Real-Time Quantitative PCR (qPCR) Test, Additional PCR Amplification, and Second DNA Purification
6:14
DNA Fragment Size Selection
8:01
Results: Assay for Transposase-Accessible Chromatin with High-Throughput Sequencing
10:19
Conclusion
Transcript
ATAC-seq는 유전자 발현 조절 메커니즘을 이해하는 강력한 기술입니다. 그러나 지방 조직은 지질 함량이 크고 미토콘드리아 오염이 높으며 세포 이질성이 높기 때문에 이 기술을 사용하기가 어렵습니다. 이 프로토콜에서는 미토콘드리아 DNA 오염을 최소화하면서 고품질 데이터를 생성하는 형광 활성화 핵 분류를 사용하여 지방 세포 특이적 ATAC 시퀀싱을 수행했습니다.
이 방법은 세포 유형별 Cre 마우스 라인이 핵 라벨링 형질전환 리
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우리는 핵 형광 표지가 있는 형질전환 리포터 마우스에서 분리된 지방 조직으로 핵 분류를 사용하는 지방 세포에 특히 고처리량 시퀀싱(ATAC-seq)을 사용하여 전치사 효소 접근 가능한 염색질 분석을 위한 프로토콜을 제시합니다.