Name: network pharmacology prediction and metabolomics validation of the mechanism of fructus phyllanthi against hyperlipidemia
Uploaded: 2023-04-07T14:10:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Network Pharmacology Prediction and Metabolomics Validation of the Mechanism of Fructus Phyllanthi against Hyperlipidemia at JoVE.com

Denne forskning blev støttet af produktudviklings- og innovationsteamet for TCM Health Preservation and Rehabilitation (2022C005) og Research on New Business Cross-border Integration of "Health Preservation and Rehabilitation+".

Alle procedurer, der involverer håndtering af dyr, blev udført i overensstemmelse med Chengdu University of Traditional Chinese Medicine Guide for the Care and Use of Laboratory Animals og blev godkendt af den institutionelle etiske komité ved Chengdu University of Traditional Chinese Medicine (protokolnummer 2020-36). C57BL/6-hanmus (20 ± 2 g) blev anvendt til nærværende undersøgelse. Musene blev hentet fra en kommerciel kilde (se materialetabel).
1. Netværksfar...

I de senere år har forekomsten af hyperlipidæmi været stigende, hovedsageligt på grund af langsigtede usunde spisevaner. TCM og dets kemiske ingredienser har forskellige farmakologiske aktiviteter, som er blevet bredt undersøgt i de senere år37,38. FP er en slags frugtressource, der anvendes både som medicin og mad, og har et vigtigt potentiale til behandling af hyperlipidæmi. Imidlertid kræver den potentielle terapeutiske mekanisme af FP mod hyperlipid?...

