باتباع الطرق المبينة في هذا البروتوكول سيتمكن الباحثون من تسجيل وتحليل مقاطع الفيديو الخاصة بالقوارض التي تقوم بإجراء اختبارات سلوكية معقدة في غرف التكييفات الأوبرالية. يصف البروتوكول كيفية بناء كاميرا فيديو غير مكلفة واستخدامها مع برنامج تتبع مفتوح المصدر. هذا هو نهج جذاب للمختبرات على الميزانية.
هذه الطريقة قيمة لمشاريع البحوث التي تنطوي على تكييف operant في القوارض. كما يمكن لتحليل الفيديو تحسين كبير في فهم السلوكيات التي ينظر إليها في هذا النوع من الاختبارات. تبدأ من خلال ربط حلقة معدنية حول فتح حامل الكاميرا.
ثم نعلق وحدة الكاميرا إلى موقف باستخدام الصواميل والبراغي التي تصاحب عدة. افتح منافذ كابل الشريط على وحدة الكاميرا والحاسوب الصغير عن طريق التجمع بلطف على حواف شفاههم البلاستيكية. قم بإشعال كابل الشريط في المنفذ المفتوح على وحدة الكاميرا بحيث تواجه موصلات الكابلات الفضية لوحة الدارات.
ثم قفله في مكانه عن طريق الضغط في مقطع من البلاستيك. كرر العملية باستخدام منفذ على الكمبيوتر الصغير. ثم قم بتوصيل عدسة فيش إلى الحلقة المعدنية على حامل الكاميرا.
ضع الكمبيوتر الصغير في علبة البلاستيك وأدخل بطاقة SD الصغيرة المدرجة. ثم قم بتوصيل جهاز عرض ولوحة مفاتيح وماوس إلى الكمبيوتر الصغير وبدأت بتوصيل مصدر الطاقة الخاص به. فتح نافذة المحطة الطرفية ونوع سودو apt الواصلة، والحصول على التحديث.
ثم اضغط على مفتاح الإدخال. نوع القادم sudo ملائمة الواصلة الكاملة الترقية واضغط على إدخال. ضمن قائمة البدء، حدد التفضيلات وتكوينات RASP PI.
عندما يفتح الإطار، انتقل إلى علامة التبويب الواجهات وتمكين الكاميرا و I2C ثم انقر فوق حسنا. نسخ ملف تكميلي واحد على عصا ذاكرة USB. ثم نقله إلى الحواسيب الصغيرة المجلد PI الرئيسية وإعادة تسميته.
فتح نوع نافذة المحطة الطرفية الزائفة نانو مائل الخ، مائلة RC نقطة المحلية والصحافة enter. استخدم مفاتيح الأسهم لوحات المفاتيح لتحريك المؤشر إلى أسفل إلى المسافة بين فاي والخروج صفر. ثم إضافة نص لجعل الكمبيوتر بدء البرنامج النصي المنسوخة.
والمصابيح الحمراء تحت الحمراء، كلما الأحذية. حفظ التغييرات عن طريق الضغط على السيطرة وX تليها Y وأدخل. المقاومات لحام المقبل وكابلات الطائر الإناث على الساقين من المصابيح الملونة اثنين.
الكابلات الطائر الإناث لحام على اثنين من مفاتيح زر. ثم قم بتوصيل مفاتيح المصابيح الملونة والأشعة تحت الحمراء المذكورة وحدة بقيادة لأجهزة الكمبيوتر GPI طوق ينتهي. عند توصيلها بشكل صحيح، سوف يشير أحد الدلّين إلى أن الكاميرا مُشغّل وجاهزة للاستخدام.
بينما يشير الآخر إلى أن الكاميرا تقوم بتسجيل فيديو. يتم استخدام الزر مع الكابلات الطويلة لبدء وإيقاف تسجيلات الفيديو. بينما يتم استخدام الزر مع هذه الكابلات القصيرة لإيقاف تشغيل الكاميرا.
تعيين البروتوكول لاستخدام غرفة ضوء كمؤشر على خطوة معينة في البروتوكول. ثم تعيين بروتوكول لتسجيل كافة الأحداث ذات الاهتمام مع الطوابع الزمنية بالنسبة إلى عندما يصبح هذا المؤشر خطوة بروتوكول نشطة. ضع الكاميرا فوق الغرف القابلة للتشغيل، ثم ابدأ بتوصيلها بمأخذ كهربائي عبر كابل إمداد الطاقة.
استخدم الزر المتصل مسبقًا لبدء تسجيلات الفيديو وإيقافها. عند الانتهاء من تسجيلات الفيديو، قم بتوصيل الكاميرا بجهاز عرض وماوس لوحة مفاتيح وجهاز تخزين USB واسترداد ملفات الفيديو من سطح المكتب الخاص به. استخدام DeeplabCuts الإطار الاستيلاء على وظيفة لاستخراج 700 إلى 900 إطارات الفيديو من واحد أو أكثر من أشرطة الفيديو المسجلة.
