首先,在台式计算机上启动数据分析软件。单击文件,然后单击浏览器,然后选择选择文件夹以打开包含采集的成像数据的文件夹。选择与所选图像相关的多行,包括未感染的控件,并排除过饱和图像。
在实验室笔记本中记下映像 ID 以及在第二次映像会话期间注册的信息。单击 Load as group 以组合所选图像。现在单击保存图标,将新的序列图像保存在新文件夹中,以便在需要时重新分析原始数据。
接下来,单击选项,然后单击显示,然后选择分箱因子以识别用于每张图像的分箱。获取的像素合并因子将显示在序列中每张图像的顶部。要将所有像素合并因子校正为相同的值,首先,双击要调整的图像。
在 tool pal 窗口中,单击图像调整选项,然后选择合适的像素合并因子。双击未感染的小鼠图像,然后在 unit 字段中选择选项 counts。将色阶调整为最小值 600。
在 units 字段中选择辐射度选项,以查看结果图像的辐射度。在序列窗口处于活动状态时,在 units 字段中选择选项 radiance 。禁用色阶限制区域中的单个框,以调整工具调色板中的色阶和颜色表。
标记对数刻度和手动框,然后根据未感染的对照设置最大刻度数字,并将信号最高的区域设置为最大值。为所有图像设置相同的比例后,双击每个图像,最大化窗口,然后使用导出图形选项以图像格式导出图像视图。按处理命名文件,然后是小鼠 ID 和时间点。
双击序列中的图像。在工具调色板窗口中,单击 ROI 工具部分,然后按方形图标。在整个鼠标上绘制一个矩形。
单击创建的 ROI 的边框,然后为每个鼠标复制并粘贴相同的 ROI。接下来,命名要记录的 ROI。然后单击 ROI 工具部分中的保存图标。
选中 apply to sequence 复选框。然后通过单击加载为所有图像应用保存的 ROI。调整每个鼠标的 ROI 位置,使其更好地适合测量区域。
标记完所有鼠标后,单击 measure ROIs 选项。此时应显示 ROI 度量表。将测量类型设置为辐射度,将图像属性设置为所有可能的值,将 ROI 维度设置为厘米。
然后点击 全选 选项,然后是 复制.将数据直接粘贴到表格分析软件中。组织数据列以正确排序组。
接下来,在电子表格中按组对数据进行颜色编码。排列总通量值以匹配同一小鼠的腹侧和背侧总通量值。然后将它们相加以获得每只小鼠的全身生物发光。
计算每组的求和值的均值和标准差。将数据绘制到统计软件中以生成图表。最后,创建一个带有生物发光图像的面板。
将每只小鼠放在列中,将时间点放在行中,以构建药物功效矩阵。当应用生物发光方法评估抗寄生虫剂时,构建药物功效矩阵以比较测试化合物,此处以泊沙康唑与用于美洲锥虫病的标准药物治疗苄硝唑(每公斤 100 毫克)为例,每天给药一次。在这项纵向研究中,通过将未治疗组与治疗组进行比较来说明感染时间过程。
结果表明,生物发光减少表明寄生虫负荷减少,或者寄生虫负荷增加和随之而来的光检测表明复发,表明化合物或治疗方案无效。量化的光由每秒光子数的腹侧和背侧总通量之和表示,作为感染时间的函数。