代谢活动可以定义为所有涉及能量的有机体活动的总和，对于理解地球上生命的功能和进化至关重要。在珊瑚礁上，新陈代谢的测量对于描述共生等模式非常重要，或者宿主与珊瑚宿主组织内的共生体共生体科之间的过程。它不仅可以告诉我们生物体如何正常运作，还可以告诉我们当气候压力源发挥作用时，生物体如何运作。
要开始设备和珊瑚设置，请使用蓝色塑料管和连接器连接两个水浴板。当呼吸测量室未就位时，确保通过透明水浴板可以看到电机板。接下来，在将该组件连接到电源并打开电源之前，使用磁齿轮将水浴底座连接到底座电机板。
要组装呼吸测量室，请将磁珠添加到玻璃室中，然后将不透明的塑料流通过支架底座放入玻璃室中。将腔室牢固地放入水浴中，确保玻璃腔室与实验的温控水接触。使用阀门控制旋钮，根据需要调节水流，施加设置为每小时 75 升的连续温和流量，以每分钟 30 转的速度缓慢搅拌。
继续将氧光纤电缆与氧传感器点连接，氧传感器点通过电缆检测和传输来自腔室的信号。确保将光纤连接到氧气模块中的匹配端口。将电缆插入盖室侧面钻的孔中，确保与斑点接触。
如果需要，请连接白色、薄、自密封的管道胶带，使电缆紧贴并使其牢固地保持在水室内。确保可以看到单个珊瑚，棕色触手朝上朝上。最后，使用氧气测量软件测量呼吸。
使用 R 包 respR 导入呼吸测量数据后，使用检查功能检查常见异常，如非数值或缺失值，绘制氧气时间序列，并计算滚动率。在3000的时间点之后，滚动速率趋于稳定。只有在全时序列的第 200 行之后才能检测到氧气下降。
自动下划线率函数用于识别数据的线性区域，用于提取速率。从3， 000到5， 000的线性区域被确定为最线性的区域。adjust_rate函数用于确定对照实验的背景率。
最后，使用各种参数将速率转换为所需的输出单位。表面积比速率，即绝对速率除以试样的表面积，作为输出获得。在测试的小样本尺寸下在黑暗中呼吸的结果表明，该方法在捕获低信号阈值方面的效率很高。
此外，还获得了空白的代表性呼吸值，以及非常小样品的对照与高温比较。尽管意义重大，但缺乏方法，因此缺乏与珊瑚礁有关的关键代谢率的数据，特别是因为它与珊瑚后代有关，珊瑚后代通常非常小，因此难以测量。这就是为什么我们开发了这种低成本、非常灵活的生理呼吸测量系统，旨在测量非常小的生物体的呼吸频率、IE代谢率，在这种情况下，是珊瑚幼体。
