系统发育树有多种形式。重要的是生物体从树的底部到顶部排列的顺序，但是树枝可以在它们的节点处旋转而不改变信息。连接各个节点的线可以是直的，有角度的，甚至是弯曲的。
分支的长度可以描述生物之间的时间或相对变化量。例如，分支长度可能表示系统发育树下序列中氨基酸的变化数量。确切的含义必须在系统发生树的一个图例上清楚地显示出来。如果没有这样的图例，则分支长度是任意的，读者不应推断任何信息。
树可能有根，也可能没有根。如果所有兴趣有机体的最新共同祖先未知，则该树不会被拔出。在本例中，系统发育关系的描述类似于雪花，而不是树。科学家可以在分析中加入一个外群体，从而使这棵树生根。外群是一种与科学家希望在树上排列的任何有机体都不密切相关的有机体。
版权所属 © 2025 MyJoVE 公司版权所有，本公司不涉及任何医疗业务和医疗服务。