Hyperlipidæmi er en almindelig metabolisk sygdom med alvorlige konsekvenser for menneskers sundhed og er også den primære risikofaktor for hjerte-kar-sygdomme1. For nylig har der været en nedadgående aldersrelateret tendens til denne sygdom, og yngre mennesker er blevet mere modtagelige på grund af langvarig uregelmæssig livsstil og usunde spisevaner2. I klinikken er forskellige lægemidler blevet brugt til behandling af hyperlipidæmi. For eksempel er et af de mest almindeligt anvendte lægemidler til patienter med hyperlipidæmi og relaterede aterosklerotiske lidelser statiner. Imidlertid har langvarig brug af statiner bivirkninger, der ikke kan overses, hvilket fører til en dårlig prognose, såsom intolerance, behandlingsresistens og bivirkninger 3,4. Disse mangler er blevet yderligere smerter for hyperlipidæmi patienter. Derfor bør der foreslås nye behandlinger for stabil lipidsænkende effekt og færre bivirkninger.
Traditionel kinesisk medicin (TCM) har været meget udbredt til behandling af sygdomme på grund af sin gode effekt og få bivirkninger5. Fructus Phyllanthi (FP), den tørrede frugt af Phyllanthus emblica Linn. (populært kendt som amla bær eller indisk stikkelsbær), er en berømt medicin og mad homologt materiale af traditionelle kinesiske og indiske lægemidler 6,7. Denne medicin er blevet brugt til at rydde varme, afkøle blod og fremme fordøjelsen, som pr TCM teorier8. Moderne farmakologiske undersøgelser har vist, at FP er rig på bioaktive forbindelser såsom gallinsyrer, ellaginsyrer og quercetin9, som er ansvarlige for en række mangesidede biologiske egenskaber ved at fungere som en antioxidant, en antiinflammatorisk, leverbeskyttelse, en antihypolipidæmisk og så videre10. Nyere forskning har også vist, at FP effektivt kunne regulere blodlipiderne hos patienter med hyperlipidæmi. For eksempel har Variya et al.11 vist, at FP frugtsaft og dets vigtigste kemiske ingrediens i gallinsyre kan reducere plasmakolesterol og reducere olieinfiltration i leveren og aorta. Den terapeutiske effekt var relateret til FP's regulering ved at øge ekspressionen af peroxisomproliferatoraktiveret receptor-alfa og faldende hepatisk lipogen aktivitet. Men, den underliggende mekanisme af FP i forbedring af hyperlipidæmi bør undersøges yderligere, fordi dets bioaktive ingredienser er ret omfattende. Vi søgte at undersøge den potentielle mekanisme bag FP's terapeutiske effekt, som kan være gavnlig for den videre udvikling og anvendelse af dette lægemiddel.
I øjeblikket betragtes netværksfarmakologi som en holistisk og effektiv teknik til at studere den terapeutiske mekanisme for TCM. I stedet for at lede efter enkelte sygdomsfremkaldende gener og lægemidler, der udelukkende behandler et individuelt mål, konstrueres et komplet lægemiddel-ingredienser-gener-sygdomsnetværk for at finde multi-target-mekanismen for multiingredienslægemidlet med hensyn til deres omfattende behandling12. Denne teknik er især velegnet til TCM, da deres kemiske sammensætninger er massive. Desværre kan netværksfarmakologi kun bruges til at forudsige mål, der i teorien påvirkes af kemiske ingredienser. De endogene metabolitter i sygdomsmodellen bør observeres for at validere effektiviteten af netværksfarmakologi. Metabolomics-metoden, der opstår med udviklingen af systembiologi, er et vigtigt redskab til overvågning af ændringer i endogene metabolitter13. Ændringerne i metabolitter afspejler værtens steady state-ændringer, hvilket også er en vigtig indikator for at studere den interne mekanisme. Nogle forskere har med succes integreret netværksfarmakologi og metabolomics for at udforske interaktionsmekanismen mellem lægemidler og sygdomme14,15.
Denne artikel udforsker det mekanistiske grundlag for FP mod hyperlipidæmi ved at integrere netværksfarmakologi og metabolomics-teknikker. Netværksfarmakologi blev anvendt til at analysere forholdet mellem de vigtigste aktive ingredienser i FP og molekylære mål for hyperlipidæmi. Derefter blev metabolomics udført for at observere ændringen af endogene metabolitter i dyremodellen, hvilket kan forklare lægemidlets virkninger på metabolisk niveau. Sammenlignet med anvendelsen af netværksfarmakologi eller metabonomics alene gav denne integrerede analyse en mere specifik og omfattende forskningsmekanisme. Derudover blev den molekylære dockingstrategi brugt til at analysere interaktionen mellem aktive ingredienser og nøgleproteiner. Generelt kan denne integrerede tilgang kompensere for manglen på eksperimentel dokumentation for netværksfarmakologi og manglen på en endogen mekanisme for metabolomics-metoden og kan bruges til terapeutisk mekanismeanalyse af naturmedicin. Protokollens vigtigste skematiske rutediagram er vist i figur 1.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>101-3B Oven</td>
			<td>Luyue Instrument and Equipment Factory</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>80312/80302 Glass Slide</td>
			<td>Jiangsu Sitai Experimental Equipment Co., LTD</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>80340-1630 Cover Slip</td>
			<td>Jiangsu Sitai Experimental Equipment Co., LTD</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AccucoreTM C18 (3 mm &#215; 100 mm, 2. 6 &#956;m)</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>A998</td>
			<td>Version 1.5.6</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ACQUITY UPLC HSS T3 Column (2.1 mm &#215; 100 mm, 1.8 &#956;m)</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aethanol</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>A995</td>
			<td>Version 3.0</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonia Solution</td>
			<td>Chengdu Cologne Chemicals Co., LTD</td>
			<td>1336-21-6</td>
			<td>Version 3.9.1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AutoDockTools</td>
			<td>Scripps Institution of Oceanography</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BS-240VT Full-automatic Animal Biochemical Detection System</td>
			<td>Shenzhen Mindray Bio-Medical Electronics Co., Ltd.</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Compound Discoverer</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cytoscape</td>
			<td>Cytoscape Consortium</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DM500 Optical Microscope</td>
			<td>Leica</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DV215CD Electronic Balance</td>
			<td>Ohaus Corporation ., Ltd</td>
			<td>T15A63</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethyl Alcohol</td>
			<td>Chengdu Cologne Chemicals Co., LTD</td>
			<td>64-17-5</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formic Acid</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>A118</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HDL-C Assay Kit</td>
			<td>Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute</td>
			<td>A112-1-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hematoxylin Staining Solution</td>
			<td>Biosharp</td>
			<td>BL700B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>High Fat Diet</td>
			<td>ENSIWEIER</td>
			<td>202211091031</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hitachi CT15E/CT15RE Centrifuge</td>
			<td>Hitachi., Ltd.</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Homogenizer</td>
			<td>Oulaibo Technology Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrochloric Acid</td>
			<td>Chengdu Cologne Chemicals Co., LTD</td>
			<td>7647-01-0</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Image-forming System</td>
			<td>LIOO</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>JB-L5 Freezer</td>
			<td>Wuhan Junjie Electronics Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>JB-L5 Tissue Embedder</td>
			<td>Wuhan Junjie Electronics Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>JK-5/6 Microtome</td>
			<td>Wuhan Junjie Electronics Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>JT-12S Hydroextractor</td>
			<td>Wuhan Junjie Electronics Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KQ3200E Ultrasonic Cleaner</td>
			<td>Kun Shan Ultrasonic Instruments Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LDL-C Assay Kit</td>
			<td>Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute</td>
			<td>A113-1-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Male C57BL/6 Mice</td>
			<td>&#160;SBF Biotechnology Co., Ltd.</td>
			<td>\</td>
			<td>Version 2.3.2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Neutral Balsam</td>
			<td>Shanghai Yiyang Instrument Co., Ltd</td>
			<td>10021190865934</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pure Water</td>
			<td>Guangzhou Watson&#39;s Food &#38; Beverage Co., Ltd</td>
			<td>GB19298</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PyMOL</td>
			<td>DeLano Scientific LLC</td>
			<td>\</td>
			<td>Version 14.1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RE-3000 Rotary Evaporator</td>
			<td>Yarong Biochemical Instrument Factory ., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RM2016 Pathological Microtome</td>
			<td>Shanghai Leica Instruments Co., Ltd</td>
			<td>\</td>
			<td>Version 26.0</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SIMCA-P</td>
			<td>Umetrics AB</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Simvastatin</td>
			<td>Merck Sharp &#38; Dohme., Ltd</td>
			<td>14202220051</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SPSS</td>
			<td>International Business Machines Corporation</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TC Assay Kit</td>
			<td>Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute</td>
			<td>A111-1-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TG Assay Kit</td>
			<td>Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute</td>
			<td>A110-1-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UPLC-Q-Exactive Quadrupole Electrostatic Field Orbital Hydrazine High Resolution Mass Spectrometry</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>\</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex Vibrator</td>
			<td>Beijing PowerStar Technology Co., Ltd.</td>
			<td>LC-Vortex-P1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Xylene</td>
			<td>Chengdu Cologne Chemicals Co., LTD</td>
			<td>1330-20-7</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

