGS) med hjälp av bänkinstrument har förenklat genomförhöret av varje mikrob av folkhälsorelevans i en laboratoriemiljö. En metodologisk anpassning av arbetsflödet för bakteriell WGS beskrivs och en bioinformatisk pipeline för analys presenteras också.