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Genetic Modification and Recombination of Salivary Gland Organ Cultures

Branching  morphogenesis occurs during the development of many organs, and the embryonic  mouse submandibular gland (SMG) is a classical model for the ...

University at Albany, SUNY

DNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x5C5E;&#x6027;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x7684; Cu(II)&#xFF0C;&#x5373;&#xFF0C;[Cu(mal)(2)](picH) (2) (2).2H O&#xFF0C;&#xFF08;mal)(2) = &#x4E19;&#x4E8C;&#x9178;&#x3001; &#x5939; = &#x8D28;&#x5B50;&#x5316; 2-&#x6C28;&#x57FA;-4-&#x7532;&#x57FA;&#x5421;&#x5576;&#x3001; &#x5728;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x7531;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x7269;&#x7406;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#x4E0E;&#x8D28;&#x7C92;&#x548C;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; DNA &#x8FD9;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x3002;&#x4ECE;&#x5438;&#x6536;&#x548C;&#x8367;&#x5149;&#x5149;&#x8C31;&#x7814;&#x7A76;&#x6307;&#x51FA;&#x8BF4;&#x94DC;&#x590D;&#x6742;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5F3A;&#x70C8; pUC19 &#x8D28;&#x7C92;&#x4E0E; CT DNA 2.368 x 10 &#xFF08;3&#xFF09; &#x548C; 4.0 x 10 &#xFF08;3&#xFF09; M(-1)&#xFF0C;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x4EB2;&#x548C;&#x529B;&#x5206;&#x522B;&#x5728; 10 &#x6BEB;&#x7C73;&#x67B8;&#x6A7C;&#x9178;-&#x78F7;&#x9178;&#x7F13;&#x51B2;&#x533A;&#x4E2D;&#xFF0C;ph &#x503C; 7.4&#x3002;&#x8367;&#x5149;&#x6CD5;&#x7814;&#x7A76;&#x63ED;&#x793A;&#x7684;&#x94DC;&#x60C5;&#x7ED3;&#x5C55;&#x54C1;&#x90E8;&#x5206; DNA &#x63D2;&#x5C42;&#x4EE5;&#x53CA;&#x90E8;&#x5206; DNA &#x5C0F;&#x6C9F;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5C5E;&#x6027;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x5728;&#x743C;&#x8102;&#x7CD6;&#x51DD;&#x80F6;&#x7535;&#x6CF3;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6709;&#x4EBA;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x4EC5;&#x590D;&#x6742;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x8D85;&#x7EC6;&#x7684;&#x8D28;&#x7C92; DNA &#x9633;&#x6027;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x5B58;&#x5728; H(2)O(2) &#x4E0B;&#x5B83;&#x5C55;&#x54C1;&#x6838;&#x9178;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x5728; DNA &#x4E3B;&#x5E72;&#x65AD;&#x88C2;&#x7684;&#x611F;&#x5E94;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E; H(2)O(2) &#x548C;&#x94DC;&#x590D;&#x6742;&#x7684; DNA &#x4E0E;&#x5B75;&#x5316;&#x65F6;&#x95F4;&#x540E;&#x8DDF;&#x7684;&#x76F8;&#x5BF9;&#x6D53;&#x5EA6;&#x3002;&#x5DF2;&#x7528;&#x4E8E;&#x7194;&#x70BC;&#x7814;&#x7A76;&#x3001; &#x7B49;&#x6E29;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x91CF;&#x70ED;&#x548C;&#x5438;&#x6536;&#x5149;&#x8C31;&#x5149;&#x5B66; DNA &#x6838;&#x9178;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x7684;&#x4E0B; H(2)O(2) &#x8FD9;&#x590D;&#x6742;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#xFF0C;(1) H &#x6838;&#x78C1;&#x5171;&#x632F;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x5C06;&#x5728;&#x590D;&#x6742;&#x7684; Cu(II) &#x8F6C;&#x6362;&#x4E3A; Cu(I) &#x72B6;&#x6001; H(2)O(2) &#x7684;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x81EA;&#x7531;&#x57FA;&#x6E05;&#x9664;&#x5242;&#x743C;&#x8102;&#x7CD6;&#x51DD;&#x80F6;&#x7535;&#x6CF3;&#x6CD5;&#x7814;&#x7A76;&#x5F97;&#x51FA;&#x7ED3;&#x8BBA;&#x7F9F;&#x57FA;&#x81EA;&#x7531;&#x57FA;&#x548C;&#x6D3B;&#x6027;&#x6C27;&#x7684;&#x751F;&#x4EA7;&#x8D1F;&#x8D23;&#x6B64;&#x6838;&#x9178;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;

&#x6838;&#x9178;&#x9176;&#x6D3B;&#x6027;&#x7684;&#x65B0;&#x578B; Cu(II) &#x590D;&#x6742;&#x4E0E;&#x4E19;&#x4E8C;&#x9178;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E3B;&#x914D;&#x4F53;&#x548C;&#x8D28;&#x5B50;&#x5316; 2-&#x6C28;&#x57FA;-4-&#x7532;&#x57FA;&#x5421;&#x5576;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x53CD;&#x79BB;&#x5B50;&#x8BF1;&#x5BFC; DNA &#x7ED3;&#x5408;&#x80FD;&#x529B;&#x4E0E;&#x8FC7;&#x6C27;&#x5316;&#x6C22;&#x3002;

The DNA binding property of a Cu(II) complex, viz., [Cu(mal)(2)](picH)(2).2H(2)O, (mal)(2) = malonic acid, picH = protonated 2-amino-4-picoline, has been investigated in this study. The binding of this complex with plasmid and chromosomal DNA has been characterized by different biophysical techniques. From the absorption and fluorescence spectroscopic studies, it has been observed that the said copper complex binds strongly with pUC19 plasmid and CT DNA with a binding affinity of 2.368 x 10(3) and 4.0 x 10(3) M(-1), respectively, in 10 mM citrate-phosphate buffer, pH 7.4. Spectrofluorimetric studies reveal that the copper complex exhibits partial DNA intercalation as well as partial DNA minor groove binding properties. Consequently, in agarose gel electrophoresis study, it has been observed that the complex alone induces positive supercoiling in plasmid DNA while in the presence of H(2)O(2) it exhibits nuclease activity. The induction of the breakage in DNA backbone depends upon the relative concentrations of H(2)O(2) and copper complex followed by the time of incubation with DNA. Optical DNA melting study, isothermal titration calorimetry, and absorption spectroscopy have been used to characterize the nuclease activity of this complex in the presence of H(2)O(2). Further, (1)H NMR study indicates that Cu(II) in the complex is converted into the Cu(I) state by the reduction of H(2)O(2). Finally, agarose gel electrophoresis study with different radical scavengers concludes that the production of both hydroxyl radicals and reactive oxygen species is responsible for this nuclease activity.