network pharmacology prediction and metabolomics validation of the mechanism of fructus phyllanthi against hyperlipidemia

Hyperlipidæmi er blevet en førende risikofaktor for hjerte-kar-sygdomme og leverskader på verdensplan. Fructus Phyllanthi (FP) er et effektivt lægemiddel mod hyperlipidæmi i traditionel kinesisk medicin (TCM) og indisk medicin teorier, men den potentielle mekanisme kræver yderligere udforskning. Denne forskning sigter mod at afsløre mekanismen for FP mod hyperlipidæmi baseret på en integreret strategi, der kombinerer netværksfarmakologisk forudsigelse med metabolomics-validering. En fedtfattig diæt (HFD)-induceret musemodel blev etableret ved at evaluere plasmalipidniveauerne, herunder total cholesterol (TC), triglycerid (TG), lipoproteinkolesterol med lav densitet (LDL-C) og lipoproteinkolesterol med høj densitet (HDL-C). Netværksfarmakologi blev anvendt til at finde ud af de aktive ingredienser i FP og potentielle mål mod hyperlipidæmi. Metabolomics af plasma og lever blev udført for at identificere differentielle metabolitter og deres tilsvarende veje blandt normalgruppen, modelgruppen og interventionsgruppen. Forholdet mellem netværksfarmakologi og metabolomics blev yderligere konstrueret for at opnå et omfattende overblik over FP-processen mod hyperlipidæmi. De opnåede nøglemålproteiner blev verificeret ved molekylær docking. Disse resultater afspejlede, at FP forbedrede plasmalipidniveauerne og leverskaden af hyperlipidæmi induceret af en HFD. Gallinsyre, quercetin og beta-sitosterol i FP blev demonstreret som de vigtigste aktive forbindelser. I alt 16 og seks potentielle differentielle metabolitter i henholdsvis plasma og lever viste sig at være involveret i de terapeutiske virkninger af FP mod hyperlipidæmi ved metabolomics. Yderligere, integrationsanalyse viste, at interventionseffekterne var forbundet med CYP1A1, AChE, og MGAM, samt justering af L-kynurenine, corticosteron, acetylcholin, og raffinose, hovedsageligt involverer tryptophan metabolisme vej. Molekylær docking sikrede, at ovennævnte ingredienser, der virker på hyperlipidæmi-relaterede proteinmål, spillede en nøglerolle i sænkning af lipider. Sammenfattende gav denne forskning en ny mulighed for forebyggelse og behandling af hyperlipidæmi.