تأكد من أن إطارات الفيديو التي تحددها تعرض الحيوان في أوضاع مختلفة ، سواء ثابتة مع الرأس خارج وداخل الفتحات وتتحرك في اتجاهات مختلفة. استخدم صندوق أدوات وضع العلامات لوضع علامة يدوية على موضع رأس الجرذ في كل إطار فيديو عن طريق وضع ملصق الرأس في موضع مركزي بين أذني الجرذ. أيضا تسمية أجزاء أخرى من الجسم التي قد تكون ذات فائدة.
بالإضافة إلى ذلك، ضع علامة على موضع مؤشر خطوة البروتوكول في كل إطار فيديو حيث ساطع بشكل نشط. بعد ذلك استخدام مجموعة بيانات إنشاء التدريب وتدريب وظائف الشبكة لإنشاء مجموعة بيانات التدريب من إطارات الفيديو المسمى والبدء في تدريب شبكة عصبية. عندما يتم تدريب شبكة عصبية، استخدمها لتحليل مقاطع الفيديو التي تم جمعها.
هذا سوف يخلق ملف CSV سرد مواقف المسار من رأس الفئران، وأجزاء الجسم الأخرى من الفائدة ومؤشر الخطوة بروتوكول في كل إطار الفيديو. بالإضافة إلى ذلك ، سيتم إنشاء ملفات فيديو تم وضع علامة عليها حيث يتم عرض مواضع المسار بشكل مرئي. للحصول على إحداثيات نقاط معينة من الاهتمام داخل الغرف operant يدوياً وضع علامة على أنها تم وصفها مسبقاً واسترداد الإحداثيات من ملف CSV الذي يتم تخزينه تلقائياً تحت البيانات المسماة في مجلد المشروع.
ملاحظة، حيث يتم تعقب مقطع الفيديو مؤشر خطوة بروتوكول داخل 60 بكسل من الموضع الذي تم الحصول عليه يدويا في المقطع السابق واستخراج نقطة البداية الدقيقة لكل فترة حيث المؤشر نشط. استخدم النقاط حيث يصبح مؤشر خطوة البروتوكول نشطًا والطوابع الزمنية المسجلة من قبل الغرف operant. لتحديد مقاطع الفيديو التي تغطي أحداث معينة من بروتوكول الاختبار مثل الفترات الفاصلة بين المحاكمات أو الاستجابات أو استرداد المكافأة.
لاحظ إطارات الفيديو التي تغطي أي أحداث ذات أهمية محددة. وأخيرا إجراء تحليل متعمق ذات الصلة من موقف الحيوان والحركات، خلال هذه الأحداث. يجب أن تسمح عدسة عين السمكة للكاميرا بالتقاط رؤية كاملة لداخل معظم غرف التكييفات القاربة.
باستخدام مصدر مناسب من الإضاءة تحت الحمراء، وسوف تسمح الكاميرا أيضا التقاط الفيديو في الظلام الدامس. وينبغي أن تسمح شبكة مدربة تدريبا جيدا لأكثر من دقة 90٪ عند تتبع رأس. تتبع دقيق يمكن التعرف عليها بوضوح من قبل علامات التالية في جميع أنحاء تحركاته والمسارات المرسومة تظهر على نحو سلس.
وعلى النقيض من ذلك، يتميز التتبع غير الدقيق بعلامات لا تبقى بشكل موثوق على الهدف والمسارات المرسومة خشنة. ونتيجة لهذا تتبع غير دقيق عادة ما يسبب التحولات المفاجئة في الحركات المحسوبة بسرعة. من خلال تتبع مكان وجود الحيوان طوال جلسة الاختبار ، يمكن للمرء تقييم مدى ارتباط أنماط الحركة المتميزة بالأداء.
على سبيل المثال، في اختبار وقت التفاعل التسلسلي الخمسة، يمكن استخدام حركات الرأس خلال الفاصل الزمني بين التجارب لفصل تجارب الانبعاثات حيث يظهر الحيوان اهتماماً محدوداً في إجراء استجابة. من التجارب البعثة حيث الحيوان ببساطة فشل في ملاحظة إشارة ضوئية وجيزة. وبالإضافة إلى ذلك يمكن التحقيق في حركات الرأس تمكين الكشف عن وتوصيف استراتيجيات مختلفة الاهتمام.
عند محاولة هذه الإجراءات، من المهم أن يكون مؤشر خطوة البروتوكول موثوقًا به. وأن الشبكة العصبية مدربة مع الغوص ert من إطارات الفيديو. لضمان تتبع دقيق.
