تحليل الصور في برنامج Gen5 لتحليل الاستجابة الدوائية في الكائنات العضوية المشتقة من المريض باستخدام تصوير الخلايا الحية المتعددة

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

86 Views

•

02:40 min

•

January 5th, 2024

DOI :

10.3791/201046-v

January 5th, 2024

•

Kaitriana E. Colling*¹^,², Emily L. Symons*¹, Lorenzo Buroni*³, Hiruni K. Sumanasiri¹, Jessica Andrew-Udoh¹, Emily Witt¹^,⁴, Haley A. Losh¹, Abigail M. Morrison¹, Kimberly K. Leslie⁵, Christopher J. Dunnill⁶, Johann S. de Bono³, Kristina W. Thiel¹^,⁷

¹Department of Obstetrics and Gynecology, Carver College of Medicine, University of Iowa, ²Cancer Biology Graduate Program, Carver College of Medicine, University of Iowa, ³The Institute of Cancer Research: and the Royal Marsden NHS Foundation Trust, ⁴Department of Radiation Oncology, Carver College of Medicine, University of Iowa, ⁵Division of Molecular Medicine, Departments of Internal Medicine and Obstetrics and Gynecology, University of New Mexico Comprehensive Cancer Center, University of New Mexico Health Sciences Center, ⁶Agilent Technologies, ⁷Holden Comprehensive Cancer Center, University of Iowa

* These authors contributed equally

Transcript

للبدء ، قم بتصوير PDOs ذات العلامات الفلورية باستخدام نظام تصوير الخلايا الحية Cytation 5. ثم قم بتشغيل برنامج Gen5. انتقل إلى التجارب وانقر على فتح في إدارة المهام.

افتح التجربة المطلوبة وحدد Plate ، متبوعا ب View في شريط الأدوات. بعد ذلك ، قم بتبديل القائمة المنسدلة للبيانات إلى Z Projection. انقر نقرا مزدوجا فوق البئر المختار.

حدد تحليل. انقر ، أريد إعداد خطوة جديدة لتقليل بيانات تحليل الصور ، وانقر فوق OK.In إعدادات التحليل ، واضبط النوع على التحليل الخلوي وقناة الكشف إلى Z Projection المحول TSF Brightfield. انقر فوق خيارات لفتح صفحة القناع الأساسي والعدد.

تحقق تلقائي في مربع العتبة ، وانقر فوق "موافق" لإغلاق النافذة المنبثقة. ضمن تحديد الكائن، حدد الحد الأدنى والحد الأقصى لأحجام الكائنات لتصفية الحطام الخلوي أو الخلايا المفردة، وحدد معالم أخرى حسب الرغبة. بعد ذلك ، انقر فوق تطبيق وسيتم تمييز الكائنات المقنعة.

لإعداد تحليل مجموعة سكانية فرعية في شريط أدوات التحليل الخلوي ، انقر فوق المقاييس المحسوبة. بعد ذلك، انقر على تحديد أو إنشاء مقاييس على مستوى الكائن موضع الاهتمام في الزاوية السفلية اليسرى. من مقاييس الكائن المتاحة، اختر المقاييس المطلوبة، مثل الدائرية، وانقر على إدراج.

انقر فوق موافق للتأكيد. بعد ذلك، حدد تحليل السكان الفرعيين في شريط أدوات التحليل الخلوي، وانقر فوق إضافة لإنشاء مجموعة سكانية فرعية جديدة. أدخل اسما للسكان الفرعي.

في مقاييس الكائن، انقر على إضافة شرط لإضافة مقياس مختار. أدخل المعلمات المطلوبة في نافذة تحرير الشرط، وانقر فوق موافق. حدد النتائج المرجوة في الجدول أسفل النافذة وانقر فوق موافق ، متبوعا بتطبيق. ضمن تفاصيل الكائن، حدد المجتمع الفرعي المعين لعرض التقنيع.

إذا كنت راضيا، انقر فوق موافق في نافذة التحليل الخلوي، وانقر فوق إضافة خطوة لتطبيق التحليل على جميع الآبار.

Explore More Videos

Image Analysis

Gen5 Software

Drug Response

Patient derived Organoids

Multiplexed Live cell Imaging

Subpopulation Analysis