DNA binding ability and hydrogen peroxide induced nuclease activity of a novel Cu(II) complex with malonate as the primary ligand and protonated 2-amino-4-picoline as the counterion.

La propri&eacute;t&eacute; de liaison de l&#39;ADN d&#39;un complexe de Cu (II), &agrave; savoir, [O .2H (2) de Cu(mal)(2)](picH) (2), (mal)(2) = acide malonique, picH = proton&eacute; 2-amino-4-picoline, a &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;e dans la pr&eacute;sente &eacute;tude. La liaison de ce complexe avec le plasmide et l&#39;ADN chromosomique a &eacute;t&eacute; caract&eacute;ris&eacute;e par diff&eacute;rentes techniques biophysiques. Des &eacute;tudes spectroscopiques d&#39;absorption et de fluorescence, il a &eacute;t&eacute; observ&eacute; que le complexe de cuivre ladite lie fortement avec le plasmide pUC19 et CT DNA avec une affinit&eacute; de liaison de 2.368 x 10 (3) et de 4,0 x 10 (3) M(-1), respectivement, dans un tampon citrate-phosphate 10 mM, pH 7,4. Spectrofluorim&eacute;trique &eacute;tudes r&eacute;v&egrave;lent que le complexe de cuivre pr&eacute;sente une intercalation partielle de l&#39;ADN ainsi que les propri&eacute;t&eacute;s de liaison partielles ADN rainure mineure. Par cons&eacute;quent, dans l&#39;&eacute;tude de l&#39;&eacute;lectrophor&egrave;se sur gel d&#39;agarose, on a observ&eacute; que le complexe seul induit positive supercoiling dans l&#39;ADN de plasmide, alors qu&#39;en pr&eacute;sence de H(2)O(2), il pr&eacute;sente une activit&eacute; nucl&eacute;asique. L&#39;induction de la rupture de l&#39;ADN varie selon les concentrations relatives de H(2)O(2) et complexe de cuivre suivie du temps d&#39;incubation avec l&#39;ADN. Fonte des &eacute;tude, calorim&eacute;trie isotherme de titration et spectroscopie d&#39;absorption optique d&#39;ADN ont &eacute;t&eacute; utilis&eacute;s pour caract&eacute;riser l&#39;activit&eacute; nucl&eacute;asique de ce complexe en pr&eacute;sence de H(2)O(2). En outre, &eacute;tude par RMN de H (1) indique que le Cu (II) dans le complexe est convertie en l&#39;&eacute;tat de Cu (i) par la r&eacute;duction des H(2)O(2). Enfin, l&#39;&eacute;tude de l&#39;&eacute;lectrophor&egrave;se sur gel agarose avec diff&eacute;rents pi&egrave;ges &agrave; radicaux conclut que la production de radicaux hydroxyle et les esp&egrave;ces r&eacute;actives de l&#39;oxyg&egrave;ne est responsable de cette activit&eacute; nucl&eacute;asique.

Capacit&eacute; de liaison de l&#39;ADN et de peroxyde d&#39;hydrog&egrave;ne induite par activit&eacute; nucl&eacute;asique d&#39;un Cu (II) nouveaux complexes avec le malonate comme ligand primaire et proton&eacute; 2-amino-4-picoline comme contre-ion.

Die DNA Binding-Eigenschaft von einem komplexen Cu(II), K&ouml;rperbehinderte, [Cu(mal)(2)](picH) (2) .2H (2) O, (mal)(2) = Malons&auml;ure, PicH = protoniert 2-amino-4-Picoline, wurde in dieser Studie untersucht. Die Bindung dieses Komplexes mit Plasmid und chromosomaler DNA war durch verschiedene biophysikalische Techniken charakterisiert. Aus der Absorption und Fluoreszenz spektroskopischen Untersuchungen wurde festgestellt, dass der besagte Kupfer Komplex stark mit Plasmid pUC19 und CT-DNA mit einem Bindungsaffinit&auml;t von 2.368 x 10 Absatz 3 und 4,0 X 10 Absatz 3 M(-1), jeweils in 10 mM-Citrat-Phosphat-Puffer, pH 7.4 bindet. Fluoreszenzdetektors Studien zeigen, dass der Kupfer Komplex partielle DNA Interkalation sowie teilweise DNA minor Groove Bindungseigenschaften aufweist. Folglich wurde in Agarose-Gel-Elektrophorese-Studie, es beobachtet, dass der Komplex allein Positive supercoiling in Plasmid DNA, induziert w&auml;hrend in Anwesenheit von H(2)O(2) es Nuklease-Aktivit&auml;t aufweist. Die Induktion von den Bruch in DNA R&uuml;ckgrat h&auml;ngt von der relativen Konzentrationen von H(2)O(2) und Kupfer Komplex, gefolgt von der Zeit der Inkubation mit DNA ab. Optische DNA schmelzen, Studie, Isotherme Titrierung Kalorimetrie und Absorptionsspektroskopie wurden verwendet, um die Nuklease-Aktivit&auml;t dieses Komplexes in Anwesenheit von H(2)O(2) zu charakterisieren. Weiter (1) H-NMR-Studie zeigt, dass Cu(II) im Komplex durch Reduktion von H(2)O(2) in den Cu(I) Zustand umgewandelt wird. Schlie&szlig;lich schlie&szlig;t Agarose-Gel-Elektrophorese-Studie mit verschiedenen radikalen Aasfresser, dass die Produktion von Hydroxyl-radikale und reaktive Sauerstoffspezies f&uuml;r diese Nuklease-Aktivit&auml;t verantwortlich ist.

DNA-Bindung-F&auml;higkeit und Wasserstoffperoxid induzierte Nuklease-T&auml;tigkeit des eine neuartige Cu(II) Komplex mit Malonate als prim&auml;rer Liganden und protoniert 2-amino-4-Picoline als der Counterion.

