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04:52 min
February 3rd, 2023
DOI :
10.3791/64709-v
Chapters
0:05
Introduction
0:52
PCR Optimization
1:57
Parallel Capillary Electrophoresis and Calibration
3:18
Results: Mutant Allele Expression
4:21
Conclusion
Transcript
挿入、欠失、重複、反転などの構造変異は、これまで実験的に追跡することがより困難であり、それらの頻度はアンプリコンシーケンシングによって正確に測定することはできませんでした。ここでは、三重プライマー設計と並列キャピラリーエレクトロフェレーシスを組み合わせて、構造バリアント対立遺伝子頻度を経時的に追跡する、シンプルで費用対効果の高い技術を提供します。この方法は、実験的進化におけるエンドポイントシーケンシングを補完し、新興のde novo対立遺伝子の頻度をたどるように設計されました。
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Summary
我々は、実験的進化凍結アーカイブに容易に適応できる非一塩基多型対立遺伝子動態を追うための費用対効果の高い方法を開発しました。トリプレットPCR技術を自動並列キャピラリー電気泳動と組み合わせて、実験的進化の過程で挿入対立遺伝子の相対頻度を定量化しました。
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