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02:31 min
November 8th, 2024
DOI :
10.3791/201910-v
副本
首先,在冰上解冻分离的恒河猴胰岛组织。向组织沉淀中加入 500 μL 0.1X 裂解缓冲液。使用一次性无 RNase 的沉淀杵,在冰上轻轻匀浆组织 15 次。
将样品在冰上孵育 10 分钟。然后,向匀浆中加入 500 微升洗涤缓冲液,并在冰上用移液管轻轻混合。用 300 毫升洗涤缓冲液灌注 30 微米的预分离过滤器,然后将 1 毫升细胞匀浆过滤到 5 毫升的试管中。
将过滤后的匀浆在 4 摄氏度的水平桶离心机中以 500 g 离心 5 分钟。使用移液管将 1 毫升上清液转移到冰上的冷冻管中,并立即将其冷冻在零下 80 摄氏度以备将来的代谢组学实验。向细胞核沉淀中滴加 1 毫升洗涤缓冲液以重悬。
将洗涤后的颗粒在 4 摄氏度的水平桶离心机中以 1, 000 g 离心 5 分钟。重复洗涤后,将细胞核重悬于 1 mL 洗涤缓冲液中。用移液管将细胞核悬液和 0.4% 台盼蓝各 10 微升混合在一个单独的试管中,然后将混合物添加到自动细胞计数载玻片中。
最后,使用细胞计数仪测定细胞核浓度。获得理想的完整细胞核用于测序实验。基于基因表达研究,获得了离体胎儿、非人灵长类动物胰岛内细胞亚型的 UMAP 聚类。
胰岛代谢物丰度,如磷酸二羟基丙酮、3-磷酸甘油、2-氧代戊二酸、肌酸和谷胱甘肽是使用胞质组分获得的。
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从 RNA 到代谢物:非人灵长类动物胎胰岛的多组学分析
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