La propriet&agrave; di associazione del DNA di un complesso di cu, cio&egrave;, [Cu(mal)(2)](picH) (2) O .2h (2), (mal)(2) = acido malonico, picH = protonati 2-ammino-4-picolina, &egrave; stato studiato in questo studio. L&#39;associazione di questo complesso con il plasmide e il DNA cromosomico &egrave; stata caratterizzata da diverse tecniche biofisiche. Da studi spettroscopici di assorbimento e fluorescenza, &egrave; stato osservato che il detto rame complesso si lega fortemente con il plasmide pUC19 e CT DNA con un&#39;affinit&agrave; di legame di 2.368 x 10, paragrafo 3 e 4,0 x 10, paragrafo 3 M(-1), rispettivamente, in tampone citrato-fosfato 10 mM, pH 7.4. Spettrofluorimetrico studi rivelano che il complesso rame esibisce intercalazione DNA parziale cos&igrave; come parziale propriet&agrave; dell&#39;associazione solco minore del DNA. Di conseguenza, nello studio di agarosio gel elettroforesi, &egrave; stato osservato che il complesso da solo induce positivo superavvolgimento di DNA del plasmide, mentre in presenza di H(2)O(2) esibisce attivit&agrave; della nucleasi. L&#39;induzione di rottura nella spina dorsale del DNA dipende le concentrazioni relative di H(2)O(2) e il complesso rame seguita dal tempo di incubazione con DNA. DNA ottica fusione studio, calorimetria isotermica di titolazione e spettroscopia di assorbimento sono stati usati per caratterizzare l&#39;attivit&agrave; della nucleasi di questo complesso in presenza di H(2)O(2). Ulteriore, (1) H NMR studio indica che cu nel complesso &egrave; convertita in stato Cu(I) dalla riduzione del H(2)O(2). Infine, agarosio gel elettroforesi studio con diversi spazzini radicale si conclude che la produzione di radicali idrossilici e di specie reattive dell&#39;ossigeno &egrave; responsabile di questa attivit&agrave; della nucleasi.

Capacit&agrave; di legame del DNA e perossido di idrogeno, indotta da attivit&agrave; della nucleasi di un romanzo cu complesso con malonato come il ligando primario e protonati 2-ammino-4-picolina come il counterion.

&#x8907;&#x96D1;&#x306A; cu (ii) &#x306E; DNA &#x7D50;&#x5408;&#x7279;&#x6027;&#x3001;&#x3059;&#x306A;&#x308F;&#x3061;&#x3001;[Cu(mal)(2)](picH) (2) .2H (2) O (mal)(2) &#x30DE;&#x30ED;&#x30F3;&#x9178;&#x3001;&#x30D4;&#x30C3;&#x30C1;&#x3092; = = &#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30F3;&#x5316; 2-&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;-4-&#x30D4;&#x30B3;&#x30EA;&#x30F3;, &#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x691C;&#x8A0E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x30DF;&#x30C3;&#x30C9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; DNA &#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x3063;&#x305F;&#x5E74;&#x4F1A;&#x6280;&#x8853;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7279;&#x5FB4;&#x3065;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5438;&#x53CE;&#x3068;&#x86CD;&#x5149;&#x306E;&#x5206;&#x5149;&#x5B66;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x5F53;&#x8A72;&#x9285;&#x932F;&#x4F53;&#x5F37;&#x304F; pUC19 &#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x30DF;&#x30C9;&#x3068; CT DNA &#x3068; x 10 (3) &#x304A;&#x3088;&#x3073; 4.0 x 10 (3) M(-1)&#x3001;2.368 &#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x3092;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C; 10 mM &#x30AF;&#x30A8;&#x30F3;&#x9178;-&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x30D0;&#x30C3;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x5185; pH 7.4 &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x86CD;&#x5149;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x7814;&#x7A76;&#x9285;&#x932F;&#x4F53;&#x306E;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306A; DNA &#x526F;&#x6E9D;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0; &#x30D7;&#x30ED;&#x30D1;&#x30C6;&#x30A3;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x306A; DNA &#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5C55;&#x793A;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;agarose &#x306E;&#x30B2;&#x30EB;&#x306E;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;, &#x305D;&#x308C;&#x30AB;&#x30BF;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x305D;&#x308C;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x5C55;&#x793A;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x80AF;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x30DF;&#x30C3;&#x30C9; DNA &#x3079;&#x3093;&#x6BDB;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;DNA &#x306E;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x30DC;&#x30FC;&#x30F3;&#x3067;&#x7834;&#x640D;&#x306E;&#x8A98;&#x5C0E;&#x30AB;&#x30BF;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x3068; DNA &#x3068;&#x306E;&#x5B75;&#x5316;&#x306E;&#x6642;&#x9593;&#x7D9A;&#x3044;&#x3066;&#x9285;&#x932F;&#x4F53;&#x306E;&#x76F8;&#x5BFE;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x878D;&#x89E3;&#x7814;&#x7A76;&#x3001;&#x7B49;&#x6E29;&#x6EF4;&#x5B9A;&#x578B;&#x71B1;&#x91CF;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3068;&#x5438;&#x53CE;&#x5206;&#x5149;&#x5149;&#x5B66; DNA &#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x6027;&#x8907;&#x5408;&#x30AB;&#x30BF;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x8A55;&#x4FA1;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;(1) H NMR &#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x8907;&#x5408;&#x4F53;&#x306E; cu (ii) (i) &#x72B6;&#x614B;&#x306B;&#x30AB;&#x30BF;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x524A;&#x6E1B;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5909;&#x63DB;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;agarose &#x306E;&#x30B2;&#x30EB;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5;&#x7814;&#x7A76;&#x5225;&#x306A;&#x30E9;&#x30B8;&#x30AB;&#x30EB;&#x30B9;&#x30AB;&#x30D9;&#x30F3; &#x30B8;&#x30E3;&#x30FC;&#x3068; oh &#x30E9;&#x30B8;&#x30AB;&#x30EB;&#x3068;&#x6D3B;&#x6027;&#x9178;&#x7D20;&#x7A2E;&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x304C;&#x3053;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3092;&#x62C5;&#x5F53;&#x3060;&#x3068;&#x7D50;&#x8AD6;&#x3065;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

