执行高分辨率磁共振成像后，使用 dcm2niix 工具将 T1 加权、T2 加权和零时间回波 DICOM 扫描文件从 DICOM 转换为 NIfTI 格式。使用 SimNIBS Charm 工具，执行共配准和组织掩码提取。接下来，打开 Brainsight。
单击 New Empty Project，并加载参与者的 T1 加权 NIfTI 图像。单击 Reconstructions 选项卡，然后单击 New Reconstruction 下拉菜单。单击 Skin （皮肤），然后在新窗口中单击 Compute Skin （计算皮肤）。
完成后，点击 关闭 窗口左上角的按钮。在 Reconstructions 选项卡中，单击 New Reconstruction 下拉菜单，然后单击 Full Brain Curvilinear。现在通过拖动绿色框的边缘来紧紧包围大脑，从而调整绿色框在矢状面、冠状面和横向平面上的位置。
滚动浏览所有切片以确保没有组织边缘重叠。单击 Compute Curvilinear，然后将剥离深度调整为 4 毫米。然后点击 地标 标签 在 Brainsight 上，然后点击 配置地标.
将十字线放在鼻尖上，然后在名称字段中标记地标 Nose。然后将十字准线放在鼻梁上方的眼睛之间，并标记地标 Nasion。接下来，将十字准线放在左耳上，并标记地标 L Ear。
然后将十字准线放在右耳上，并标记地标 R Ear。然后，单击 目标 选项卡，然后单击 配置目标.将十字准线放在所需目标的位置，并使用屏幕右侧的角度切换来设置轨迹角度。
选择所需的目标和轨迹后，单击新的下拉菜单并选择 轨迹.要命名目标，请在 name 旁边的文本框中键入。单击 Export 以导出目标，并将其保存在相应的主题文件夹中。
打开 BabelBrain，然后选择声学和热仿真所需的文件。要选择之前从 Brainsite 导出的文本文件，请单击 Select Trajectory，然后选择适当的参与者文件。单击选择 SimNIBS，选择之前创建的 SimNIBS 文件。
单击 Select T1W ，然后选择生成并之前用于目标和轨迹映射的 T1 加权图像。现在，选择 Real CT for CT scans（真实 CT）、CTE for CTE scans（CTE 扫描）或 no（否）以使用超级按钮工具生成的简化蒙版。使用 CT 或 CTE 图像时，单击 Coreg 下拉菜单，然后单击 CT to MR。单击 Select，然后从相应的参与者文件中选择相应的图像。
单击 Select Thermal Profile（选择热配置文件），然后选择热配置文件，该文件根据持续时间开启、持续时间关闭和占空比来描述实验超声处理参数。然后单击旁边的下拉菜单 传感器，然后选择用于实验的传感器。单击计算后端旁边的下拉菜单，然后选择运行模拟的计算机的计算后端。
输入所有信息后，单击 Continue （继续） 以完成其余的模拟。现在选择换能器的超声频率和每个波长的适当点。单击 Calculate Planning Mask。
检查图像以确保准确识别皮肤、头骨和大脑的边界。对于声学仿真，请单击 Step 2 AC Sim 选项卡以打开。通过键入适当的距离来调整从圆锥体到焦点的距离。
要执行模拟，请单击 Calculate Fields 按钮。调整 ZSteering 值，使十字光标位于焦点的中心。按向上或向下箭头或手动输入所需的值。
然后单击 Calculate Fields。对于热仿真，请单击 Step 3 Thermal Sim 选项卡，然后单击 Calculate Thermal Fields。
