1 首先， 2 打开中医系统 3 药理学数据库。4 使用化学名称搜索框 5 搜索所选成分名称 6 以 Mol2 格式下载相应的 3D 结构文件 7。8 要下载关键靶标的晶体结构，9 打开 RCSB Protein 数据库。
10 在搜索框中，11 搜索目标名称 12 并下载相应的 13 个 PDB 格式的晶体结构文件。14 在分析软件中导入成分和目标结构文件 15。16 单击 Edit（编辑），然后单击 Delete Water（删除水）以删除水分子。
17 要添加氢，请单击 Edit（编辑）、Hydrogens（氢）和 Add（添加）。18 将成分设置为配体。19 选择整个靶点作为受体 20 并进行盲对接。
21 为了确定分子对接的范围，22 依次选择受体和配体。23 单击 Grid，然后单击 Grid Box，调整网格框 24 以包含整个模型。25 单击 File and Close 保存当前网格框状态 26 并以 GPF 格式保存文件。
27 现在单击 Run 和 Run Auto Grid Four，28 单击 Parameter File Name，然后浏览，29 选择 GFP 文件。30 然后单击 Launch 按钮。31 对于分子对接，32 打开自动文档 4 并点击对接，Macromolecule，33 并设置刚性文件名以选择受体。
34 然后点击 Docking（对接）、Ligand and open（配体并打开）、35 或选择选择配体。36 现在单击 Docking 37 和 Search Parameters 来设置操作算法。38 然后单击 Docking 和 Docking Parameters 39 设置停靠参数。
40 选择 DPF 文件，然后单击启动按钮。41 以 DPF 格式存储文件。42 单击分析、停靠、43 并打开以选择 DLG 文件。
44 然后单击 Analyze 和 Macromolecule 45 打开受体。46 现在点击 Analyze， Confirmations， and Play， 47 按能量排名来分析结果。48 最后，单击 Set Play， 49 并写入 complex 以将结果保存为 PDBQT 格式。
50 将对接文件导入 PyMOLE，51 然后选择配体并单击操作、查找、52 极化合约和其他原子和对象 53 以显示配体 54 与外部环境之间的氢键。55 单击单个字母 C 更改颜色。56 单击操作并提取对象。
57 单击显示，然后单击棒，58 显示受体的棒状结构，59 确定连接到配体 60 的残差并显示棒状结构。61 然后单击向导和测量 62 并依次单击两个原子。63 单击标签，然后单击残留物，以显示残留物的标签。
64 如有必要，调整背景颜色和透明度。65 最后，点击 文件， 然后 将图像导出为 66 保存图片。67 在特应性皮炎组中，68 GEO 数据库分析显示 P-P-A-R-G、E-G-F-R、T-N-F 70 和 P-T-P-R-C MMP 9、MAPK 14、71 和 CASP Three 的上调 69 下调。
72 对接分析证实了活性 SDG 成分 74 和潜在靶蛋白 75 之间的相互作用 75 表明它们在肛门湿疹治疗中的重要作用。76 靛蓝和小檗红素表现出很强的结合活性 77，每摩尔能量不到负 5 公斤卡路里，78 强调了它们的治疗潜力。
