על ידי ביצוע השיטות המתוארות בפרוטוקול זה החוקרים יוכלו להקליט ולנתח קטעי וידאו של מכרסמים המבצעים בדיקות התנהגות מורכבות בתאי התניה אופרנטיים. הפרוטוקול מתאר כיצד לבנות מצלמת וידאו זולה ולהשתמש בה יחד עם תוכנת מעקב קוד פתוח. זוהי גישה אטרקטיבית עבור מעבדות על תקציב.
השיטה חשובה לפרויקטים מחקריים הכוללים התניה אופרנטית במכרסמים. כמו ניתוח וידאו יכול לשפר מאוד את ההבנה של התנהגויות לראות בסוג זה של בדיקות. התחל על ידי חיבור טבעת המתכת סביב פתיחת מעמד המצלמה.
לאחר מכן חבר את מודול המצלמה לעמוד באמצעות האגוזים והברגים המלווים את הערכה. פתח את יציאות כבל הסרט במודול המצלמה ובמיקרו-מחשב על-ידי תבריג בעדינות בשולי שפתי הפלסטיק שלהן. התלקחות כבל הסרט ליציאה הפתוחה במודול המצלמה כך שמחברי הכסף של הכבלים יעמדו בפני לוח המעגלים.
ואז לנעול אותו במקום על ידי דחיפת קליפ פלסטיק. חזור על התהליך עם יציאה במיקרו-מחשב. לאחר מכן חבר את עדשת עין הדג לטבעת המתכת על דוכן המצלמה.
מניחים את המיקרו מחשב במארז הפלסטיק ומכניסים את כרטיס המיקרו SD הרשום. לאחר מכן חבר צג, לוח מקשים ועכבר למיקרו מחשב והתחל על-ידי חיבור ספק הכוח שלו. פתח חלון מסוף והקלד מקף sudo apt, קבל עדכון.
לאחר מכן הקש על מקש enter. הסוג הבא sudo apt שדרוג מקף מלא ולחץ על הזן. תחת תפריט התחלה, בחר העדפות ותצורות PI פטל.
כאשר החלון נפתח, עבור אל הכרטיסיה ממשקים והפוך את המצלמה ואת I2C לזמינים ולאחר מכן לחץ על אישור. העתק קובץ משלים אחד אל מקל זיכרון USB. לאחר מכן העבר אותו לתיקיית PI הביתית של מחשבי המיקרו-מחשבים ושנה את שמה.
פתח סוג חלון מסוף פסאודו ננו קו נטוי וכו ', קו נטוי RC נקודה מקומית ולחץ על הזן. השתמש במקשי החצים של לוחות המקשים כדי להזיז את הסמן כלפי מטה אל הרווח שבין fi לבין יציאה מאפס. לאחר מכן הוסף טקסט כדי לגרום למחשב להפעיל את קובץ ה- Script שהועתק.
ואת נוריות אינפרא אדום, בכל פעם שהוא מגפיים. שמור את השינויים על-ידי הקשה על פקד ו- X ואחריו Y והזן. נגדי הלחם הבאים וכבלי מגשר נקבה על הרגליים של שתי נקודות אור צבעוניות.
כבלי מגשר נקבה הלחם על שני מתגי כפתור. לאחר מכן חבר את נוריות LED צבעוניות מתגים ואת מודול הוביל אינפרא אדום המפורטים לקצוות חישוק GPI המחשבים. כאשר מחובר כראוי, LED אחד יציין כי המצלמה מופעלת ומוכנה לשימוש.
בעוד השני מציין שהמצלמה מקליטה וידאו. הלחצן עם הכבלים הארוכים משמש להפעלה ולהפסקה של הקלטות וידאו. בעוד שהלחצן עם כבלים קצרים אלה משמש ל כיבוי המצלמה.
הגדר את הפרוטוקול לשימוש באור הבית של תאי האופרנטים כמאינדיקטור לשלב מסוים בפרוטוקול. לאחר מכן הגדר את הפרוטוקול כדי לתעד את כל האירועים המעניינים בתווימות זמן ביחס לכאשר מחוון שלב פרוטוקול זה הופך לפעיל. מניחים את המצלמה על גבי התאים האופרנטיים והתחילו בחיבורה לשקע חשמל באמצעות כבל אספקת החשמל.
השתמש בלחצן שהיה מחובר בעבר כדי להפעיל ולהפסיק הקלטות וידאו. לאחר סיום הקלטות הווידאו, חבר את המצלמה לצג, לעכבר מקלדת ולהתקן אחסון USB ואחזר את קבצי הווידאו משולחן העבודה שלו. השתמש בפונקציית תפיסת מסגרת DeeplabCuts כדי לחלץ 700 עד 900 מסגרות וידאו מאחד או יותר מהסרטונים המוקלטים.
