要开始疾病相关基因合并,请从包含草药名称、成分 ID、基因 ID 和脚本 Disease 的五个数据库中放置先前保存的 TXT 文件。R 在同一文件夹中。打开 R 代码。
将存储 TXT 文件的路径复制并粘贴到 R 代码中 setwd 所在的行中。打开 R 软件。运行修改后的 R 代码,然后 Save。
设置基因并将文件命名为 Disease.txt。打开 Venn 图 网站。在 Input 部分中,将已保存的文本内容复制并粘贴到列表中。
使用相应的数据库命名内容。,然后单击 Submit。点击 将图像另存为 PNG 并在图像下方将文本结果保存在同一文件夹中。
放置 alltargets.symbol。txt 文件和疾病。txt 文件。
打开 R 代码。将 txt 文件的存储路径复制粘贴到 setwd 所在的行中,在 R 代码中。打开 R 软件。
运行修改后的 R 代码,然后 Save。设置基因并将文件命名为 Drug_Disease.txt。打开 Venn 图 网站。
在 Input 部分中,复制并粘贴 alltargets.symbol。txt 和 Disease 的 Disease 的 Bean 的 S Ttxt 添加到列表中并命名文件。
点击 将图像另存为 PNG 在图像下方,然后将文本结果保存在同一文件夹中。打开 String 网站,然后单击 Multiple protein。单击 Browse 并上传 DrugDisease。
txt 文件。然后选择 Homo sapiens in Organisms。单击 SEARCH(搜索),然后单击 CONTINUE(继续)。
现在,单击 Settings(设置),并将所需的最低交互分数设置为最高置信度。从 Network Display 选项中,选中 Hide disconnected nodes in the network,然后单击 UPDATE>adjust the nodes in the network diagram 以便没有重叠或遮挡。单击导出,然后单击下载为高分辨率位图以获取 PNG 格式的蛋白质互通网络图,将 TSV 文件下载为简短的表格文本输出。
将 PNG 和 TSV 文件保存在一个统一的文件夹中。