DNA &#x7D50;&#x5408;&#x80FD;&#x3068;&#x904E;&#x9178;&#x5316;&#x6C34;&#x7D20;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x672C;&#x6CD5;&#x306E;&#x30DE;&#x30ED;&#x30F3;&#x9178;&#x3068;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA; &#x30EA;&#x30AC;&#x30F3;&#x30C9;&#x3068;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30F3;&#x5316; 2-&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE;-4-&#x30D4;&#x30B3;&#x30EA;&#x30F3;&#x306E;&#x5BFE;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; cu(ii)&#xC758; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC18D;&#xC131;, &#xC989;, [Cu(mal)(2)](picH) (2).2H (2) O (mal)(2) malonic &#xC0B0;, &#xC2DC; = = protonated 2-&#xC544;&#xBBF8;&#xB178;-4-picoline,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC870;&#xC0AC; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; DNA&#xC640; &#xD50C;&#xB77C;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xB4DC;&#xC758; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xB2E4;&#xB978; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xB9AC; &#xAE30;&#xBC95; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD761;&#xC218; &#xBC0F; &#xD615;&#xAD11; &#xBD84; &#xAD11; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xADF8; &#xB9D0;&#xD588;&#xB2E4; &#xAD6C;&#xB9AC; &#xBCF5;&#xD569; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; pUC19 &#xD50C;&#xB77C;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xB4DC;&#xC640; CT DNA x 10 (3) &#xBC0F; 4.0 x 10 (3) M(-1), 2.368&#xC758; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4; &#xAC01;&#xAC01; 10mm &#xC2DC;&#xD2B8;&#xB974;&#xC0B0; &#xC778;&#xC0B0; &#xC5FC; &#xBC84;&#xD37C;, pH 7.4 &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Spectrofluorimetric &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xAD6C;&#xB9AC; &#xBCF5;&#xD569; &#xC804;&#xC2DC; &#xBD80;&#xBD84; DNA &#xC0AC;&#xC18C;&#xD55C; groove &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC18D;&#xC131;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD80;&#xBD84; DNA &#xC724; &#xACF5;&#xAC1C;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; agarose &#xC824; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xADF8;&#xAC83; nuclease &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC804;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; H(2)O(2)&#xC758; &#xC874;&#xC7AC; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xD63C;&#xC790; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xD50C;&#xB77C;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xB4DC; DNA&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; supercoiling&#xB97C; &#xC720;&#xB3C4; &#xD55C;&#xB2E4;. DNA &#xB4F1;&#xBF08;&#xC5D0; &#xD30C;&#xC190;&#xC758; &#xC720;&#xB3C4; H(2)O(2)&#xC640; &#xAD6C;&#xB9AC; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; dna &#xBD80; &#xD654; &#xC2DC;&#xAC04; &#xB4A4;&#xC758; &#xC0C1;&#xB300; &#xB18D;&#xB3C4; &#xB530;&#xB77C; &#xB2E4;&#xB985;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAD11;&#xD559; DNA &#xC5F0;&#xAD6C;, &#xB4F1;&#xC628; &#xC801;&#xC815; &#xC5F4; &#xB7C9;, &#xACE0; &#xD761;&#xC218; &#xBD84;&#xAD11;&#xD559; &#xC6A9;&#xC735;&#xC774; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; H(2)O(2)&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xC758; nuclease &#xD65C;&#xB3D9;&#xC758; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, (1) H NMR &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB2E8;&#xC9C0;&#xC5D0;&#xC11C; Cu(II) H(2)O(2)&#xC758; &#xAC10;&#xC18C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; Cu(I) &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB85C; &#xBCC0;&#xD658; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xB2E4;&#xB978; &#xAE09;&#xC9C4;&#xC801;&#xC778; &#xCCAD;&#xC18C;&#xBD80;&#xC640; agarose &#xC824; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xB860; hydroxyl &#xB798; &#xB514; &#xCE7C;&#xC758; &#xBC18;&#xC751;&#xC131; &#xC0B0;&#xC18C; &#xC885;&#xC758; &#xC0DD;&#xC0B0; nuclease &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCC45;&#xC784;&#xC740;.

DNA&#xB294; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBC0F; &#xACFC;&#xC0B0;&#xD654; &#xC218;&#xC18C;&#xB97C; counterion&#xB85C; &#xAE30;&#xBCF8; &#xB9AC;&#xAC04;&#xB4DC; &#xBC0F; protonated 2-&#xC544;&#xBBF8;&#xB178;-4-picoline&#xB85C; &#xC18C;&#xC124; Cu(II) malonate&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C;&#xC758; nuclease &#xD65C;&#xB3D9; &#xC720;&#xB3C4;.

La propiedad de uni&oacute;n de ADN de un complejo de Cu(II), viz, [O de Cu(mal)(2)](picH) (2) .2 h (2), (mal)(2) = &aacute;cido mal&oacute;nico, picH = protonada 2-amino-4-Picolina, ha sido investigado en este estudio. La Uni&oacute;n de este complejo con el pl&aacute;smido y ADN cromos&oacute;mico se ha caracterizado por diferentes t&eacute;cnicas biof&iacute;sicas. De los estudios espectrosc&oacute;picos de absorci&oacute;n y fluorescencia, se ha observado que el complejo de cobre dijo ata fuertemente con el pl&aacute;smido pUC19 y CT ADN con una afinidad de uni&oacute;n de 2.368 x 10 (3) y 4.0 x 10 (3) M(-1), respectivamente, en tamp&oacute;n citrato fosfato de 10 mM, pH 7,4. Espectrofluor&iacute;metro estudios revelan que el complejo cobre exhibe parcial intercalaci&oacute;n de ADN as&iacute; como propiedades de enlace de surco menor de ADN parciales. En consecuencia, en el estudio de electroforesis de gel de agarosa, se ha observado que el complejo solo induce superenrollamiento de ADN pl&aacute;smido positivo mientras que en presencia de h exhibe actividad Nucleasa. La inducci&oacute;n de la fractura en la columna vertebral del ADN depende de las concentraciones relativas de h y complejo cobre seguida por el tiempo de incubaci&oacute;n con ADN. ADN &oacute;ptico fusi&oacute;n estudio, calorimetr&iacute;a isoterma de titulaci&oacute;n y espectroscopia de absorci&oacute;n se han utilizado para caracterizar la actividad Nucleasa de este complejo en presencia de h. Adem&aacute;s, (1) estudio de RMN de H indica que Cu(II) en el complejo se convierte en el estado de Cu(I) por la reducci&oacute;n de h. Por &uacute;ltimo, el estudio de electroforesis de gel de agarosa con depuradores de radicales diferentes concluye que la producci&oacute;n de especies reactivas de ox&iacute;geno y radicales hidroxilo es responsable de esta actividad Nucleasa.

Capacidad de uni&oacute;n de ADN y per&oacute;xido de hidr&oacute;geno induce actividad Nucleasa de una novela compleja con malonato de Cu(II) como el ligando primario y protonada 2-amino-4-Picolina como el contra-i&oacute;n.

