著者スポットライト:自動データ収集および分析技術によるクライオ電子顕微鏡の強化

サイモンズ電子顕微鏡センターでは、優れた電子顕微鏡サービス、専門知識、トレーニングを国内外の研究者に提供し、ワークフローを最適化する革新的な方法を開発することを目指しています。当社の範囲は、サービス、開発、機械学習、生物医学研究をカバーしています。私たちは、どうすればサービスをよりよく最適化できるのか、その答えを出そうとしています。

機械学習は電子顕微鏡の分野を変えています。データ収集は自動化されつつあります。データ分析ツールは急速に効率化しています。

これには、画像のノイズ除去、粒子ピッキング、3G柔軟性分析、モデル構築が含まれます。私たちは、さまざまなグリッドホール、傾いたコレクション、本番環境でのベータテストソフトウェアで特定されたバグなど、さまざまな状況を考慮してソフトウェアを定期的に更新しています。また、ユーザーからのフィードバックも統合し、ユーザーに役立つ機能を継続的に提供しています。

Smart Leginon は、クライオ TEM 上の 1 つまたは複数のグリッドをスクリーニングするという、労働集約的で時間のかかるタスクに対処します。これにより、オペレーターや研究者はグリッドをより迅速にスクリーニングおよび分析できるようになり、グリッドとサンプルの状態を並行して最適化する時間を確保できます。これにより、顕微鏡の時間とコストも削減されます。

Smart Leginon オートスクリーンは、12 グリッドのスクリーニングを設定するのに約 10 分かかる、完全に無人のマルチグリッドスクリーニングを提供します。手作業によるスクリーニングと比較して、当社のプロトコルは1日あたり数時間の節約になります。Smart Leginonの導入以来、同様の自動化のために他のフリーソフトウェアや商用ソフトウェアが開発されてきました。