L’analyse protéomique du virus d’enveloppe a révélé que les protéines de l’hôte sont incorporées dans le virus nouvellement formé, affectant la réplication, l’infectivité et la pathogenèse. Nos recherches portent sur le profilage des protéines de surface dans les particules virales afin de trouver des éléments clés dans l’interaction virus-hôte, ce qui mènera à de nouvelles cibles pour les antiviraux et les vaccins. L’immunomicroscopie électronique est la seule technique d’imagerie permettant la visualisation directe des protéines suppressives de virus.
Cependant, la spectrométrie de masse, l’immunocapture avec des billes magnétiques et la biométrie en flux émergent sont maintenant plus couramment utilisées pour permettre un profilage plus large du protéome et pour cribler un grand nombre de particules virales. Notre méthode utilise des billes Luminex codées par couleur et une double lecture laser pour l’immunocapture. Il permet le profilage multiplex des protéines de surface de l’hôte sur des virions intacts et le criblage d’anticorps et de médicaments antiviraux sur plusieurs virus et antigènes simultanément.
La spectrométrie de masse et la protéomique d’affinité sont des outils puissants pour identifier les protéines virales et hôtes à la surface du virion. La stratégie que nous décrivons permettra de mieux comprendre le rôle des protéines de l’hôte sur les particules virales, ce qui permettra d’établir un profil à haut débit des échantillons infectés dans divers montages expérimentaux.