ודאו שמסגרות הוידאו שתבחרו יציגו את החיה בתנופים שונים, הן נייחים עם הראש בחוץ והן בפנים של הפתחים וזזים בכיוונים שונים. השתמש בארגז הכלים לתיוג כדי לסמן באופן ידני את מיקום ראשו של החולדה בכל מסגרת וידאו על-ידי הצבת תווית ראש בתווית מרכזית בין אוזני החולדה. גם תווית חלקי גוף אחרים שעשויים להיות מעניינים.
בנוסף, סמן מיקום של מחוון שלב הפרוטוקול בכל מסגרת וידאו שבה הוא זורח באופן פעיל. לאחר מכן השתמש ביצירת ערכת נתוני הדרכה ופונקציות רשת אימון כדי ליצור ערכת נתוני הדרכה ממסגרות הווידאו המסומן ולהתחיל את האימון של רשת עצבית. כאשר רשת עצבית אומנה, השתמש בה כדי לנתח את הסרטונים שנאספו.
פעולה זו תיצור קובץ CSV המפרט את עמדות המסלול של ראשו של החולדה, חלקי גוף אחרים של עניין ואת מחוון שלב הפרוטוקול בכל מסגרת וידאו. בנוסף, הוא ייצור קבצי וידאו מסומנים שבהם עמדות המסלול מוצגות באופן חזותי. כדי להשיג קואורדינטות של נקודות עניין ספציפיות בתוך התאים האופרנטיים, סמן אותן באופן ידני כמתואר לעיל ואחזר את הקואורדינטות מקובץ ה- CSV המאוחסן באופן אוטומטי תחת נתונים מסומנים בתווית בתיקיית הפרוייקט.
הערה, שבו מקטעי וידאו מחוון צעד הפרוטוקול הוא במעקב בתוך 60 פיקסלים של המיקום שהושג באופן ידני בסעיף הקודם ולחלץ את נקודת ההתחלה המדויקת עבור כל תקופה שבה המחוון פעיל. השתמש בנקודות שבהן מחוון שלב הפרוטוקול הופך לפעיל ואת חותמות הזמן שנרשמו על-ידי התאים האופרנטיים. כדי לקבוע אילו מקטעי וידאו מכסים אירועים ספציפיים של פרוטוקול הבדיקה, כגון מרווחי זמן בין-גירסתיים, תגובות או אחזור תגמולים.
שים לב למסגרות הווידאו שהן מכסות אירועים מעניינים במיוחד. לבסוף לבצע ניתוח מעמיק רלוונטי של המיקום והתנועות של החיה, במהלך אירועים אלה. עדשת עין הדג של המצלמה אמורה לאפשר לה ללכוד תצוגה מלאה של החלק הפנימי של רוב תאי המיזוג האופרנטיים של המכרסמים.
באמצעות מקור מתאים של תאורת אינפרא אדום, המצלמה תאפשר גם לכידת וידאו בחושך מוחלט. רשת מאומנת היטב אמורה לאפשר דיוק של יותר מ-90% בעת מעקב אחר ראשו של בעל חיים. מעקב מדויק ניתן לזיהוי בבירור על ידי סמנים העוקבים אחר בעל חיים לאורך כל תנועותיו ושביליו המותווים שנראים חלקים.
לעומת זאת, מעקב לא מדויק מאופיין בסמנים שלא נשארים באופן אמין ביעד ובנתיבים משוננים. כתוצאה של מעקב לא מדויק זה בדרך כלל גורם לשינויים פתאומיים במהירויות תנועות מחושבות. על ידי מעקב אחר המיקום של בעל חיים לאורך כל מפגש הבדיקה, ניתן להעריך כיצד דפוסי תנועה ברורים מתייחסים לביצועים.
לדוגמה, במבחן זמן התגובה הסדרתי של חמש אפשרויות, תנועות ראש במהלך מרווח הזמן של הבין-ניסויים, יכולות לשמש לניסויי פליטה נפרדים שבהם החיה מראה עניין מוגבל בביצוע תגובה. מניסויי משימה שבהם החיה פשוט לא מצליחה להבחין בסימן האור הקצר. בנוסף, חקירת תנועות ראש יכולה לאפשר איתור ואפיון של אסטרטגיות קשב שונות.
בעת ניסיון לבצע הליך זה, חשוב שמימן שלב הפרוטוקול יהיה מהימן. ושרשת העצבים מאומנת עם צלילה של מסגרות וידאו. כדי להבטיח מעקב מדויק.
