دمج تشغيل الشبكة الجزيئية في 2D-HPLC-MS لتحليل عينات بندول الأكونيتوم

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

16 Views

•

02:03 min

•

December 8th, 2023

DOI :

10.3791/201440-v

December 8th, 2023

•

Jing Ma*¹, Hanyu Lu*¹, Jia Liu¹, Ting Wang¹, Xing Fu², Xinmei Xu², Yi Zhang¹, Jing Zhang¹, Xiaolong Xie¹, Yingzhuang Chen³^,⁴, Jinsong Su¹

¹Ethnic Medicine Academic Heritage Innovation Research Center, Meishan Hospital, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, ²State Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, ³Key Laboratory of Chemical Biology & Traditional Chinese Medicine Research, Ministry of Education, ⁴Key Laboratory of Phytochemical R&D of Hunan Province, Hunan Normal University

* These authors contributed equally

Transcript

لبدء إعداد البيانات ، قم بتصدير البيانات الطيفية للكتلة الخام 2D HPLC-MS. بجوار الاتصال بخادم GNPS FTP في واجهة WINSCP في صفحة تكوين جلسة العمل، املأ معلومات الاتصال. بعد ملء المعلومات ، انقر فوق الزر "ابدأ" لإنشاء اتصال بخادم GNPS FTP.

قم بإنشاء شبكات جزيئية عن طريق فتح متصفح ويب وزيارة موقع GNPS على الويب. يحتاج المستخدمون الجدد إلى التسجيل للحصول على حساب ثم تسجيل الدخول. على الواجهة الرئيسية لموقع GNPS على الويب ، انقر فوق إنشاء شبكة جزيئية ضمن تحليل البيانات.

في صفحة إنشاء المهمة، انقر فوق الزر تحديد ملفات الإدخال، ثم حدد ملف البيانات وقم بتحميله. في علامات تبويب خيار سير العمل، قم بتعيين المعلمات المختلفة التي تنشئ الشبكة الجزيئية أو MN. تتضمن هذه المعلمات خوارزمية استخراج الذروة ، والذروة على قيمة السفر ، وطريقة حساب التشابه ، وما إلى ذلك. بعد إجراء إعدادات المعلمات المناسبة حسب الحاجة ، انقر فوق الزر إرسال في أسفل الصفحة لتشغيل المهمة.

بعد تشغيل المهمة، ابحث عن المهام التي تم إنشاؤها في علامة التبويب الوظائف وانقر فوق اسم سير العمل لعرض نتائج التحليل. يوفر موقع الويب مخططات MN والبدائل والشبكات التكافلية والمعلومات الأخرى ذات الصلة. أربعة من المكونات القلوية في عينات APB التي حددها MN هي الأكونيتين ، 14-البنزويلاكونين ، 14-O-أسيتيل نيولين و hypaconitine.

المركبات الأربعة لها نفس النواة الأبوية. كان الأكونيتين و 14-بنزيل أكونين و 14-بنزويلاكونين و هيباكونيتين متشابهين ، وكانت البدائل فقط مختلفة.

Explore More Videos

Molecular Network Operation

Raw Mass Spectral Data

Molecular Networks

Peak Extraction Algorithm

Similarity Calculation Method

Alkaloid Components