&#x5728;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6A21;&#x5F0F;&#x5F62;&#x6210;&#xFF0C;&#x6D89;&#x53CA;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x968F;&#x540E;&#x7684;&#x6F14;&#x53D8;&#x6210;&#x4EBA;&#x529F;&#x80FD;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x52A8;&#x6001;&#x65F6;&#x7A7A;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x5206;&#x652F;&#x5F62;&#x6001;&#x662F;&#x7531;&#x8BE5;&#x6A21;&#x5F0F;&#x751F;&#x6210;&#x8BB8;&#x591A;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#xFF0C;&#x5728;&#x5668;&#x5B98;&#x53D1;&#x80B2;&#x673A;&#x7406;&#xFF0C;&#x5B83;&#x7531;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x9014;&#x5F84;&#x63A7;&#x5236;&#x3002;&#x4E86;&#x89E3;&#x5206;&#x5B50;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#xFF0C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x884C;&#x4E3A;&#x53CA;&#x7531;&#x6B64;&#x4EA7;&#x751F;&#x7684;&#x5F62;&#x6001;&#x53D8;&#x5316;&#x9700;&#x8981;&#x8FDB;&#x884C;&#x91CF;&#x5316;&#x548C;&#x5206;&#x7C7B;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x884C;&#x4E3A;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E2D;&#x56FD;&#x5BB6;&#x54CD;&#x5E94;&#x4E2D;&#x65AD;&#x7684;&#x5CA9;&#x77F3;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x6D8E;&#x817A;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6C34;&#x5E73;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x53D8;&#x5316;&#x7684;&#x5EFA;&#x7B51;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x56FE;&#x6765;&#x8BA1;&#x7B97;&#x6570;&#x5B66;&#x529F;&#x80FD;&#x6355;&#x83B7;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7ED3;&#x6784;&#x5C5E;&#x6027;&#x5EFA;&#x6A21;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x529F;&#x80FD;&#x88AB;&#x7528;&#x4E8E;&#x751F;&#x6210;&#x7684;&#x672A;&#x7ECF;&#x5904;&#x7406;&#x7684;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x56FE;&#x7B7E;&#x540D;&#x548C;&#x5CA9;&#x77F3;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4E2D;&#x65AD;&#x6D8E;&#x817A;&#x5668;&#x5B98;&#x5916;&#x690D;&#x4F53;&#x3002;&#x4ECE;&#x5171;&#x805A;&#x7126;&#x56FE;&#x50CF;&#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x988C;&#x4E0B;&#x817A;&#x6D8E;&#x817A;&#x5668;&#x5B98;&#x5916;&#x690D;&#x4F53;&#x7684;&#x4E0A;&#x76AE;&#x548C;&#x95F4;&#x8D28;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x88AB;&#x6807;&#x8BB0;&#x4E3A;&#xFF0C;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x6355;&#x83B7;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x5168;&#x5C40;&#x5C5E;&#x6027;&#x3001; &#x672C;&#x5730;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x5C5E;&#x6027;&#xFF0C;&#x5149;&#x8C31;&#x548C;&#x5F62;&#x6001;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7279;&#x6027;&#x7684;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7279;&#x5F81;&#x6D3E;&#x751F;&#x3002;&#x516D;&#x4E2A;&#x7279;&#x5F81;&#x9009;&#x62E9;&#x7B97;&#x6CD5;&#x548C;&#x591A;&#x8DEF;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x5EFA;&#x6A21;&#x8FDB;&#x884C;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x56FE;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x552F;&#x4E00;&#x5730;&#x5206;&#x7C7B;&#x5E76;&#x533A;&#x5206;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7FA4;&#x4F53;&#x7684;&#x4E0D;&#x540C;&#x5B50;&#x96C6;&#x3002;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x56FE;&#x5206;&#x6790;&#x5206;&#x7C7B;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x56FD;&#x5BB6;&#x4E2D;&#x662F;&#x6700;&#x6709;&#x6548;&#x3002;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x7531;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x56FE;&#x5F62;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x5B50;&#x96C6;&#x5B9A;&#x4E49;&#x90FD;&#x4E0A;&#x76AE;&#x548C;&#x95F4;&#x8D28;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x548C;&#x6CA1;&#x6709;&#x5CA9;&#x6291;&#x5236;&#x5242;&#x7684;&#x60C5;&#x51B5;&#x4E0B;&#x5728;&#x6570;&#x91CF;&#x4E0A;&#x4E0D;&#x540C;&#x3002;&#x5F20;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6700;&#x53D7;&#x5230;&#x6291;&#x5236;&#x7684;&#x5CA9;&#x77F3;&#x4FE1;&#x53F7;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E0E;&#x6B64;&#x4E0D;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x5728;&#x4EE5;&#x524D;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x95F4;&#x5145;&#x8D28;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x53D1;&#x751F;&#x91CD;&#x5927;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x663E;&#x793A;&#x4E86;&#x5982;&#x4F55;&#x5B9A;&#x4E49;&#x548C;&#x8BA1;&#x7B97;&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x96C6;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x6709;&#x6548;&#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x5E76;&#x91CF;&#x5316;&#x591A;&#x751F;&#x7269;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x7684;&#x66F4;&#x6539;&#xFF0C;&#x5E76;&#x533A;&#x5206;&#x4E0D;&#x540C;&#x56FD;&#x5BB6;&#x5728;&#x53D1;&#x5C55;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;

&#x591A;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x7279;&#x5F81;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x553E;&#x6DB2;&#x817A;&#x5206;&#x652F;&#x5F62;&#x6001;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;

Pattern formation in developing tissues involves dynamic spatio-temporal changes in cellular organization and subsequent evolution of functional adult structures. Branching morphogenesis is a developmental mechanism by which patterns are generated in many developing organs, which is controlled by underlying molecular pathways. Understanding the relationship between molecular signaling, cellular behavior and resulting morphological change requires quantification and categorization of the cellular behavior. In this study, tissue-level and cellular changes in developing salivary gland in response to disruption of ROCK-mediated signaling by are modeled by building cell-graphs to compute mathematical features capturing structural properties at multiple scales. These features were used to generate multiscale cell-graph signatures of untreated and ROCK signaling disrupted salivary gland organ explants. From confocal images of mouse submandibular salivary gland organ explants in which epithelial and mesenchymal nuclei were marked, a multiscale feature set capturing global structural properties, local structural properties, spectral, and morphological properties of the tissues was derived. Six feature selection algorithms and multiway modeling of the data was performed to identify distinct subsets of cell graph features that can uniquely classify and differentiate between different cell populations. Multiscale cell-graph analysis was most effective in classification of the tissue state. Cellular and tissue organization, as defined by a multiscale subset of cell-graph features, are both quantitatively distinct in epithelial and mesenchymal cell types both in the presence and absence of ROCK inhibitors. Whereas tensor analysis demonstrate that epithelial tissue was affected the most by inhibition of ROCK signaling, significant multiscale changes in mesenchymal tissue organization were identified with this analysis that were not identified in previous biological studies. We here show how to define and calculate a multiscale feature set as an effective computational approach to identify and quantify changes at multiple biological scales and to distinguish between different states in developing tissues.

Multiscale feature analysis of salivary gland branching morphogenesis.