Netværksfarmakologi I alt 18 potentielle ingredienser i FP blev screenet i henhold til deres farmakokinetiske og farmakodynamiske egenskaber fra databasen og LC-MS-analysen (de samlede ionkromatogrammer er vist i supplerende figur 1). Gennem relevant litteratur er indholdet af gallinsyre meget højere end andre ingredienser og er effektivt til at sænke lipider 9,11. Derfor blev denne ingrediens også betragtet som en potenti...

Watch this Scientific Journal Video about Network Pharmacology Prediction and Metabolomics Validation of the Mechanism of Fructus Phyllanthi against Hyperlipidemia at JoVE.com

Network Pharmacology Prediction and Metabolomics Validation of the Mechanism of Fructus Phyllanthi against Hyperlipidemia

Denne protokol beskriver en integreret strategi for udforskning af de vigtigste mål og mekanismer for Fructus Phyllanthi mod hyperlipidæmi baseret på forudsigelse af netværksfarmakologi og metabolomics verifikation.

Netværksfarmakologi, forudsigelse og metabolomics: Validering af mekanismen for Fructus phyllanthi mod hyperlipidæmi

Hyperlipidemia has become a leading risk factor for cardiovascular diseases and liver injury worldwide. Fructus Phyllanthi (FP) is an effective drug ...

