De Cytometry and Biomarkers Technology Unit ondersteunt biomedische projecten door middel van state-of-the-art technologieën en pijplijnen voor celfenotypering en moleculaire profilering met single-cell resolutie. In deze context gebruiken we verschillende tools voor single-cell multiomic analyse om inzicht te krijgen in genexpressie en genregulatie in gezondheid en ziekte. Flowcytometrie identificeert en sourcet individuele cellen op basis van unieke kenmerken.
Recente ontwikkelingen zijn onder meer spectrale sorteerders met een hoge doorvoer op basis van afbeeldingen, en die technologie biedt flexibiliteit bij het ontwerpen van panelen, maakt gelijktijdig gebruik van vergelijkbare kleurstoffen mogelijk en het beheer van autofluorescentie. Een grote experimentele uitdaging bij het gebruik van geavanceerde, eencellige technologieën is het werken met bijzonder fragiele of zeldzame celpopulaties. Elk weefsel- of celtype moet een nauwkeurig afgestemde protocoloptimalisatie ondergaan om voldoende zeer levensvatbare cellen te verkrijgen die zich vertalen in sequentiegegevens van hoge kwaliteit.
Ons aangepaste protocol voor de bereiding van enkele kernen verbetert het herstel van de kernen en minimaliseert de spanning op de kernen. Het is specifiek geoptimaliseerd voor hersen- en beenmergweefsels en omvat alle stappen van monsterdissociatie tot zuivering van kernen.