首先,使用 Cytation 5 活细胞成像系统对荧光标记的 PDO 进行成像。然后,启动 Gen5 软件。导航到“实验”,然后单击“任务管理器”中的“打开”。
打开所需的实验,然后选择“平板”,然后在工具栏中选择“查看”。然后,将数据下拉菜单切换到 Z 投影。双击所选孔。
选择“分析”。点击,我想设置一个新的图像分析数据缩减步骤,点击 OK.In 分析设置,将类型设置为蜂窝分析,将检测通道设置为Z投影转换的TSF明场。单击“选项”以打开主掩码和计数页面。
在阈值框中选中自动,然后单击“确定”关闭弹出窗口。在“对象选择”(Object Selection) 下,定义最小和最大对象大小以过滤掉细胞碎片或单个细胞,然后根据需要选择其他要素。接下来,单击“应用”,掩码对象将突出显示。
要在细胞分析工具栏中设置子群体分析,请单击计算指标。然后,单击右下角的“选择或创建感兴趣的对象级指标”。从可用的对象指标中,选择所需的指标,例如循环度,然后单击插入。
单击“确定”进行确认。接下来,在细胞分析工具栏中选择亚群分析,然后单击添加以创建新的亚群。输入子群体的名称。
在对象指标中,单击添加条件以添加所选指标。在“编辑条件”窗口中输入所需的参数,然后单击“确定”。在窗口底部的表格中选择所需的结果,然后单击“确定”,然后单击“应用”。在“对象详细信息”(Object Details) 下,选择要查看遮罩的指定子群体。
如果满意,请单击“细胞分析”窗口中的“确定”,然后单击“添加步骤”将分析应用于所有孔。