In ons lab bestuderen we menselijke colorectale kanker. De progressie naar gemetastaseerde ziekte en de reactie op de behandeling, inclusief immunotherapie. We proberen nieuwe voorspellende en prognostische biomarkers te vinden door de tumorimmuunmicro-omgeving en het intratumorale microbioom bij primaire en gemetastaseerde ziekten te onderzoeken.
In ons project implementeren we momenteel verschillende technologieën zoals RNA-sequencing, whole exome sequencing, TCR sequencing circulerende celvrije DNA-analyse, immunofluorescentie en fluorescentie-instituut hybridisatie. Op dit moment is onze grootste uitdaging om fluorescentie-instituut hybridisatiekleuring te combineren met tyramide signaalversterking multiplex immunofluorescentie om de interactie tussen het microbioom en de immuuncellen te bestuderen. Onze methode is robuust, reproduceerbaar, gebruiksvriendelijk en kosteneffectief.
Het kan worden opgezet in elk laboratorium met een fluorescentielichtscanner en de methode kan worden gebruikt met elk commercieel verkrijgbaar IHC-antilichaam in tegenstelling tot commercieel verkrijgbare kits die meestal zijn geoptimaliseerd voor een beperkt paneel van antigenen.