للبدء ، افتح متصفح الويب وانتقل إلى الرابط للوصول إلى وظيفة تحليل المسار المشترك على موقع MetaboAnalyst. قم بالوصول إلى المجلد حيث يتم حفظ ملفات الإخراج من تنفيذ DeepOmicsAE ، وافتح الملفات النصية المسماة module_n. txt لكل وحدة إشارة تم إنشاؤها.
من الملفات النصية ، حدد موقع قائمة البروتينات وانسخها. في صفحة ويب MetaboAnalyst ، الصق قائمة البروتينات المنسوخة في بروتينات الجين مع نافذة تغييرات الطي الاختيارية. كرر ذلك مع المستقلبات ، والصقها في القائمة المركبة مع نافذة تغييرات الطي الاختيارية على نفس صفحة الويب.
اختر الكائن الحي ذي الصلة ونوع الهوية. بعد ذلك، أرسل المعلومات بالنقر على إرسال في أسفل الصفحة. في الصفحة التالية، تحقق من تعيين المعرف للتأكد من التعرف على المعرفات بشكل صحيح، ثم انقر فوق متابعة.
في صفحة إعداد المعلمة، حدد مسارات التمثيل الغذائي المتكاملة أو كل المسارات المتكاملة لتصور مساهمة المدخلات في التمثيل الغذائي أو جميع مسارات الإشارات. في لوحة اختيار الخوارزمية، اختر تحليل الإثراء، اختبار الهندسة الفائقة؛ قياس الطوبولوجيا ، مركزية الدرجة ؛ وطريقة التكامل ، الجمع بين قيم p على مستوى المسار. انقر فوق إرسال في أسفل الصفحة.
ستعرض الصفحة الأخيرة ، عرض النتائج ، نتائج تحليل الإثراء. يتضمن ذلك قطع من المسارات المخصبة بناء على تأثيرها وأهميتها وقائمة مجدولة من المسارات. كشف تفسير MetaboAnalyst لوحدات الإشارات التي تم الحصول عليها على DeepOmicsAE على مجموعة بيانات من عينات الدماغ للمرضى الأصحاء أو مرضى الزهايمر أنه لكل وحدة إشارات ، تم إثراء مسارات التمثيل الغذائي والإشارات المتميزة.
علاوة على ذلك ، أظهر توصيف التفاعلات التي تحدث بين السمات السريرية ووحدات الإشارات أن التمثيل الغذائي المتغير للجليسيروليبيد في مرضى الزهايمر كان مرتبطا بجنسهم وعمرهم عند الوفاة. على العكس من ذلك ، تميل التغييرات في نقاط الاشتباك العصبي ووظائف المحور العصبي إلى الحدوث عبر مرضى الزهايمر ، بغض النظر عن جنسهم ومستوى تعليمهم وطول العمر.
