På Simons Electron Microscopy Center tar vi sikte på å tilby ypperlige elektronmikroskopitjenester, kompetanse og opplæring til lokale og nasjonale forskere, og å utvikle innovative metoder for å optimalisere arbeidsflyten. Vårt omfang dekker service, utvikling, maskinlæring og biomedisinsk forskning. Vi prøver å svare, hvordan kan vi bedre optimalisere tjenestene våre?
Maskinlæring endrer feltet elektronmikroskopi. Datainnsamlingen blir automatisert. Dataanalyseverktøy blir raskt mer effektive.
Dette inkluderer støyfjerningsbilder, partikkelplukking, 3G-fleksibilitetsanalyse og modellbygging. Vi oppdaterer programvaren regelmessig for å ta hensyn til ulike situasjoner, for eksempel forskjellige hull i rutenettet, skråstilt samling eller feil identifisert gjennom betatestingsprogramvare i produksjonsmiljøet vårt. Vi integrerer også tilbakemeldinger fra brukerne våre, så vi tilbyr kontinuerlig funksjoner som er nyttige for dem.
Smart Leginon tar for seg de arbeidskrevende og tidkrevende oppgavene med å screene ett eller flere rutenett på et cryoTEM. Det gjør det mulig for operatører og forskere å screene og analysere rutenett raskere, samtidig som det frigjør tid til å optimalisere rutenett og prøveforhold parallelt. Dette reduserer også mikroskopets tid og kostnader.
Smart Leginon autoscreen tilbyr fullstendig uovervåket multigrid-screening, som tar omtrent 10 minutter å sette opp screening for 12 rutenett. Sammenlignet med manuell screening, sparer protokollen vår flere timer per dag. Siden Smart Leginon ble introdusert, har annen gratis og kommersiell programvare blitt utviklet for lignende automatisering.
