توليد مخطط كموموغراف وقياس أحداث النقل الفردية في دودة Caenorhabditis elegans الحية

للبدء ، سجل الفاصل الزمني ل GFP Rab3 الداخلي في المنطقة اللاشبكية للمحور العصبي DA9 في Caenorhabditis elegans الحية. استيراد ملف بيانات الفاصل الزمني إلى فيجي. ثم تحقق من وجود حركة أو انحراف طفيف للحيوان أو جزء محور عصبي أثناء التقاط الصورة.

استخدم المكون الإضافي StackReg مع خيار تحويل الجسم الصلب لتصحيح أي حركة أو انحراف. استخدم أداة الخط المجزأ واضبط عرض الخط لمطابقة قطر المحور. انقر نقرا مزدوجا بزر الفأرة الأيسر على أيقونة الخط المجزأ لرسم خط على طول القطعة المحورية للتحليل.

الآن باستخدام المكون الإضافي Fiji KymoResliceWide ، قم بإنشاء kymograph ، مع تعيين قيمة الكثافة القصوى عبر عرض الخط في إعدادات المعلمات الخاصة به. باستخدام أداة الخط المستقيم ، تتبع أحداث النقل في kymograph. تتبع أحداث النقل الفردية واحفظ كل سطر في مدير عائد الاستثمار.

في فيجي ، حدد معلمات القياس مثل المساحة والمستطيل المحيط ومتوسط القيمة الرمادية وقطر Feret. ثم الصق جدول النتائج في جدول بيانات للحساب. اضرب العرض في دقة الكاميرا للحصول على طول التشغيل بالميكرومتر.

لتحديد مدة حدث الحركة ، اضرب الارتفاع في وقت الاستحواذ بين نقاط زمنية متتالية. احسب وقت الإيقاف المؤقت على أنه مدة التشغيل بين حركتين متتاليتين حيث تكون السرعة صفرا. قم بتسوية إجمالي الأحداث إلى الطول الإجمالي للكيموغراف لرقم الحدث في الدقيقة ومقطع طول المحور.

باستخدام أداة زاوية النمس ، قم بتصنيف الأحداث إلى نقل أمامي ورجعي. بالنسبة إلى أجهزة القياس الإلكتروني التي تم إنشاؤها عن طريق رسم الخط المجزأ من القريب إلى البعيد ، استخدم زاوية Feret لتحديد اتجاه كل حدث.