På Simons Electron Microscopy Center strävar vi efter att tillhandahålla fantastiska elektronmikroskopitjänster, expertis och utbildning till lokala och nationella forskare och att utveckla innovativa metoder för att optimera arbetsflöden. Vårt ansvarsområde omfattar service, utveckling, maskininlärning och biomedicinsk forskning. Vi försöker svara på hur vi bättre kan optimera våra tjänster?
Maskininlärning förändrar området elektronmikroskopi. Datainsamlingen håller på att automatiseras. Verktyg för dataanalys blir snabbt effektivare.
Detta inkluderar denoising images, partikelplockning, 3G-flexibilitetsanalys och modellbyggande. Vi uppdaterar regelbundet programvara för att ta hänsyn till olika situationer, t.ex. olika rutnätshål, lutande samling eller buggar som identifieras genom betatestningsprogramvara i vår produktionsmiljö. Vi integrerar också feedback från våra användare, så vi tillhandahåller kontinuerligt funktioner som är användbara för dem.
Smart Leginon tar itu med de arbetsintensiva och tidskrävande uppgifterna att screena ett eller flera rutnät på en cryoTEM. Det gör det möjligt för operatörer och forskare att snabbare screena och analysera nät, samtidigt som tid frigörs för att optimera nät- och provförhållanden parallellt. Detta minskar också mikroskopets tid och kostnad.
Smart Leginon autoscreen erbjuder helt obevakad multigrid-screening, vilket tar cirka 10 minuter att ställa in screening för 12 grids. Jämfört med manuell screening sparar vårt protokoll flera timmar per dag. Sedan Smart Leginons introduktion har annan gratis och kommersiell programvara utvecklats för liknande automatisering.
