الالتحام الجزيئي للتحقيق في التفاعل بين الزانثاتين وبروتين Keap1

للبدء ، قم بتنزيل الهياكل البلورية ل Xanthatin و Keap1. بعد معالجة الهياكل ، انتقل إلى مهمتين وحدد خيار إرساء الرباط. اختر شبكة المستقبل من الملف وانقر فوق تصفح.

ثم انقر فوق سطح المكتب ، وافتح مجلد الإرساء الجزيئي وانقر نقرا مزدوجا فوق ملف 2FLU للشبكة المنزلقة. حدد الملف المضغوط 2FLU للشبكة المنزلقة وانقر فوق فتح. الآن ، انقر فوق استخدام الروابط من الملفات.

ثم انقر فوق استعراض وحدد سطح المكتب. حدد مجلد الإرساء الجزيئي وافتح ملف ligprep_1. بعد ذلك ، حدد ملف ligprep_1-out-maegz وانقر فوق فتح.

الوصول إلى الإعدادات واختيار الدقة مثل XP ، دقة إضافية ، خيار. قم بتعديل اسم الوظيفة للانزلاق. xp2flu ومن ثم انقر فوق تشغيل.

لعرض نتائج الإرساء ، انقر فوق ملف وحدد خيارات استيراد الهياكل. انتقل إلى سطح المكتب وافتح مجلد الإرساء الجزيئي. بعد ذلك ، حدد ملف XP 2FLU المنزلق.

اختر الانزلاق رصيف XP 1 الكهروضوئية. maegz وانقر فوق فتح. ثم انقر نقرا مزدوجا فوق النقطة في مساحة العمل لتحديد الرابطة.

اختر sitemap_1_protein. انقر فوق جدول ومرر إلى أقصى اليمين لعرض درجة الإرساء. لتصور نتائج 2D ، حدد sitemap_1_protein كما هو موضح سابقا.

انقر فوق تفاعل Ligand ، وحدد عرض وحدد مربع أسطورة LID. ثم اضغط قم بتقديم ، اختر حفظ لقطة الشاشة، وأدخل 6،000 للعرض. قم بإلغاء تحديد مربع الخلفية الشفافة وانقر فوق موافق. احفظ الملف على سطح المكتب ك 2D-زانثاتين-2FLU.

توقع تحليل الالتحام الجزيئي التفاعل بين بروتين Xanthatin و Keap1.