De inflammatoriska cytokinerna interferon-gamma och TNF - har funnits i hundratals miljoner år och är avgörande för ett effektivt värdförsvar mot intercellulära patogener. Vår forskargrupp försöker förstå hur dessa cytokiner fungerar för att döda celler, till exempel epitelceller i tarmen och cancerceller. Vanligt använda system för att studera mekanismer för celldöd i tarmepitel inkluderar musmodeller och odödliga cancercellinjer.
Mänskliga testorganoider är fördelaktiga eftersom de genereras direkt från patientbiopsier och behåller många fysiologiska och morfologiska egenskaper hos modervävnaden. Detta innebär att de har ett ökat translationellt värde. Organforskning har problem med experiments reproducerbarhet och har flera tekniska utmaningar jämfört med traditionell cellodling.
Dagens tekniker för att mäta organoid celldöd har också begränsningar. Vissa är endast semikvantitativa, mäter inte celldöd direkt, kan inte mäta enskilda organoidsvar eller kräver dyr utrustning och komplexa protokoll. Vårt protokoll för kvantitativ analys av organoid celldöd är enkelt, robust och billigt.
Vi använde vårt protokoll för att mäta enskilda organoidsvar på cytotoxiska cytokinkombinationer, men det kan enkelt anpassas för att studera alla typer av störningar. Denna metod är användbar för forskning om celldöd, epitelial barriärfunktion eller slemhinneimmunologi. Nyligen har vi rapporterat att interferon-gamma och TNF samverkar för att inducera inflammatorisk celldöd i tarmepitelceller och tjocktarmscancerceller.
De gör detta via JAK1/2-STAT1-signalvägen. I framtida arbete vill vi förstå vilken typ av celldöd det rör sig om och hur JAK1 och JAK2 dödar cellerna.