Vores forskning omfatter seriel eksperimentel teknik, og protokollen har disse detaljer, som er nødvendige for, at læserne kan forstå vores metoder. Vores integrerede metode kompenserer for ulempen ved netværksfarmakologi og metabolomics og kan bruges til terapeutisk metaanalyse af naturmedicin. Denne metode bruges til at screene den aktive forbindelse fra virksomhedens ingrediens og dragt til joggere med massiv kemisk sammensætning, såsom en traditionel kinesisk medicin.For at begynde skal du vælge de aktive ingredienser og nøglemål ved at søge på nøgleordet phyllanthi fructus på den traditionelle kinesiske medicinsystems farmakologiske database. For at få listen over kandidat aktive ingredienser og mål for fructus phyllanthi, eller FP, søge søgeordet hyperlipidæmi i genkort database, online Mendelian arv i mennesket database, og terapeutiske mål database for at opnå de respektive kandidatmål for hyperlipidæmi. Download regnearkene med sygdomsmål og gem dem i en mappe, og slet de gentagne mål for at få listen over hyperlipidæmimål.Kopier derefter listerne over FP-aktive ingredienser, FP-mål og hyperlipidæmi-mål til et nyt regneark. Brug funktionen Data Identificer dubletter i værktøjslinjen til at få krydsningsmål. Importer skæringsmållisten til UniProt-vidensbasen for at standardisere gen- og proteinnavnene.For at konstruere et proteinproteininteraktionsnetværk skal du indsætte skæringsmållisten for FP mod hyperlipidæmi i dialogboksen Liste over navne i strengdatabase 11.5. Vælg homo sapiens i organismer. Klik på søg, og klik derefter på Fortsæt.Når resultaterne er tilgængelige, skal du aktivere de højt frakoblede noder i netværket i avancerede indstillinger. Angiv den højeste tillid til 0,900 i den mindst påkrævede interaktionsscore. Klik derefter på opdateringsknappen.Klik på eksporter i titellinjen, og download den korte tabeltekst fra proteinproteininteraktionsnetværket i PNG- og TSV-format. For at konstruere et lægemiddelkomponentsygdomsmålnetværk skal du åbne Cytoscape 3.9.1 og importere TSV-formatfilen. Optimer farven, skrifttypen og siden af netværksnoderne gennem stillinjen i kontrolpanelet.Brug analysenetværksfunktionen til netværkstopologianalyse, få hubgener i CytoHubba i Cytoscape, og etabler lægemiddelingrediensmålsygdomsnetværket. For at udføre GO- og KEGG-berigelsesanalyse skal du åbne Davids bioinformatikressourcer. Klik på start analyse og indsæt mållisten i venstre dialogboks.Vælg officielt gensymbol i select identifier og homo sapiens i udvalgte arter. Aktivér derefter genlisten i listetype, og klik på send-listen. Klik derefter på funktionel annotationsklynge under analyser ovenstående genliste med et af Davids værktøjer.Aktivér GO-term BP direct, GO-term CC direct, GO-term MF direct og genontologi til GO-funktionsberigelsesanalyse. Aktivér KEGG-vej i veje til analyse af KEGG-vejberigelse. Klik på det funktionelle annotationsdiagram for at få vist resultaterne.Brug SIMCA P-software til multivariat statistisk analyse af integralværdierne opnået fra LCMS-fund. Brug ortogonal partiel mindste kvadraters diskriminantanalyse eller OPLSDA til middelcenterdata og modellering af prøveklasser. Efter OPLSDA-testen skal du overveje metabolitterne med integreret variabel betydning i projektionen eller VIP-værdier på mere end en og en P-værdi på mindre end 0,05 fra den studerendes T-test som de potentielle differentielle metabolitter.Identificer de forstyrrede metabolitter og metaboliske veje ved åbne databasekilder, herunder humant metabolom, Kyoto encyklopædi af gener og genomer og MetaboAnalyst 5.0. Visualiser resultatvisningerne fra MetaboAnalyst 5.0 og Wukong-platformen. Download den udvalgte FP ingredienser 3D struktur fra den traditionelle kinesiske medicin systemer farmakologi database.Søg i ingrediensnavnene i søgefeltet for kemiske navne, og download de tilsvarende 3D-strukturfiler i MOL two-format. Download derefter krystalstrukturerne af nøglemålene fra alfa-foldproteinstrukturdatabasen. Søg i målnavnene i søgefeltet, og download de tilsvarende krystalstrukturfiler i PDB-format.Importer derefter ingredienser og målstrukturfiler til AutoDock-værktøjssoftware. Klik på rediger og slet vand for at slette vandmolekyler. Klik derefter på rediger hydrogener, og tilføj for at tilføje hydrogener.Indstil ingredienserne som ligand og udfør blinddocking ved at vælge hele målene som receptor. Indtast en værdi i boksen bag center og størrelse for at justere det nyudviklede rum, hvilket gør det muligt at omfatte liganden og receptoren fuldt ud. Gem ligand- og receptorfilerne i PDBQT-format.Brug AutoDock Vina til at udføre molekylær docking. Indstil receptorlinjen til navnet på receptorprikken PDBQT og ligandbjælken til navnet på ligandprikken PDBQT. Få den optimale placering for ligandbinding til receptoren, og registrer bindingsenergiværdien i den optimale position.Importer dockingfilerne til proteinligandinteraktionsprofilen for at få den visuelle systemmodel. Download modelfilerne i PSC-format, og importer dem til PyMOL-software for at konstruere yderligere visualisering. Gennem netværksfarmakologi blev der fundet i alt 19 ingredienser og 134 ingrediensrelaterede mål for FP.Efter at have matchet FP-relaterede mål med hyperlipidæmi-relaterede mål, blev 62 identificeret som potentielle mål for FP mod hyperlipidæmi. Proteinproteininteraktionsnetværket blev konstrueret af String og Cytoscape. GO-berigelsesresultaterne antydede, at FPs biologiske processer og molekylære funktion mod hyperlipidæmi hovedsageligt var relateret til genekspression og proteinbinding.KEGG-berigelsen viste, at FP kunne gribe ind i lipidmetabolisme og aterosklerose. OPLSDA-analyse blev brugt til at undersøge metabolitadskillelsen mellem grupperne med negativ kontrol, fedtrig kost og høje doser FP-mus, hvilket viste, at de samme gruppeprøver klyngede sig sammen, og forskellige gruppeprøver skelnede godt. I alt 16 og seks metabolitter blev identificeret som differentielle metabolitter i FP, der påvirker HFD-mus i plasma og lever.Varmekort plottet af MetaboAnalyst 5.0 viste, at alle differentielle metabolitter i plasma og lever blev ændret i diætgruppen med højt fedtindhold, og de fleste blev vendt i FP-gruppen. Tryptophan metabolisme blev påvirket signifikant i plasma. Taurin og hypotaurin metabolisme blev påvirket signifikant i leveren.Differentielle metabolitter blev importeret til MetScape-pluginet i Cytoscape og matchede hub-generne identificeret i netværksfarmakologi for at indsamle de sammensatte reaktionsenzymgennetværk. Yderligere, ingredienserne mål metabolitter veje netværk er blevet konstrueret. Molekylær docking blev brugt til at analysere deres ligand aktive site interaktioner.Denne teknologi er en omfattende metode til at starte de farmakologiske genetiske ingredienser i traditionel kinesisk medicin. Det giver en ny idé til forskning, der involverer lægemidler med komplette ingredienser.