Formation du patron dans le d&eacute;veloppement de tissus implique des changements dynamiques spatio-temporelles dans l&#39;organisation cellulaire et l&#39;&eacute;volution ult&eacute;rieure de structures fonctionnelles de l&#39;adultes. Ramification de la morphogen&egrave;se est un m&eacute;canisme de perfectionnement par laquelle les patrons sont g&eacute;n&eacute;r&eacute;s dans de nombreux organes en voie de d&eacute;veloppement, qui est contr&ocirc;l&eacute; par des voies mol&eacute;culaires sous-jacents. Comprendre la relation entre la signalisation mol&eacute;culaire, comportement cellulaire et les changements morphologiques qui en r&eacute;sulte n&eacute;cessite la quantification et la cat&eacute;gorisation du comportement cellulaire. Dans cette &eacute;tude, des changements dans le d&eacute;veloppement des glandes salivaires en r&eacute;ponse &agrave; la perturbation de la signalisation m&eacute;di&eacute;e par ROCK de niveau tissulaire et cellulaires sont mod&eacute;lis&eacute;s par b&acirc;timent cellulaire-graphiques pour calculer les caract&eacute;ristiques math&eacute;matiques, capturant des propri&eacute;t&eacute;s structurelles &agrave; plusieurs &eacute;chelles. Ces fonctionnalit&eacute;s ont &eacute;t&eacute; utilis&eacute;es pour g&eacute;n&eacute;rer des signatures multi-&eacute;chelles cellule-graphique de non trait&eacute;es et ROCK signalisation perturb&eacute;e explants d&#39;orgue de glande salivaire. Des images confocales de souris des glandes salivaires submandibulaires orgue des explants dans lequel &eacute;pith&eacute;liales et m&eacute;senchymateuses noyaux ont &eacute;t&eacute; marqu&eacute;es, une fonctionnalit&eacute; multi-&eacute;chelles capturant des propri&eacute;t&eacute;s structurelles globales, les propri&eacute;t&eacute;s structurales locales, spectrales et les propri&eacute;t&eacute;s morphologiques des tissus a &eacute;t&eacute; d&eacute;riv&eacute;e. Six disposent d&#39;algorithmes de s&eacute;lection et multiway mod&eacute;lisation des donn&eacute;es a &eacute;t&eacute; r&eacute;alis&eacute;e afin d&#39;identifier les sous-ensembles distincts de caract&eacute;ristiques de graphique des cellules qui peuvent particuli&egrave;rement bien classer et distinguer les diff&eacute;rentes populations cellulaires. Analyse multi-&eacute;chelle cellule-graph a &eacute;t&eacute; plus efficace dans la classification de l&#39;&eacute;tat des tissus. Organisation cellulaire et tissulaire, telle que d&eacute;finie par un sous-ensemble multi-&eacute;chelles des caract&eacute;ristiques de la cellule-graph, sont &agrave; la fois quantitativement distincts dans les cellules &eacute;pith&eacute;liales et m&eacute;senchymateuses en pr&eacute;sence et en absence d&#39;inhibiteurs de la roche. Consid&eacute;rant que l&#39;analyse tensorielle d&eacute;montrent que le tissu &eacute;pith&eacute;lial &eacute;tait affect&eacute; le plus par l&#39;inhibition de la signalisation de la roche, multi-&eacute;chelles des changements significatifs dans l&#39;organisation tissulaire m&eacute;senchymateuse cette analyse qui ne figuraient pas dans les pr&eacute;c&eacute;dentes &eacute;tudes biologiques ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s. Nous montrons ici comment d&eacute;finir et calculer une fonction multi-&eacute;chelles, d&eacute;fini comme une approche algorithmique efficace pour identifier et quantifier les changements &agrave; plusieurs &eacute;chelles biologiques et d&#39;&eacute;tablir une distinction entre les diff&eacute;rents &Eacute;tats dans le d&eacute;veloppement des tissus.

Analyse multi-&eacute;chelle de la morphog&eacute;n&egrave;se de ramification des glandes salivaires.

Musterbildung in der Entwicklung von Gewebe umfasst dynamische r&auml;umlich-zeitliche &Auml;nderungen in zellul&auml;re Organisation und sp&auml;tere Entwicklung der funktionalen Erwachsenen Strukturen. Verzweigung Morphogenese ist ein Entwicklungsst&ouml;rungen Mechanismus, die durch den Muster generiert werden, in vielen Entwicklungsl&auml;ndern Organe, die von zugrunde liegenden molekularen Wege kontrolliert wird. Verst&auml;ndnis der Beziehung zwischen molekularen Signalisierung, erfordert zellul&auml;re Verhalten und die daraus resultierenden morphologischen Ver&auml;nderungen, Quantifizierung und Kategorisierung des zellul&auml;ren Verhaltens. In dieser Studie werden Gewebe-Ebene und zellul&auml;re Ver&auml;nderungen bei der Entwicklung der Speicheldr&uuml;se als Reaktion auf St&ouml;rungen des ROCK-vermittelte Signalisierung durch modelliert, durch den Aufbau der Zelle-Diagramme um mathematische Funktionen Erfassung der strukturelle Eigenschaften in mehreren Ma&szlig;st&auml;ben zu berechnen. Diese Features wurden zum Generieren von Multiskalen Zelle-Graph Signaturen von unbehandelten und ROCK Signalisierung st&ouml;rten Speicheldr&uuml;se Orgel Explantaten. Konfokale Bilder der Maus submandibular Speicheldr&uuml;se explants Orgel in dem epitheliale und Mesenchymale Kerne waren gepr&auml;gt, ein Multiskalen Featureumfang globalen strukturellen Eigenschaften, lokalen strukturellen Eigenschaften, spektrale, und morphologischen Eigenschaften der Gewebe abgeleitet wurde. Sechs verf&uuml;gen &uuml;ber Auswahl-Algorithmen und Mehrwege-Modellierung der Daten wurde durchgef&uuml;hrt, um unterschiedliche Teilmengen der Zelle Graph-KEs zu identifizieren, die eindeutig klassifizieren und andere Zelle Populationen unterscheiden k&ouml;nnen. Multiskalen-Zelle-Graph-Analyse war der Klassifikation von den Gewebe-Zustand am effektivsten. Mobiltelefone, Gewebe-Organisation, definiert durch eine Multiskalen Teilmenge der Zelle-Graph-KEs, sowohl quantitativ unterschiedliche in epitheliale und Mesenchymale Zelltypen sowohl in der Anwesenheit und Abwesenheit von ROCK-Inhibitoren sind. W&auml;hrend die Tensoranalysis zu demonstrieren, dass die meisten durch Hemmung der ROCK Signalisierung Epithelgewebe betroffen war, wurden Multiskalen Ver&auml;nderungen mesenchymaler Gewebe Organisation identifiziert, mit dieser Analyse, die nicht in den vorhergehenden biologischen Studien identifiziert wurden. Hier zeigen wir wie Sie definieren und berechnen eine Multiskalen Featuregruppe wie ein wirksamer computational Ansatz zur Identifizierung und Quantifizierung von Ver&auml;nderungen in mehreren biologischen Ma&szlig;st&auml;ben und zwischen verschiedenen Staaten bei der Entwicklung von Gewebe zu unterscheiden.

