استخراج وتحليل بيانات مضان الكلوروفيل في شتلات أرابيدوبسيس

بعد إجراء جميع الجولات والتقاط صور الفلورسنت لشتلات Arabidopsis ، افتح البيانات التجريبية في برنامج المحلل. لإنشاء قناع درج، انقر خيار إنشاء نوع درج جديد. ثم اختر رقم صورة في الجولة وانقر فوق تحميل الصورة في الجزء العلوي من الشاشة.

بجانب الدخول إلى وضع الشكل الجديد ، انقر فوق أي من مجموعة الأزرار التي تمثل أدوات رسم الأشكال المختلفة. ارسم مجالات الاهتمام على صورة اللوحة. اختر الأنماط الجينية المختلفة على اللوحة وقدم الأسماء المناسبة لها.

انقر فوق هروب للخروج من وضع الشكل. ثم انقر فوق نوع درج المتجر لحفظ قناع الدرج الذي تم إنشاؤه. انتقل الآن إلى خيار التغيير حسب نوع الدرج وحدد القناع الذي تم إنشاؤه.

لإنشاء قناع نباتي بدقة عالية ، استخدم الصورة التي تم الحصول عليها بعد 180 دقيقة من القياس لتعيين الحد الأدنى لقيمة العتبة لشدة إشارة الفلورسنت ، قم بإزالة العلامة من العتبة التلقائية. قم بتعيين حد يدوي عند الصفر وانقر فوق معاينة. بعد ذلك ، اختر الجولة 91.

انقر فوق تحديث المعاينة، وتحقق مما إذا كان قناع الصفيف يغطي كل الأنماط الجينية على صورة اللوحة. اضبط خلفية الصورة واستخدم خيارات الألوان لتمييز قناع الدرج على صورة اللوحة. انقر فوق تشغيل ، وحدد فقط في الجولة 91 وابدأ التحليل.

بمجرد ظهور قائمة النهاية على الشاشة ، اختر الجولة المنفذة وانقر فوق محلل التبديل لتحليل البيانات لتصدير البيانات لهذه النقطة الزمنية المحددة. ثم انقر فوق رمز فتح جزء التصدير لاستخراج الملفات من الأرشيف المصدر. من وضع إعداد التحليل المحلي، انقر فوق إنشاء نوع درج جديد للدخول إلى قائمة منشئ القناع.

ثم انقر فوق تحميل الصورة ، واختر الجولة الرابعة. في الزاوية اليمنى العليا من الشاشة ، انقر فوق تحميل من ملف وقم بتحميل ملف XSEL. تظهر صورة اللوحة مع تطبيق قناع الدرج.

أدخل اسما لقناع النبات وانقر فوق نوع درج المتجر. قم بتطبيق قناع النبات عن طريق تحديد اسمه في خيار التغيير حسب نوع الدرج. ثم قم بإلغاء تحديد العتبة التلقائية للسماح بمعالجة العتبة يدويا.

في قائمة المعاينة ، قم بتغيير قيمة العتبة من الأقل إلى الأعلى حتى يتناسب قناع النبات الذي تم إنشاؤه تماما مع منطقة الاهتمام في كل من الأنماط الجينية. ثم اختر الجولة الأخيرة للتحقق مما إذا كان القناع يناسب جميع جولات القياسات. لإجراء التحليل لجميع جولات القياس، انقر فوق تشغيل، متبوعا ببدء التحليل.

بالمقارنة مع ظروف التحكم في وجود 6-benzylaminoporeen ، لوحظت اختلافات ملحوظة خلال المرحلة الأسية من تخليق الكلوروفيل في شتلات Arabidopsis من النوع البري.