På Simons Electron Microscopy Center sigter vi mod at levere fremragende elektronmikroskopitjenester, ekspertise og uddannelse til lokale og nationale forskere og udvikle innovative metoder til optimering af arbejdsgange. Vores arbejdsområde dækker service, udvikling, maskinlæring og biomedicinsk forskning. Vi forsøger at svare, hvordan kan vi bedre optimere vores tjenester?
Maskinindlæring ændrer elektronmikroskopiområdet. Dataindsamling bliver automatiseret. Dataanalyseværktøjer bliver hurtigt mere effektive.
Dette inkluderer denoising billeder, partikelplukning, 3G-fleksibilitetsanalyse og modelbygning. Vi opdaterer regelmæssigt software for at tage højde for forskellige situationer, såsom forskellige gitterhuller, vippet samling eller fejl, der er identificeret gennem betatestsoftware i vores produktionsmiljø. Vi integrerer også feedback fra vores brugere, så vi løbende leverer funktioner, der er nyttige for dem.
Smart Leginon løser de arbejdskrævende og tidskrævende opgaver med at screene et eller flere gitre på en kryoTEM. Det gør det muligt for operatører og forskere hurtigere at screene og analysere gitre, samtidig med at der frigøres tid til at optimere gitter- og prøveforholdene parallelt. Dette reducerer også mikroskopets tid og omkostninger.
Smart Leginon autoscreen tilbyder fuldt uovervåget multigrid screening, som tager cirka 10 minutter at oprette screening for 12 gitre. Sammenlignet med manuel screening sparer vores protokol flere timer om dagen. Siden Smart Leginons introduktion er anden gratis og kommerciel software blevet udviklet til lignende automatisering.