Multiskalen-Funktion Analyse der Speicheldr&uuml;se Verzweigung Morphogenese.

Formazione modello nello sviluppo di tessuti comporta cambiamenti dinamici spazio-temporale nell&#39;organizzazione cellulare e la successiva evoluzione delle strutture funzionali degli adulti. Morfogenesi di ramificazione sono un meccanismo dello sviluppo da cui modelli sono generati in molti organi in via di sviluppo, che &egrave; controllato dalla sottostante pathways molecolari. Comprendere il rapporto tra segnalazione molecolare, comportamento cellulare e conseguente cambiamento morfologico richiede quantificazione e classificazione del comportamento cellulare. In questo studio, cambiamenti a livello di tessuto e cellulari nello sviluppo delle ghiandole salivari in risposta all&#39;interruzione di ROCK-mediata segnalazione da sono modellati con la costruzione di celle-grafici per calcolare funzioni matematiche acquisizione propriet&agrave; strutturali a scale multiple. Queste caratteristiche sono state utilizzate per generare firme multiscala cella-grafico di non trattata e ROCK segnalazione perturbato espianti di organo delle ghiandole salivari. Dalle immagini confocal di ghiandola salivare sottomandibolare mouse organo explants in cui epiteliali e mesenchimali nuclei furono segnati, una caratteristica multiscala imposta acquisizione propriet&agrave; strutturali globali e locali propriet&agrave; strutturali, spettrale, propriet&agrave; morfologiche dei tessuti &egrave; stata derivata. Sei dispongono di algoritmi di selezione e multiway modellazione dei dati &egrave; stata eseguita per identificare distinti sottoinsiemi di caratteristiche del grafico di cella che univocamente possono classificare e distinguere tra popolazioni differenti delle cellule. Analisi multiscala cella-grafico &egrave; stato pi&ugrave; efficace nella classificazione dello stato dei tessuti. Organizzazione cellulare e dei tessuti, come definito da un sottoinsieme multiscala delle caratteristiche delle cellule-grafico, sono entrambi quantitativamente distinti in tipi di cellule epiteliali e mesenchimali sia in presenza e in assenza di inibitori della roccia. Considerando che l&#39;analisi tensoriale dimostrare che tessuto epiteliale &egrave; stato influenzato pi&ugrave; da inibizione della roccia di segnalazione, significativi cambiamenti multiscala nell&#39;organizzazione dei tessuti mesenchimali sono stati identificati con questa analisi che non sono stati individuati in precedenti studi biologici. Mostriamo qui come definire e calcolare una caratteristica multiscala impostato come un efficace approccio computazionale per identificare e quantificare i cambiamenti a pi&ugrave; scale di biologiche e di distinguere tra diversi stati in via di sviluppo dei tessuti.

Analisi multiscala caratteristica della morfogenesi di ramificazione delle ghiandole salivari.

