Real-Time Quantitative PCR (qPCR) Test, Additional PCR Amplification, and Second DNA Purification
6:14
DNA Fragment Size Selection
8:01
Results: Assay for Transposase-Accessible Chromatin with High-Throughput Sequencing
10:19
Conclusion
Transcript
ATAC-seq è una tecnica potente per comprendere i meccanismi di regolazione dell'espressione genica. Tuttavia, il tessuto adiposo è difficile da usare questa tecnica a causa del suo grande contenuto lipidico, dell'elevata contaminazione mitocondria
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Presentiamo un protocollo per il dosaggio della cromatina accessibile alla trasposasi con sequenziamento ad alto rendimento (ATAC-seq) specificamente sugli adipociti utilizzando la selezione del nucleo con tessuti adiposi isolati da topi reporter transgenici con marcatura a fluorescenza nucleare.