Vårt mål är att hitta bättre terapeutiska metoder för att behandla en human skelettcancer som kallas osteosarkom. För att kunna göra det vill vi avslöja de biologiska processer som är ansvariga för uppkomsten av denna tumör och framför allt för utvecklingen av dess metastaser, vilket tar bort orsaken till patientens död. Genom att använda spatial transkriptomikanalys på flera matchande prover av human primär osteosarkomlinjemetastas, lokaliserade vi i flera patientgemensamma cellpopulationer som finns inom tumörområdena, och genom att jämföra dem identifierade vi flera nyckelgener som kan representera värdefulla terapeutiska mål för att förhindra lungmetastaser.
Speciell transkriptomikanalys av hjärtvävnad, såsom ben, har varit mycket utmanande på grund av oförmågan att bevara RNA och vävnadsmorfologi av god kvalitet, samtidigt som hjärtvävnaden bearbetas för snittning. Vårt protokoll adresserar denna lucka, vilket gör det möjligt för forskare att framgångsrikt tillämpa speciell transkriptomikanalys även på hjärtvävnader.