Research

JoVE Journal

Medicine

An Experimental Paradigm for the Prediction of Post-Operative Pain (PPOP)

An Experimental Paradigm for the Prediction of Post-Operative Pain PPOP

Many women undergo cesarean delivery without problems, however some experience significant pain after cesarean section. Pain is associated with negative ...

The Application Of Permanent Middle Cerebral Artery Ligation in the Mouse

Focal cerebral ischemia is among the most common type of stroke seen in patients. Due to the clinical significance there has been a prolonged effort to ...

Generation of Subcutaneous and Intrahepatic Human Hepatocellular Carcinoma Xenografts in Immunodeficient Mice

Generering af Subkutan og Intrahepatisk Menneskelige hepatocellulært carcinom xenotransplantater i immunsvækkede mus

In  vivo experimental models of hepatocellular carcinoma (HCC) that recapitulate  the human disease provide a valuable platform for research into disease  ...

Pharmacologic Induction of Epidermal Melanin and Protection Against Sunburn in a Humanized Mouse Model

Farmakologisk Induktion af epidermal Melanin og beskyttelse mod solskoldning i et humaniseret musemodel

Fairness of skin, UV sensitivity and skin cancer  risk all correlate with the physiologic function of the melanocortin 1  receptor, a Gs-coupled signaling ...

Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy

Netværk Analyse af standardtilstanden netværk ved hjælp af Funktionel Connectivity MRI ved FLE

Functional connectivity MRI (fcMRI) is an fMRI method that examines the connectivity of different brain areas based on the correlation of BOLD signal ...

In Vivo and Ex Vivo Approaches to Study Ovarian Cancer Metastatic Colonization of Milky Spot Structures in Peritoneal Adipose

In Vivo and Ex Vivo Approaches to Study Ovarian Cancer Metastatic Colonization of Milky Spot Structures in Peritoneal Adipose

In vivo og ex vivo Approaches at studere kræft i æggestokkene Metastatisk Kolonisering af Milky Spot Strukturer i peritoneal Adipose

High-grade serous ovarian cancer (HGSC), the cause of widespread peritoneal metastases, continues to have an extremely poor prognosis; fewer than 30% of ...

Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients

Netværk Analyse af foramen ovale elektrode Optagelser i Drug-resistent TLE Patienter

Approximately 30% of epilepsy patients are refractory to antiepileptic drugs. In these cases, surgery is the only alternative to eliminate/control ...

Harvest of Endothelial Cells from the Balloon Tips of Swan-Ganz Catheters after Right Heart Catheterization

Høst i Endothelial Cells fra ballon Tips af Swan-Ganz katetre efter højre hjerte kateterisation

A variety of pathologies lead to pulmonary hypertension (PH), which is defined as a mean pulmonary artery pressure exceeding 25 mmHg at rest. To further ...

On-Site Sampling and Extraction of Brain Tumors for Metabolomics and Lipidomics Analysis

Prøveudtagning og udvinding af hjernetumorer til metabolomics og lipidomics-analyse på stedet

Despite the variety of tools available for cancer diagnosis and classification, methods that enable fast and simple characterization of tumors are still ...

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Normothermic Ex Vivo Pancreas Perfusion for the Preservation of Pancreas Allografts before Transplantation

Normothermic ex vivo pancreas perfusion til bevarelse af bugspytkirtlen allotransplantater før transplantation

Pancreas transplantation (PTx) is a curative treatment for people who live with the burden of a diagnosis of diabetes mellitus (DM). However, due to organ ...