&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E5;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3067;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x5F62;&#x6210;&#x7D30;&#x80DE;&#x7D44;&#x7E54;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A;&#x5927;&#x4EBA;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x3067;&#x52D5;&#x7684;&#x306E;&#x6642;&#x7A7A;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x4F34;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5206;&#x679D;&#x5F62;&#x614B;&#x5F62;&#x6210;&#x57FA;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5236;&#x5FA1;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x306F;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x767A;&#x5C55;&#x9014;&#x4E0A;&#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x306B;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x306E;&#x767A;&#x9054;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x5FC5;&#x8981;&#x5206;&#x5B50;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x306E;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x6319;&#x52D5;&#x3068;&#x7D50;&#x679C;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x5F62;&#x614B;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6319;&#x52D5;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;, &#x553E;&#x6DB2;&#x817A;&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5CA9;&#x3092;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x306E;&#x4E2D;&#x65AD;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3001;&#x7D44;&#x7E54;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x30AD;&#x30E3;&#x30D7;&#x30C1;&#x30E3;&#x3059;&#x308B;&#x6570;&#x5B66;&#x7684;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x8A08;&#x7B97;&#x3059;&#x308B;&#x30BB;&#x30EB; 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&#xC870;&#xC9C1; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0; &#xD328;&#xD134; &#xD615;&#xC131; &#xC138;&#xD3EC; &#xC870;&#xC9C1;&#xACFC; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC131;&#xC778; &#xAD6C;&#xC870;&#xC758; &#xC774;&#xD6C4;&#xC758; &#xC9C4;&#xD654;&#xC758; &#xB3D9;&#xC801; spatio &#xC2DC;&#xAC04;&#xC801; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xAE30; morphogenesis &#xB0B4;&#xBD80; &#xBD84;&#xC790; &#xACBD;&#xB85C; &#xC758;&#xD574; &#xC81C;&#xC5B4; &#xB418;&#xB294; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC5D0; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xC790; &#xC2E0;&#xD638; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xC774;&#xD574;, &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xD589;&#xB3D9;&#xACFC; &#xACB0;&#xACFC; &#xD615;&#xD0DC;&#xD559; &#xBCC0;&#xD654; &#xD544;&#xC694; &#xC815;&#xB7C9;&#xD654; &#xBC0F; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xB3D9;&#xC791;&#xC758; &#xBD84;&#xB958;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558; &#xC5EC; &#xC2E0;&#xD638; &#xBC14;&#xC704; &#xC911;&#xC7AC;&#xC758; &#xC911;&#xB2E8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC73C;&#xB85C; &#xCE68; &#xC0D8;&#xC5D0; &#xC870;&#xC9C1; &#xC218;&#xC900; &#xBC0F; &#xC138;&#xD3EC; &#xBCC0;&#xD654; &#xC218;&#xD559; &#xAE30;&#xB2A5; &#xCEA1;&#xCC98; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC2A4;&#xCF00;&#xC77C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD6C;&#xC870; &#xC18D;&#xC131; &#xACC4;&#xC0B0; &#xC140;-&#xADF8;&#xB798;&#xD504;&#xB97C; &#xC791;&#xC131; &#xD558; &#xC5EC; &#xBAA8;&#xB378;&#xB9C1; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAE30;&#xB2A5; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC758; &#xC11C;&#xBA85;&#xC744; multiscale &#xC140; &#xADF8;&#xB798;&#xD504;&#xB97C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBC0F; &#xCE68; &#xC0D8; &#xAE30;&#xAD00; explants &#xC911;&#xB2E8; &#xB85D; &#xC2E0;&#xD638;. Confocal &#xC774;&#xBBF8;&#xC9C0; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; submandibular &#xCE68; &#xC0D8;&#xC758; &#xC7A5;&#xAE30;&#xB294; &#xC0C1;&#xD53C; explants &#xC5FD; &#xD575;&#xC73C;&#xB85C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB41C;, &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xAD6C;&#xC870; &#xC18D;&#xC131;, &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;, &#xC9C0;&#xC5ED; &#xAD6C;&#xC870; &#xC18D;&#xC131; &#xBC0F; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xD615;&#xD0DC;&#xD559; &#xC18D;&#xC131; &#xCEA1;&#xCC98; &#xC124;&#xC815; multiscale &#xAE30;&#xB2A5; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C;. 6 &#xC120;&#xD0DD; &#xC54C;&#xACE0;&#xB9AC;&#xC998; &#xAE30;&#xB2A5;&#xACFC; multiway &#xBAA8;&#xB378;&#xB9C1; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC758; &#xC140; &#xADF8;&#xB798;&#xD504; &#xAE30;&#xB2A5; &#xACE0;&#xC720; &#xD558; &#xAC8C; &#xBD84;&#xB958; &#xD558; &#xACE0; &#xB2E4;&#xB978; &#xC138;&#xD3EC; &#xC778;&#xAD6C;&#xB97C; &#xAD6C;&#xBD84;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC218;&#xD589; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. Multiscale &#xC140; &#xADF8;&#xB798;&#xD504; &#xBD84;&#xC11D; &#xC870;&#xC9C1; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC758; &#xBD84;&#xB958;&#xC5D0; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801; &#xC774;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC138;&#xD3EC;&#xC640; &#xC870;&#xC9C1; &#xC870;&#xC9C1;, &#xC140; &#xADF8;&#xB798;&#xD504; &#xAE30;&#xB2A5; multiscale &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC815;&#xC758; &#xB41C; &#xB300;&#xB85C; &#xC0C1;&#xD53C;&#xC640; &#xC911;&#xAC04; &#xC5FD; &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xD615; &#xBAA8;&#xB450; &#xC874;&#xC7AC;&#xC640; &#xB77D; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC81C;&#xC758; &#xBD80;&#xC7AC;&#xC5D0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB69C;&#xB837;&#xD55C; &#xC591;&#xC801; &#xBAA8;&#xB450; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD150;&#xC11C; &#xBD84;&#xC11D; &#xC124;&#xBA85; &#xC0C1;&#xD53C; &#xC870;&#xC9C1; &#xB85D; &#xC2E0;&#xD638;&#xC758; &#xC800;&#xD574;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xD588;&#xB2E4;, &#xBC18;&#xBA74; &#xC911;&#xAC04; &#xC5FD; &#xC870;&#xC9C1; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; multiscale &#xBCC0;&#xD654; &#xD558;&#xC9C0; &#xC774;&#xC804; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD655;&#xC778; &#xB41C;&#xC774; &#xBD84;&#xC11D;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC5EC;&#xAE30; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; multiscale &#xAE30;&#xB2A5; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xCD95;&#xCC99; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xACC4;&#xB7C9; &#xD558; &#xACE0; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xAD6C;&#xBD84; &#xD558;&#xB294; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC778; &#xC804;&#xC0B0; &#xC811;&#xADFC; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xACC4;&#xC0B0; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xCE68; &#xC0D8; &#xBD84;&#xAE30; morphogenesis multiscale &#xAE30;&#xB2A5; &#xBD84;&#xC11D;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Formaci&oacute;n de patrones en el desarrollo de los tejidos implica cambios din&aacute;micos spatio-temporales en la organizaci&oacute;n celular y la posterior evoluci&oacute;n de estructuras funcionales del adultas. Ramificaci&oacute;n de la morfog&eacute;nesis es un mecanismo del desarrollo por el cual se generan patrones en muchos &oacute;rganos en desarrollo, que es controlado por v&iacute;as moleculares subyacentes. Entender la relaci&oacute;n entre la se&ntilde;alizaci&oacute;n molecular, comportamiento celular y cambio morfol&oacute;gico requiere cuantificaci&oacute;n y categorizaci&oacute;n del comportamiento celular. En este estudio, cambios celulares y de tejidos en el desarrollo de la gl&aacute;ndula salival en respuesta a la interrupci&oacute;n de la roca-mediada se&ntilde;alizaci&oacute;n por se modelan mediante la construcci&oacute;n de gr&aacute;ficos de celular para calcular funciones matem&aacute;ticas captura propiedades estructurales a m&uacute;ltiples escalas. Estas caracter&iacute;sticas fueron utilizadas para generar firmas multiescala celular-gr&aacute;fico de no tratada y se&ntilde;alizaci&oacute;n de roca interrumpi&oacute; explantes de &oacute;rgano de la gl&aacute;ndula salival. De im&aacute;genes confocales de rat&oacute;n de la gl&aacute;ndula salival submaxilar &oacute;rgano explantes en que epitelial y mesenquimales n&uacute;cleos fueron marcados, se deriv&oacute; una caracter&iacute;stica multiescala establecer propiedades estructurales globales, locales propiedades estructurales, espectrales, y propiedades morfol&oacute;gicas de los tejidos. Seis cuentan con algoritmos de selecci&oacute;n y multiway modelado de los datos fue realizada para identificar distintos subconjuntos de caracter&iacute;sticas de gr&aacute;fico de la c&eacute;lula que &uacute;nicamente pueden clasificar y distinguir entre diferentes poblaciones celulares. An&aacute;lisis multiescalar celular-gr&aacute;fico fue m&aacute;s efectivo en la clasificaci&oacute;n del estado del tejido. Organizaci&oacute;n celular y tejido, seg&uacute;n lo definido por un subconjunto multiescala de caracter&iacute;sticas de la c&eacute;lula-gr&aacute;fico, son cuantitativamente distintos en tipos de c&eacute;lulas epiteliales y mesenquimales tanto en presencia y ausencia de inhibidores de la roca. Mientras que an&aacute;lisis tensorial demuestran que el tejido epitelial fue afectado m&aacute;s por inhibici&oacute;n de la se&ntilde;alizaci&oacute;n de la roca, cambios significativos multiescala en organizaci&oacute;n de tejido mesenquimal se identificaron con este an&aacute;lisis que no fueron identificados en estudios anteriores de la biolog&iacute;a. Aqu&iacute; mostramos c&oacute;mo definir y calcular una caracter&iacute;stica multiescala configurar como un enfoque computacional eficaz para identificar y cuantificar los cambios en m&uacute;ltiples escalas biol&oacute;gicas y distinguir entre diferentes Estados de desarrollo de los tejidos.

Shayoni Ray

Department of Biological Sciences

University at Albany, SUNY

Genetic Modification and Recombination of Salivary Gland Organ Cultures